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電子スピンで探るモーターたんぱく質の分子ゆらぎ

Research Project

Project/Area Number 19037016
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

荒田 敏昭  Osaka University, 大学院・理学研究科, 准教授 (70151165)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥3,700,000 (Direct Cost: ¥3,700,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Keywords電子スピン共鳴 / スピンラベル / キネシン / トロポミオシン / アクチン / カルシウム制御 / 時計蛋白質 / 概日リズム
Research Abstract

1) 筋肉のカルシウム制御を理解するため、アクチンCys374のスピンラベルとトロポミオシンの部位特異的スピンラベル(Cys13)との距離をESR測定した。スピン相互作用のないと考えられる6個のアクチンスピンラベルと1個のトロポミオシンスピンラベルを補正した。今年度は、精度をあげるため、トロポミオシンへは、15N同位体置換したスピンラベルを用いた。核スピン量子数が1/2であるため吸収線の数が2個となり、通常のラベルの吸収線3個と区別でき、ESRスペクトルの補正が容易になった。改良した実験でも、カルシウム非存在下では、12A成分と>25A成分が共存していた。さらに、カルシウム存在下では、距離は>25Aと見積もられた。したがって、カルシウム非存在下ではトロポミオシンのN末付近はアクチンのCys374近くにあり揺らいでいる。一方、カルシウム存在下では、トロポミオシンのN末付近はアクチンのCys374から離れていることが示された。ミオシン結合部位が、アクチンのCys374付近にあることを考えると、この結果は「トロポミオシンの立体障害仮説」を支持している。
2) 微小管軌道の運動タンパク質キネシンの動的構造をSDSL-ESR解析した。今年度は、キネシンダイマーの2つのネックリンカーにスピンラベルし、スピン間の距離を測定したデータを解析し論文として出版した。ネックリンカーが伸縮することを明らがにし、この伸縮が歩行運動に関与する説を支持した。
3) シアノバクテリア時計モーターKaiCのサブユニット間動的構造をSDSL-ESR解析した。KaiCのサブユニット接触面の2つのスピンラベルは6量体化することで11Aに接近し、KaiA、Bと相互作用させると12Aに増加した。今年度は、KaiA-Kaic接触面はどこかをスピンラベル-スキャニシグして探索した。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (42 results)

All 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (32 results) Book (2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Nucleotide-induced flexibility change in neck linkers of dimeric kinesin as detected by distance measurements using spin-labeling EPR2009

    • Author(s)
      K. Sugata
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 386

      Pages: 626-636

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    • Author(s)
      J. Sagara
    • Journal Title

      PLos ONE 4

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    • Author(s)
      Yamada, MD
    • Journal Title

      Biochem. Biophys. Res. Commun. 364

      Pages: 620-626

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  • [Journal Article] Degradation of DNA into 5'-Monodeoxyribonucleotides in the Presence of Mn^<2+>2007

    • Author(s)
      Maeda, H
    • Journal Title

      Ions. Biosci. Biotechnol. Biochem. 71

      Pages: 2670-2679

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    • Author(s)
      Arata T
    • Journal Title

      Adv. Exp. Med. Biol. 592

      Pages: 125-135

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      Kamada K
    • Journal Title

      Nat Struct Mol Biol 14

      Pages: 388-396

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      New London, NH, USA
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      T. Arata
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      Cairns, Australia
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      T. Arata
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      Fukuoka
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    • Author(s)
      荒田敏昭
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      第47回電子スピンサイエンス学会年会
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    • Author(s)
      T. Arata
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      University of Tokyo
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      2^<nd> International Symposium on Bio-nanosystems
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      University of Tokyo
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      K. Ueda
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      Nagoya University
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  • [Presentation] SDSL-ESRによる骨格筋アクチン-トロポミオシン間の距離解析2008

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      植田啓介
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      第46回日本生物物理学会年会
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      植田啓介
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      第81回日本生化学会大会
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      S. Yasuda
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      M, Yamada
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      T, Arata
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      MD, Yamada
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      San Francisco, CA, USA
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      植田啓介
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      M., Yamada
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      荒田敏昭
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      N, Kuwabara
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      横浜
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  • [Book] 分子細胞生物学辞典(第2版)6項目2008

    • Author(s)
      荒田敏昭
    • Publisher
      東京化学同人
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    • Author(s)
      荒田敏昭
    • Publisher
      羊土社
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  • [Remarks]

    • URL

      http://www.bio.sci.osalca-u.ac.jp/~arata

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  • [Remarks]

    • URL

      http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/~arata

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      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

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