国際間HTLV-1ウイルス遺伝子発現の比較と病原性との関連解明
Project/Area Number |
18KK0452
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Research Category |
Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (A))
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
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Research Institution | Kumamoto University |
Principal Investigator |
MIYAZATO PAOLA 熊本大学, ヒトレトロウイルス学共同研究センター, 特任助教 (90573105)
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Project Period (FY) |
2019
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Project Status |
Discontinued (Fiscal Year 2019)
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Budget Amount *help |
¥15,600,000 (Direct Cost: ¥12,000,000、Indirect Cost: ¥3,600,000)
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Keywords | HTLV-1感染症 / ATL / 次世代シークエンス / Transcriptome / RNAseq / DNA-seq / RNA-seq |
Outline of Annual Research Achievements |
HTLV-1感染患者は九州・沖縄地方で多く認められるが、日本以外にも感染者流行地が存在する。感染流行地が異なるとHTLV-1関連疾患の種類も異なる事が知られている。本研究課題では、海外流行地域(アルゼンチン、オーストラリア)において異なる臨床像を示すHTLV-1感染患者検体を用いて地域性などの環境因子を含む、病原性や疾患指向性の違いを生むメカニズムについて解析した。 我々が以前に確立したサンプル濃縮法は、98名の日本人HTLV-1患者から分離された臨床サンプルのプロウイルス配列と組み込み部位の同時同定に有用であることを今回の解析により示し、Cell Reports誌に報告した。また、本解析手法はアルゼンチンの感染患者サンプルにも適用可能であった。 HTLV-1遺伝子の発現調節に着目し、HTLV-1 RNAの転写後調節におけるZAPタンパク質の役割を調べた。Capped RNAのRNAseq であるCAGEを行った結果、HTLV-1トランスクリプトの分解が考えられた。ZAPがCG コンテンツの高いRNA転写物を認識し、分解を誘導することはこれまで報告されているが、実際、HTLV-1でも高いCG コンテンツが認められた。また、感染細胞株にZAPをターゲットにした siRNAを導入すると、ZAPの発現低下と共にHTLV-1 p19タンパク質が上清中に増加した。一方で、ZAPの強制発現実験ではp19の減少が観察された。これらの研究成果はRetrovirology誌に報告した。 HTLV-1の宿主ゲノムへの組み込みが、非感染細胞では見られない転写産物の新規発現を引き起こし、それが発癌に関与する可能性が考えられている。今回、30症例中19症例でセンス鎖とアンチセンス鎖でウイルス-宿主のキメラ転写産物を検出した。また、臨床サンプルを用いたシングルセルレベルでのRNAseqも行った。
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Report
(1 results)
Research Products
(21 results)
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[Journal Article] The Nature of the HTLV-1 Provirus in Naturally Infected Individuals Analyzed by the Viral DNA-Capture-Seq Approach2019
Author(s)
Katsuya H, Islam S, Tan, Ito J, Miyazato P, Matsuo, Inada Y, Iwase, Uchiyama Yoshikazu、Hata Hiroyuki、Sato T, Yagishita N, Araya N, Ueno T, Nosaka K, Tokunaga M, Yamagishi M, Watanabe T, Uchimaru K, Fujisawa J-i, Utsunomiya A, Yamano Y, Satou Y
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Journal Title
Cell Reports
Volume: 29
Issue: 3
Pages: 724-735
DOI
Related Report
Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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[Presentation] The presence and possible role of virus-host chimeric transcripts in adult T-cell leukemia-lymphoma.2019
Author(s)
Katsuya H, Miyazato P, Islam SM, Tan BJY, Inada Y, Matsuo M, Ueno T, Tokunaga M, Hata H, Yamagishi M, Fujisawa J, Watanabe T, Uchimaru K, Utsunomiya A, Kimura S and Satou Y
Organizer
62nd Annual Meeting of the American Society of Hematology
Related Report
Int'l Joint Research
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[Presentation] The presence and possible role of virus-host chimeric transcripts in adult T-cell leukemia-lymphoma.2019
Author(s)
Katsuya H, Miyazato P, Islam S, Tan B, Inada Y, Matsuo M, Ueno T, Tokunaga M, Hata H, Yamagishi M, Fujisawa J, Watanabe T, Uchimaru K, Utsunomiya A, Kimura S, Satou Y.
Organizer
81st Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology
Related Report
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[Presentation] The nature of HTLV-1 provirus in naturally infected individuals analyzed by the viral DNA-capture-seq approach2019
Author(s)
Islam S, Katsuya H, Tan BJY, Ito J, Miyazato P, Matsuo M, Inada Y, Iwase S, Uchiyama Y, Hata H, Sato T, Yagishita N, Araya N, Ueno T, Nosaka K, Tokunaga M, Yamagishi M, Watanabe T, Uchimaru K, Fujisawa J, Utsunomiya A, Yamano Y, Satou Y
Organizer
The 56th Annual Meeting of the Japanese Society of Virology Kyushu and the 72nd Annual Meeting of the Japanese Society of Bacteria Kyushu
Related Report
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[Presentation] The nature of HTLV-1 provirus in naturally infected individuals analyzed by the viral DNA-capture-seq approach2019
Author(s)
Islam S, Katsuya H, Tan BJY, Ito J, Miyazato P, Matsuo M, Inada Y, Iwase S, Uchiyama Y, Hata H, Sato T, Yagishita N, Araya N, Ueno T, Nosaka K, Tokunaga M, Yamagishi M, Watanabe T, Uchimaru K, Fujisawa J, Utsunomiya A, Yamano Y, Satou Y
Organizer
19th International Conference on Human Retrovirology
Related Report
Int'l Joint Research
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