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南極洞窟に優占棲息する新奇生物資源クテドノバクテリア菌株の拡充と生理特性の解析

Research Project

Project/Area Number 18KK0424
Research Category

Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

矢部 修平  東北大学, 農学研究科, 准教授 (60564838)

Project Period (FY) 2019 – 2021
Project Status Discontinued (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥15,600,000 (Direct Cost: ¥12,000,000、Indirect Cost: ¥3,600,000)
KeywordsWPS-2 / Eremiobacterota / クテドノバクテリア / 南極 / 光合成細菌
Outline of Research at the Start

近年, 創薬資源である「放線菌」に由来する新規抗菌薬の発見頻度が急減するなか, 新奇の抗生物質生成菌群「クテドノバクテリア(綱)」が発見された。この分類群は最近まで未培養菌群から成る謎の系統であったが, 我々は分離技術を確立したことで培養に成功し, 本綱に多くの新しい系統を創設した。驚くことに, この菌群は共通して放線菌のような形態を示し, 新規の抗菌物質を生成するなど人類にとって有益な次世代の生物資源と成り得ることを見出した。最近, 海外共同研究者は本綱の未培養菌群が南極の火山岩堆積物に優占していることを発見した。本共同研究ではそれら未培養菌群を分離・分類してこの有益な生物資源の拡充に挑む。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、南極のエレバス火山にある氷の洞窟からクロロフレクサス門クテドノバクテリア綱に属する細菌を分離することを目的とした。これまでにその氷穴の噴気孔付近に優占生息するクロロフレクサス門の姉妹系統「新門候補WPS-2」に属する細菌の分離に成功した。このメンバーは、南極の荒廃土壌、北極の永久凍土や火山性土壌に豊富に存在し、そのような「極限環境」の炭素循環において重要な役割を果たしていると考えられている。しかし、未培養細菌門であったため、その代謝、生理、細胞構造、生態機能は未解明であった。
昨年度は、主にこの分離株のゲノムの特徴を明らかとした。その結果、既知の光合成生物とは系統的に異なる光化学系Ⅱ型反応中心やバクテリオクロロフィル(BCh)生合成の遺伝子セットがコードされ、炭酸固定経路としてIE型 RuBisCOを含むカルビン・ベンソン回路が完備されていることを明らかとした。また、微量ガスをエネルギー源とした炭酸固定の駆動に関わるhyy遺伝子がコードされ、大気化学合成能のポテンシャルが明らかとなった。
今年度は、主に培養実験に基づいて本系統の生活様式を解明した。その結果、この系統は、生育に高濃度のCO2を要求し、有機物を含む好気条件下において光照射により増殖やBCh生産が促進されることが示された。また明暗条件ともにCO2固定能を示した。以上から、本系統は炭酸固定能を有する混合栄養的な好気性酸素非発生型光合成細菌(AAnP)であることを証明した。興味深いことに、多くの光合成細菌は青色光に対して負の走光性を示すが、この系統は青色(470nm付近)、緑色(527nm)、赤色(624nm)の幅広い波長に対してIV型線毛による正の走光性を示した。

Report

(3 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Research-status Report
  • 2019 Research-status Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2021 2019

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Oregon Health & Science University(米国)2019

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] Reticulibacter mediterranei gen. nov., sp. nov., within the new family Reticulibacteraceae fam. nov., and Ktedonospora formicarum gen. nov., sp. nov., Ktedonobacter robiniae sp. nov., Dictyobacter formicarum sp. nov. and Dictyobacter arantiisoli sp. nov., belonging to the class Ktedonobacteria2021

    • Author(s)
      Yabe Shuhei、Zheng Yu、Wang Chiung-mei、Sakai Yasuteru、Abe Keietsu、Yokota Akira、Donadio Stefano、Cavaletti Linda、Monciardini Paolo
    • Journal Title

      International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology

      Volume: 71 Issue: 7

    • DOI

      10.1099/ijsem.0.004883

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High cellulolytic potential of the Ktedonobacteria lineage revealed by genome-wide analysis of CAZymes2021

    • Author(s)
      Zheng Yu、Maruoka Mayumi、Nanatani Kei、Hidaka Masafumi、Abe Naoki、Kaneko Jun、Sakai Yasuteru、Abe Keietsu、Yokota Akira、Yabe Shuhei
    • Journal Title

      Journal of Bioscience and Bioengineering

      Volume: in press Issue: 6 Pages: 622-630

    • DOI

      10.1016/j.jbiosc.2021.01.008

    • Related Report
      2020 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 「天狗の麦飯」から分離されたクテドノバクテリア(Dictyobacter alpinus Uno16)からの抗菌化合物の探索2021

    • Author(s)
      齋藤 彩菜、 白石 太郎、 葛山 智久、 新谷 尚弘、 工藤 雄大、 山下 まり、 阿部 敬悦、 横田 明、矢部 修平
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会
    • Related Report
      2020 Research-status Report

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Published: 2019-02-06   Modified: 2022-12-28  

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