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ウシ心筋ミトコンドリア電子伝達系に存在する膜蛋白質会合体の構造研究

Research Project

Project/Area Number 19036010
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionKyoto Institute of Technology

Principal Investigator

原田 繁春  Kyoto Institute of Technology, 工芸科学研究科, 教授 (80156504)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 亀井 加恵子  京都工芸繊維大学, 工芸科学研究科, 准教授 (00214544)
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥6,600,000 (Direct Cost: ¥6,600,000)
Fiscal Year 2008: ¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Keywords生物物理 / 酵素 / 生体分子 / 蛋白質 / ミトコンドリア電子伝達系 / 超分子複合体 / 結晶化
Research Abstract

ミトコンドリア内膜中では好気的呼吸鎖の中心をなす膜蛋白質、複合体I、II、III、IVが会合して効率的な電子伝達が行なわれている。本研究では、これら超分子会合体のX線解析を行ない、立体構造から電子伝達機構を原子レベルで解明するために、結晶化に適したサンプルの調製と結晶化条件のスクリーニングを行った。界面活性剤を使って可溶化後、超遠心で得られた上清をBN-PAGEで分析したところ、ドデシルマルトシドやデシルマルトシドで、I_1III_2IV_1やI_1III_2超分子会合体を可溶化することができた。次に、BN-PAGEでは結晶化条件のスクリーニングに必要な大量のサンプルを得ることが困難なので、分画分子量が100万の限外ろ過膜、硫安分画、ショ糖密度勾配超遠心、ゲルろ過による大量精製を試みた。しかし、可溶化しただけの場合は比較的安定であるのに、精製によって、特にI_1III_2IV_1超分子会合体は数日で解離してしまった。これは、ミトコンドリア内膜の脂質が超分子会合体の安定性に関わっており、精製によってそれが失われたことで不安定になってしまったからと考えられる。次に、I_1III_2IV_1よりも安定性が高いI_1III_2超分子会合体の結晶化条件のスクリーニングを行った。その結果、結晶と思われるものがポリエチレングリコール400を沈澱剤に使った時に得られた。結晶化中にも超分子会合体の解離が徐々に進んでいるので、I_1III_2超分子会合体の結晶であるかどうかの確認が今後必要である。本研究で、I_1III_2超分子会合体は結晶化に必要な量のサンプルを調製でき、結晶と思われるものが得られることが分かった。しかし、会合体が徐々に解離していくという問題点も明らかになった。今後、この問題点を解決するために、例えば、脂質を共存させることでI_1III_2超分子会合体が解離しない条件を見出し、結晶化を行なっていく。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2008 2007

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Screening of detergents for solubilization, purification and crystalli zation of membrane proteins : a case study on succinate : ubiquinone oxid oreductase from Escherichia coli2008

    • Author(s)
      Hironari Shimizu
    • Journal Title

      Acta Cryst F64

      Pages: 858-862

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structures of Trypanosome cruzi Dihydroorotate Dehydrogenase Complexed with Substrates and Products : Atomic Resolution Insights into Mechanisms of Dihydroorotate Oxidation and Fumarate Reduction2008

    • Author(s)
      Daniel Ken Inaoka
    • Journal Title

      Biochemistry 47

      Pages: 10881-10891

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Crystallization and preliminary X-ray analysis of L-methionine y-lyase 1 from Entamoeba histolytica2008

    • Author(s)
      Dan Sato
    • Journal Title

      Acta Cryst F64

      Pages: 697-699

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Simple Colorimetric Inhibition Assay of Heme Crystallization for High-Throughput Screening of Antimalarial Compounds2007

    • Author(s)
      Nguyen, Tien Huy
    • Journal Title

      Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Jpn 51

      Pages: 350-353

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Alchohols induce beta-hematin formation via the dissociation of aggregated heme and reduction in interfacial tension of the solution2007

    • Author(s)
      Nguyen, Tien Huy
    • Journal Title

      Actq Tropica 101

      Pages: 130-138

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 核酸およびレドックス調節パスウェイを標的とする抗トリパノソーマ薬の開発-回虫およびブタミトコンドリア呼吸鎖複合体IIをモデル蛋白質とした特異的阻害剤の開発-2008

    • Author(s)
      原田繁春
    • Organizer
      第7回分子寄生虫・マラリア研究フォーラム
    • Place of Presentation
      松山
    • Year and Date
      2008-10-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Crystallization and X-ray structure analysis of Complex II from adult Ascaris suum mitochondria2008

    • Author(s)
      原田繁春
    • Organizer
      XXI Congress of the International Union of Crystallographi
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2008-08-28
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] ブタおよび回虫成虫ミトコンドリア複合体IIに対する阻害剤の結合様式2008

    • Author(s)
      原田繁春
    • Organizer
      第8回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-06-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 回虫 (Ascaris suum) 成虫ミトコンドリア複合体IIの結晶構造解析2007

    • Author(s)
      清水洋成
    • Organizer
      第6回分子寄生虫・マラリア研究フォーラム
    • Place of Presentation
      松山
    • Year and Date
      2007-10-27
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Crystal structure analysis of Ascaris suum adult mitochondrial Complex II2007

    • Author(s)
      H., Shimizu
    • Organizer
      The 2nd international Symposium on Diffraction Structure Biology 2007
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-09-11
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 回虫 (Ascaris suum) 成虫ミトコンドリア複合体IIの結晶構造解析2007

    • Author(s)
      清水洋成
    • Organizer
      第7回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2007-05-24
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

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