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テロメアDNAを利用したカリウムイオンの蛍光イメージング試薬の開発

Research Project

Project/Area Number 19021037
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionKyushu Institute of Technology

Principal Investigator

竹中 繁織  Kyushu Institute of Technology, 工学研究院, 教授 (60188208)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥5,100,000 (Direct Cost: ¥5,100,000)
Fiscal Year 2008: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,600,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
Keywordsヒトテロメア配列 / オリゴヌクレオチド / カリウムイオン / エキシマー発光 / ハイブリット型4本鎖構造 / トロンビンアプタマー / FRET / ペプチドーオリゴヌクレオチドコンジュゲート / ピレン
Research Abstract

ヒトテロメアDNA配列を有するオリゴヌクレオチドの両置換基末端にピレンを導入したPSO4を用いて、K^+添加に伴うゲル電気泳動、吸収、円二色性、蛍光、蛍光偏光スペクトル変化等の解析によってヒトテロメアDNAの4本鎖構造(最近になってbasket、chahr、propeller、hybrid I、hybrid II型の五つ)のうちchair型の時だけ効果的なFRETが見られると予測された。そこで前年度はG-リッチオリゴヌクレオチドにトロンビン結合アプタマー(TBA)配列を導入することによってより高いFRET効率を示すPSO2の合成に成功した。しかし、細胞内へ導入すると導入された細胞の73%が細胞死を起こすことが明らかとなった。これは、TBA配列が核内に存在するヌクレオリンタンパクが結合したためと考えられた。そこで当該年度では二つのFRET色素に加えビオチンを導入したPSO5を合成した。これをストレプトアビジンと結合させ同様に細胞へ導入することによって細胞毒性を軽減することに成功した。PSO5をアビジンに結合させることによってヌクレオリンの相互作用が阻害されたものと考えられたが、このような条件によってもPSO5の核への移行が観察されたが、一部は細胞質に留まっていることがわかった。そこで細胞内のK^+濃度を減少させることが知られているAmphotericin Bの添加に伴う蛍光変化を調べた。その結果核内のK^+濃度の上昇がみちれた。これは、核内のK^+をモニターできた最初の例と見られる。しかしながら、PSO5の合成収率は低く、また、精製も困難であった。そこで、ペプチド-オリゴヌクレオチドコンジュゲートを利用してPSO6の設計を行い、その合成に成功した。予備的検討では、PSO5よりも感度良くK^+濃度の蛍光イメージングが可能なことが明らかとなった。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2008 2007

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Interaction of potassium ion with oligonucleotide carrying human telomeric sequence and pyrene moieties at both termini2008

    • Author(s)
      H. Hayashida, J. Paczesny, B. Juskowiak, S. Takenaka
    • Journal Title

      Bioorganic & Medicinal Chemistry 16

      Pages: 9871-9881

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sequence-dependent DNA deformability studied using molecular dynamics simulations2007

    • Author(s)
      Satoshi F, Kono H, Takenaka S, Go N, Sarai A
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research 35

      Pages: 6063-6074

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Fluorometric visualization of potassium ion in biological system by using quadraplex DNA probe carrying pyrene moieties(招待講演)2007

    • Author(s)
      Shigeori Takenaka
    • Organizer
      4th International Symposium on Innovative Bio. Physio Sensor Technology
    • Place of Presentation
      JEJU Oriental Hotel (Korea)
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Study on the interaction of potassium ion with Synthetic human telomere DNA carrying pyrene moieties at both termini2007

    • Author(s)
      Hirohisa Hayashida, Shigeori Takenaka
    • Organizer
      The 2nd International Workshop on Approaches to Single-Cell Analysis
    • Place of Presentation
      早稲田大学国際会議場
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Probing approach to realize the fluorometric visualization reagent of potassium ion in the living cell2007

    • Author(s)
      Shigeori Takenaka
    • Organizer
      1st Japanese-Swiss Symposium on Chemical Biology
    • Place of Presentation
      Swiss Federal Institute of Technology (EPFL) (Lausanne-Switzerland)
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

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