Development of Fundamental Technique for 4D Chemical Nucleomics
| Project/Area Number |
18K19402
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 47:Pharmaceutical sciences and related fields
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| Research Institution | Osaka University |
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Principal Investigator |
Hori Yuichiro 大阪大学, 工学研究科, 准教授 (00444563)
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| Project Period (FY) |
2018-06-29 – 2021-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2020)
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| Budget Amount *help |
¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2019: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2018: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
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| Keywords | Chemical Nucleomics / dCas9 / TALE / PYP / Hybrid probe / ハイブリッドプローブ / ゲノム / DNA結合タンパク質 / ラベル化 / ゲノム配列 / 核酸結合色素 / Zinc finger / 4Dケミカルヌクレオミクス / ゲノム編集技術 |
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| Outline of Final Research Achievements |
In this study, we developed a technique for fluorescent detection of target DNA sequences with the aim of developing a fundamental tool for 4D nucleome analysis to visualize genome dynamics. For this purpose, we will construct a hybrid probe consisting of a DNA-binding protein used for genome editing and a synthetic nucleic acid-binding dye using our protein labeling technology. This hybrid probe was shown to have the ability to bind to the target telomeric DNA sequence and increase the fluorescence intensity.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
蛍光タンパク質を用いたDNA配列の検出技術は、バックグラウンドシグナルの大きなものであるが、本研究のハイブリッドプローブは、DNAへの結合に伴い蛍光強度が増大するため、より高精度に検出できる。DNAの高精度な検出をもとにした4Dヌクレオソーム解析は、ゲノム動態を精密に明らかにすることでき、遺伝子発現制御や疾病発症のメカニズムの解明に繋がる。この観点から、本研究では、ゲノム動態解明のための基盤ツールの開発に成功しており、生命科学や医学の発展に貢献するといえる。
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Report
(4 results)
Research Products
(12 results)
