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Development of Immunoprecipitation-qPCR to Measure Infective Viruses in Environmental Water

Research Project

Project/Area Number 18K19676
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Medium-sized Section 58:Society medicine, nursing, and related fields
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

Ihara Masaru  京都大学, 工学研究科, 特定助教 (70450202)

Project Period (FY) 2018-06-29 – 2021-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2020)
Budget Amount *help
¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Fiscal Year 2020: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
Fiscal Year 2019: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2018: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Keywordsウイルス / 下水 / 抗体 / 免疫沈降 / MS2 / ノロウイルス / qPCR / 環境水 / 濃縮法
Outline of Final Research Achievements

We aimed to develop a method for selectively concentrating a virus from sewage using an antibody. The method was developed by using bacteriophage MS2. The cultured MS2 was immunoprecipitated by adding an anti-MS2 antibody. The amount of MS2 recovered was quantified by reverse transcription (RT)-qPCR. As a result, the amount of MS2 recovered increased depending on the amount of antibody input. Anti-MS2 antibody did not precipitate bacteriophage Qβ. Furthermore, it was confirmed by the culture method that culturable MS2 could be recovered by immunoprecipitation. Then we confirmed by reverse RT-qPCR that norovirus in sewage could also be concentrated by immunoprecipitation. From these results, it was demonstrated that the infectious virus could be selectively concentrated by immunoprecipitation.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

下水でのウイルスモニタリングによる市中感染状況の把握は、市中での感染症流行抑制のための有効な方法として注目を集めているが、下水からのウイルス濃縮方法には改善の余地がある。本研究では、モデルウイルスを用いた実験によって、抗体を用いた免疫沈降によって下水中の感染性のあるウイルスを選択的に濃縮できる可能性を示すことができた。この技術は、ノロウイルスに限らず他のウイルスへも応用可能である。今後、大量の下水試料へ対応可能なスケールアップが実現できれば、下水中の様々なウイルスの選択的、高効率な濃縮の実現の可能性がある。

Report

(4 results)
  • 2020 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2019 Research-status Report
  • 2018 Research-status Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2021 2019 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Development of Immunoprecipitation-qPCR to Measure Infective Viruses in Environmental Water2021

    • Author(s)
      于再治
    • Journal Title

      2021年京都大学都市環境工学専攻 修士論文

      Volume: - Pages: 1-100

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 琵琶湖南湖におけるウイルスの長期モニタリング及び抗体によるウイルス濃縮の基礎検討2019

    • Author(s)
      于再治
    • Journal Title

      2018年度京都大学環境工学コース 特別研究

      Volume: - Pages: 1-50

    • Related Report
      2019 Research-status Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 琵琶湖南湖流域における下水中のノロウイルス遺伝子解析2019

    • Author(s)
      奥野義規、井原賢、山下尚之、田中宏明
    • Journal Title

      第53回日本水環境学会年会 要旨集

      Volume: - Pages: 366-366

    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 水中の活性ウイルスの定量を目的とした抗体によるウイルス濃縮の基礎検討2021

    • Author(s)
      于再治
    • Organizer
      第55回 日本水環境学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 顕在化する水循環系のバイオリスク対応のための技術開発2019

    • Author(s)
      田中宏明
    • Organizer
      第15回下水文化研究発表会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 琵琶湖南湖流域における下水中のノロウイルス遺伝子解析2019

    • Author(s)
      奥野義規、井原賢、山下尚之、田中宏明
    • Organizer
      第53回日本水環境学会年会
    • Related Report
      2019 Research-status Report
  • [Presentation] 琵琶湖南湖におけるウイルス濃度の長期モニタリング2019

    • Author(s)
      于再冶、白坂勇也、田村太一、林東範、端昭彦、山口武志、山下尚之、井原賢、田中宏明
    • Organizer
      第53回日本水環境学会年会
    • Related Report
      2018 Research-status Report
  • [Remarks] 井原賢研究グループHP

    • URL

      https://ihara-lab.jp/

    • Related Report
      2020 Annual Research Report

URL: 

Published: 2018-07-25   Modified: 2022-01-27  

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