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X線をもちいた核ゲノム構造の解析

Research Project

Project/Area Number 19038026
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

前島 一博  The Institute of Physical and Chemical Research, 今本細胞核機能研究室, 専任研究員 (00392118)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥8,300,000 (Direct Cost: ¥8,300,000)
Fiscal Year 2008: ¥4,200,000 (Direct Cost: ¥4,200,000)
Fiscal Year 2007: ¥4,100,000 (Direct Cost: ¥4,100,000)
Keywords分裂期染色体 / ヒトゲノム / 電子顕微鏡 / 染色体 / X線 / 構造
Research Abstract

染色体は細胞が分裂する際、複製された遺伝情報(DNA)を2つの娘細胞に正確に分配するために必須な構造体である。それでは、分裂期染色体はどのようにして1本の長いクロマチン繊維から折り畳まれているのだろうか? 直径2nmのゲノムDNAはまず、塩基性蛋白質のヒストンに巻かれて、ヌクレオソームと呼ばれる直径約11nmの構造体になる。このヌクレオソームが折り畳まれて直径約30nmのクロマチン繊維になり、さらに折り畳まれて直径約0.7μmの分裂期染色体を作るとされている。その凝縮過程は全くの謎であり、長年に渡って生物学者たちの興味を集めてきた。古くから提唱されているモデルでは、「30nmのクロマチン繊維が、100nm、200-250nmと、らせん状の階層構造を形成しているのではないか」と予想している。この問いに答えるため、私たちは、ドイツEMBLグループと共同で、分裂期染色体のクライオ電子顕微鏡観察(CEMOVIS)をおこなった。CEMOVISは,「生きた」状態に近い細胞内微小構造を観察するためのほとんど唯一の手段である。すると驚いたことに、ヌクレオソームの直径に相当する11nmより大きな構造は、30nmクロマチン繊維も含めて検出されなかった。しかしながら、顕微鏡観察は試料中における観察範囲が限定され、内在する規則性構造の全体像を捉えることが非常に困難である。このため、私たちはSpring-8 BL45XUでX線小角散乱解析(SAXS)をおこなっている。SAXSは、計測したい非結晶試料にX線を照射し、その散乱パターンからその試料に内在する構造や規則性を知る手段である。SAXSをもちいても同様な結果が得られている。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2009 2008

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Three-Dimensional Visualization of a Human Chromosome Using Coherent X-ray Diffraction2009

    • Author(s)
      Nishino, Y.
    • Journal Title

      Physical Review Letters 102

      Pages: 18101-18101

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis of cryo-electron microscopy images does not support the existence of 30-nm chromatin fibers in mitotic chromosomes in situ.2008

    • Author(s)
      Eltsov, M.
    • Journal Title

      Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105

      Pages: 19732-7

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ion irradiation in liquid of μm3 region for cell surgery.2008

    • Author(s)
      Iwai,Y.
    • Journal Title

      Applied Physics Letters 92

      Pages: 23509-23509

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Packaging the genome: the structure of mitotic chromosomes2008

    • Author(s)
      Maeshima, K.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry 143

      Pages: 145-153

    • NAID

      10024907806

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Importhn-beta and small GTPase Ran mediate chromosome loading of human chromokinesin Kid2008

    • Author(s)
      Tahara, K.
    • Journal Title

      Journal of Cell Biology 180

      Pages: 493-596

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Ion irradiation in liquid ofμm3 region for cell surgery.2008

    • Author(s)
      Iwai, Y.
    • Journal Title

      Applied Physics Letters 92

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Mitotic chromosome structure: irregular folding of nucleosome fiber.2008

    • Author(s)
      Maeshima, K.
    • Organizer
      International Symposium on Chromosome Dynamics
    • Place of Presentation
      Ise, Japan
    • Related Report
      2008 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

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