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A structure biological approach toward the identification of an endogenous substrate of the insect glutathione S-transferase Nobo

Research Project

Project/Area Number 18K19163
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 38:Agricultural chemistry and related fields
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

Niwa Ryusuke  筑波大学, 生存ダイナミクス研究センター, 教授 (60507945)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2020-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2019)
Budget Amount *help
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2018: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Keywordsステロイドホルモン / 昆虫 / 酵素 / 基質 / ハイスループットスクリーニング / X線結晶構造解析 / 内在性基質 / グルタチオンS-転移酵素 / 構造生物学
Outline of Final Research Achievements

The glutathione S-transferase Noppera-bo (Nobo) has a specialized role in the biosynthesis of insect steroid hormones. In this study, using a structural biological analysis method, we proceeded with the identification of compounds that are inserted into the Nobo ligand-binding pocket, and aimed to clarify the unidentified Nobo endogenous substrate. Although the study had not completed determining the true endogenous substrate during the study period, the results combined with the search for Nobo inhibitor compounds showed that the mammalian steroid hormone 17beta-estradiol strongly interacted with the Nobo ligand-binding site. Considering the other data together, it was strongly suggested that the endogenous substrate of Nobo may be a steroid.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

昆虫ステロイドホルモンは、昆虫の脱皮や変態という多くの人々にとって身近な生命現象に深く関与する。しかし、昆虫ステロイドホルモン生合成に特異的に関わる酵素は、タンパク質としてどのような特徴を有しているのかを追究した研究は多くない。本研究は、昆虫ステロイドホルモン生合成高酵素の1つNoppera-boのタンパク質構造の解明に成功した世界ではじめての事例である。また、本研究で明らかにされた酵素活性阻害剤との複合体構造は、今後の内在性基質の同定にむけたさらな流研究だけでなく、昆虫ステロイドホルモン生合成酵素を阻害するような農薬開発にも重要な足がかりを与える。

Report

(3 results)
  • 2019 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2020 2019 2018 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] An integrated approach to unravel a crucial structural property required for the function of the insect steroidogenic Halloween protein Noppera-bo.2020

    • Author(s)
      Koiwai K, Inaba K, Morohashi K, Enya S, Arai R, Kojima H, Okabe T, Fujikawa Y, Inoue H, Yoshino R, Hirokawa T, Kato K, Fukuzawa K, Shimada-Niwa Y, Nakamura A, Yumoto F, Senda T, Niwa R.
    • Journal Title

      J Biol Chem.

      Volume: - Issue: 20 Pages: 7154-7167

    • DOI

      10.1074/jbc.ra119.011463

    • NAID

      120007165465

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 植物トリテルペノイド cucurbitacin B によるエクダイソン生合成の阻害2020

    • Author(s)
      小野 肇、豊福 美和子、藤永 大輝、稲葉 和恵、船橋 智輝、藤川 雄太、井上英史、片岡 宏誌、丹羽 隆介
    • Organizer
      第64回日本応用動物昆虫学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] ステロール代謝およびエクダイソン生合成を介した植物トリテルペノイドcucurbitacin 類がショウジョウバエの発育に及ぼす影響2020

    • Author(s)
      小野 肇、豊福 美和子、藤永 大輝、稲葉 和恵、船橋 智輝、藤川 雄太、井上英史、片岡 宏誌、丹羽 隆介
    • Organizer
      日本農薬学会第45回大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Automated X-ray crystallographical inhibitors screening against an insect embryogenesis regulator, Noppera-bo2019

    • Author(s)
      小祝 孝太郎、稲葉 和恵、湯本 史明、丹羽 隆介、山田 悠介、千田 俊哉
    • Organizer
      CBI学会2019年度大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Combined experimental and computational approaches reveal a unique structural property of the Halloween glutathione S-transferase Noppera-bo2019

    • Author(s)
      Kotaro Koiwai, Kazue Inaba, Kana Morohashi, Sora Enya, Riyo Imamura, Takayoshi Okabe, Hirotatsu Kojima, Tetsuo Nagano, Kaoru Fukazawa, Ryunosuke Yoshino, Takatsugu Hirokawa, Hideshi Inoue, Youth Fujikawa, Fumiaki Yumoto, Toshiya Senda, Ryusuke Niwa
    • Organizer
      4th International Insect Hormone Workshop
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 昆虫特異的グルタチオン S 転移酵素による発生・分化制御機構の解明2019

    • Author(s)
      小祝 孝太郎、稲葉 和恵、諸橋 香奈、塩谷 天、荒井 怜奈、藤川 雄太、井上 英史、小島 宏建、岡部 隆義、長野 哲雄、湯本 史明、千田 俊哉、丹羽 隆介
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] 新規農薬開発に向けた昆虫グルタチオン S- 転移酵素 Noppera-bo の阻害剤探索2019

    • Author(s)
      稲葉 和恵、小祝 孝太郎、今村 理世、塩谷 天、荒井 怜奈、小島 宏建、岡部 隆義、長野 哲雄、井上 英史、藤川 雄太、湯本 史明、千田 俊哉、丹羽 隆介
    • Organizer
      第19回日本蛋白質科学会年会 第71回日本細胞生物学会大会 合同年次大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] エクジソン生合成制御因子 Noppera-bo の構造生物学2018

    • Author(s)
      稲葉和恵、丹羽隆介
    • Organizer
      昆虫ポストゲノム研究会2018
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] X-ray crystallographic analysis of the ecdysteroidogenic glutathione S-transferase Noppera-bo2018

    • Author(s)
      Kazue Inaba, Kotaro Koiwai, Kana Morohashi, Sora Enya, Reina Arai, Hirotatsu Kojima, Takayoshi Okabe, Tetsuo Nagano, Hideshi Inoue, Yuuta Fujikawa, Fumiaki Yumoto, Toshiya Senda, Toshiya, Ryusuke Niwa
    • Organizer
      The 13th Japanese Drosophila Research Conference
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] 昆虫グルタチオン S- 転移酵素 Noppera-bo の構造生物学的・生化学的解析2018

    • Author(s)
      稲葉和恵、小祝孝太郎、諸橋佳奈、塩谷天、荒井怜奈、小島宏建、岡部隆義、長野哲雄、井上英史、藤川雄太、湯本史明、千田俊哉、丹羽隆介
    • Organizer
      第18回日本蛋白質科学会年会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Presentation] Do ecdysteroidogenic enzymes dream of insect growth regulators?2018

    • Author(s)
      Ryusuke Niwa
    • Organizer
      2018 Ecdysone Workshop at 59th Annual Drosophiila Research Conference
    • Related Report
      2018 Research-status Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 筑波大学 生存ダイナミクス研究センター 丹羽プロジェクト

    • URL

      https://www1.tara.tsukuba.ac.jp/projects/niwa/

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Remarks] 丹羽研究室ウェブページ

    • URL

      https://sites.google.com/view/niwa-lab-tsukuba

    • Related Report
      2018 Research-status Report

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Published: 2018-07-25   Modified: 2021-02-19  

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