Phylogeny of uncultured bacteria possessing pmoA gene and rRNA approach
| Project/Area Number |
18K14777
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
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| Research Institution | Kanazawa University |
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Principal Investigator |
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| Project Period (FY) |
2018-04-01 – 2021-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2020)
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| Budget Amount *help |
¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2020: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2019: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
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| Keywords | 16S rRNA遺伝子 / pmoA遺伝子 / メタン酸化細菌 / 遺伝子結合PCR / 機能遺伝子 / 未培養メタン酸化細菌 / バイオリアクター |
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| Outline of Final Research Achievements |
We developed an emulsion fusion PCR to link between 16S rRNA gene and functional gene. The fusion PCR was evaluated using a pure cultures experiment. And an uncultured methanotroph is discovered in forest soils as high population. We applied the developed tool to the sample and determined the phylogeny of the uncultured methanotroph.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
温室効果ガスであるメタンは地球上の至るところから発生している。一方で、メタンを温室効果ポテンシャルの低い二酸化炭素に変換する微生物（メタン酸化細菌）も地球上に数多く存在する。このメタン酸化細菌の多くは未知微生物として知られている。本研究では、これらの微生物を検出し、その生態系を解明することを目的としている。本研究の成果は、未知微生物の生態を明らかにし、地球上の未だ不明なメタン循環の理解に貢献できる。
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Report
(4 results)
Research Products
(2 results)
