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低分子マイクロアレイを用いた蛋白質機能モジュレーターの探索と創成

Research Project

Project/Area Number 19021005
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

叶 直樹  Tohoku University, 大学院・薬学研究科, 准教授 (40317293)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 清水 史郎  独立行政法人理化学研究所, 長田抗生物質研究室, 専任研究員 (30312268)
近藤 恭光  独立行政法人理化学研究所, 長田抗生物質研究室, 先任研究員 (80333342)
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥4,600,000 (Direct Cost: ¥4,600,000)
Fiscal Year 2008: ¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Keywords低分子マイクロアレイ / 低分子アフィニティービーズ / リガンドスクリーニング / 蛋白質機能モジュレーター
Research Abstract

微生物化学研究会(微化研)との共同研究として、微化研が所有する約2,000種の小分子を固定化した小分子アレイ(微化研ライブラリーアレイ)を作成した。微化研の小分子ライブラリーには、50種類以上のブレオマイシン(BLM)類縁体が含まれていることを利用して、放線菌Streptoalloteichus hindustanus由来のBLM結合蛋白質であるShBleとBLMとの構造-結合活性相関を微化研ライブラリーアレイを用いて解析した。モデル動物を用いた実験から、ShBleはBLMが抗がん剤として投与された時の副作用である肺線維症を軽減する作用を持つことが明らかにされているため、ShBleとBLM類との相互作用を十分理解することは低毒性かつ薬効の高い新たなBLM類縁体の創成に役立つと考えられた。微化研ライブラリーアレイとShBle-RFPを用いた結合実験の結果、ShBleとBLMとの結合にはBLM構造中のビスチアゾール部分が必須であるが、グルオースとマンノースからなる2糖部分は必須ではないこと、また、BLM中のピリミジルプロピオンアミドのアミド部分や、ビスチアゾールから伸びた長鎖ポリアミン部分がShBleとの結合を補強していることも強く示唆された。これらの結果はITC(等温滴定カロリメトリー)を用いた熱力学的パラメータ測定や、共同研究で得られた共結晶構造からも支持された。特にこれらの構造の重要性を定量的に論じることは単独の結晶構造やNMR解析からでは難しいため、改めて小分子アレイプラットフォームを起点とした構造-結合活性相間の有用性を示す結果が得られた。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2009 2008 2007

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (7 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Structure-affinity relationship study of bleomycins and Shble protein by use of a chemical array2009

    • Author(s)
      Isao Miyazaki
    • Journal Title

      ChemBioChem 10

      Pages: 845-852

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The identification of an osteoclastogenesis inhibitor through the inhibi-tion of glyoxalase I2008

    • Author(s)
      Makoto Kawatani
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Scineces of the United States of America 105

      Pages: 11691-11696

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Total Synthesis of Methyl Sarcophytoate2007

    • Author(s)
      Takahiro Ichige
    • Journal Title

      Journal of the American Chemical Society 129

      Pages: 9862-9863

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Synthesis of an Enantiomeric DNA Oligomer and Its T-Hg(II)-T Base-Pair Formation2007

    • Author(s)
      Kaichiro Haruta
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series

      Pages: 187-188

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 生理活性物質の固相単体への官能基非選択的導入法は化学遺伝学研究のパラダイムシフトとなり得るか?2008

    • Author(s)
      叶 直樹
    • Organizer
      日本薬学会第128年会一般シンポジウム
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2008-03-28
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] SPRイメージング法を用いたp38 MAP kinaseとp62の結合部位の同定2008

    • Author(s)
      齊藤 安貴子
    • Organizer
      日本農芸化学会2008年度大会
    • Place of Presentation
      名城大学天白キャンパス(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2008-03-27
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 生理活性物質の固相単体への官能基非選択的導入法は化学遺伝学研究のパラダイムシフトとなり得るか?2008

    • Author(s)
      叶 直樹
    • Organizer
      第4回理研ケミカルバイオロジーシンポジウム
    • Place of Presentation
      熱海金城館(静岡県熱海市)
    • Year and Date
      2008-02-07
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] The identification of a novel inhibitor of osteoclastogenesis that acts via inhibition of glyoxalase I2007

    • Author(s)
      川谷 誠
    • Organizer
      AACR-NCI-EORTC International Conference on Molecular Targets and Cancer Therapeutics
    • Place of Presentation
      Moscone Convention Center West, San Francisco, CA
    • Year and Date
      2007-10-22
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of A Photo-Cross-Linked Natural Product Microarray Platform for Screening Lysate of Human Cells2007

    • Author(s)
      宮崎 功
    • Organizer
      The 2nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • Place of Presentation
      早稲田大学早稲田キャンパス(東京都新宿区)
    • Year and Date
      2007-09-06
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛋白質-低分子間相互作用検出法の開発2007

    • Author(s)
      叶 直樹
    • Organizer
      日本薬学会東北支部学術講演会
    • Place of Presentation
      東北薬科大学(宮城県仙台市)
    • Year and Date
      2007-05-19
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      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 低分子リガンドの網羅的スクリーニングを目指したSPRイメージングの高感度化2007

    • Author(s)
      高山 浩
    • Organizer
      第2回ケミカルバイオロジー研究会年会
    • Place of Presentation
      京都大学時計台記念(京都府京都市)
    • Year and Date
      2007-05-10
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] マイクロアレイ・バイオチップの最新技術2007

    • Author(s)
      清水史郎
    • Total Pages
      305
    • Publisher
      シーエムシー出版
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] 分子間相互作用解析ハンドブック(光親和型低分子マイクロアレイを用いた低分子-蛋白質相互作用の検出)2007

    • Author(s)
      齊藤安貴子
    • Total Pages
      287
    • Publisher
      (株)羊土社
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

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