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Development of novel bacterial sensor for lignin-derived aromatics

Research Project

Project/Area Number 18K14560
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 41050:Environmental agriculture-related
Research InstitutionNagaoka University of Technology

Principal Investigator

Kamimura Naofumi  長岡技術科学大学, 工学研究科, 助教 (50646528)

Project Period (FY) 2018-04-01 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Keywordsリグニン / フェルラ酸 / バニリン酸 / センサー / 樹木 / バクテリア / 蛍光タンパク質 / 転写制御 / 木片 / センサーバクテリア / 芳香族化合物
Outline of Final Research Achievements

To clarify the biodegradation behavior of lignin in the environment, bacterial sensors that can detect lignin-derived compounds were created. These sensors were constructed using Sphingobium sp. SYK-6, a model degrader of a lignin-derived compounds, and sensor plasmids with transcription regulatory system and GFP.
The ferulate and vanillate sensors responded to ferulate and vanillate greater than 500 nM and 10 μM, respectively. Based on the transcriptome profiles of SYK-6, we also constructed sensors for β-1 dimer, lignan pinoresinol, and acetovanillone.
The sensor bacteria responded not only to liquid samples but also to rotting wood chips. Therefore, these sensors are applicable for the analysis of degradation of lignin in various environmental samples.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

リグニンは「真菌等による低分子化分解」と「生成した芳香族化合物のバクテリアによる代謝」を経て無機化されるが、環境中での実態は未だ明らかにされていない。本研究で作出したセンサーバクテリアは、液体試料を標的としたセンサーとは異なり木片といった固体試料にも適用ができたことから、土壌環境分析にとどまらず、樹木の腐朽を動的かつ部位特異的に解析する新たなツールになり得ると期待される。
バニリン酸はポリマー原料としても有望であり、バニリン酸センサーを応用することによりリグニンからのバニリン酸生産能を高めた変異体の作出がハイスループット化され、低炭素社会の構築を促進できる。

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2021 2020 2019 2018 Other

All Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Presentation] フェルラ酸代謝制御系を利用したリグニン由来芳香族化合物センサー2021

    • Author(s)
      白濱 里帆、室 佳史乃、上村 直史、政井 英司
    • Organizer
      第65回リグニン討論会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] フェルラ酸を検出するバクテリアセンサー2020

    • Author(s)
      白濱里帆, 室佳史乃, 上村直史, 政井英司
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] リグニン由来芳香族化合物を検出するバクテリアセンサー2019

    • Author(s)
      室佳史乃, 白濱里帆, 上村 直史、政井 英司
    • Organizer
      環境バイオテクノロジー学会2019年度大会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] Sphingobium sp. SYK-6株におけるリグニン・ビフェニル化合物代謝系遺伝子群の転写制御システム2018

    • Author(s)
      新沼 皐、荒木 拓馬、上村 直史、政井 英司
    • Organizer
      第63回リグニン討論会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Remarks] 微生物代謝工学研究室ホームページ

    • URL

      http://bio.nagaokaut.ac.jp/~masai-l/

    • Related Report
      2018 Research-status Report

URL: 

Published: 2018-04-23   Modified: 2022-01-27  

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