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植物における亜鉛に応答した細胞内膜輸送系のプロテオーム解析

Research Project

Project/Area Number 19039022
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

深尾 陽一朗  Nara Institute of Science and Technology, バイオサイエンス研究科, 特任助教 (80432590)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥6,000,000 (Direct Cost: ¥6,000,000)
Fiscal Year 2008: ¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Keywords亜鉛 / 鉄 / iTRAQ解析 / IRT1 / V-ATPase / シロイヌナズナ / 細胞内膜糸 / プロテオーム解析 / 二次元電気泳動 / 膜タンパク質
Research Abstract

亜鉛濃度に応じて変動するタンパク質群を同定するために、LC-MSを用いたiTRAQ解析系を確立した。本実験にはシロイヌナズナ野生型Col-0を用いた。Col-0はMS培地に300μM亜鉛が含まれるときに、地上部のクロロシスや根の伸長阻害といった顕著な成育阻害を示すため、この条件を過剰量亜鉛培地とした。コントロールとして用いたMS培地、または過剰量亜鉛培地で10日間成育したCol-0の根よりそれぞれマイクロソーム画分を単離し、過剰量亜鉛に応答するタンパク質群の定量解析に用いた。この結果、輸送体などの膜タンパク質を含む1000以上のタンパク質について定量結果が得られた。このうち、まず注目したタンパク質はIRT1とFR02である。にれらタンパク質は鉄欠乏条件下において誘導され、FR02によって三価鉄から二価鉄へと還元され、二価鉄をIRT1が細胞内へと取り込む。過剰亜鉛条件において植物細胞内の鉄濃度が低下していることが予想されたため、ICP-AESにより元素分析したところ、確かに根においても地上部においても鉄濃度が優位に減少していたことから、過剰亜鉛によって鉄欠乏状態になることが示された。過剰亜鉛によるクロロシスは、鉄の添加により回復した。これはIRT1が亜鉛輸送能も有しているため、過剰な亜鉛がIRTIによる鉄吸収を阻害していると考えられる。一方、鉄添加によりクロロシスは回復したが、根の伸長はさらに阻害された。そこで次に、H^+輸送活性を持っV-ATPase複合体のサブユニットが減少していることに着目した。V-ATPase活性を測定したところ、通常の生育培地と比較して1/2程度に減少していた。これは、V-ATPase複合体を構成するCサブユニットの変異体det3の活性と一致した。さらに、根の成熟領域の細胞長を測定したところ、過剰亜鉛により細胞伸長が抑えられていること1が明らかとなり、これもdet3変異体の結果と良い相関を示した。このことから、過剰亜鉛による根の伸長阻害はV-ATPase複合体の活性低下がもたらしていると考えられる。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2010 2009 2008 2007

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] The pentatricopeptide repeat protein OTP82 is required for RNA editing of plastid ndhB and ndhG transcripts.2009

    • Author(s)
      Kenji Okuda
    • Journal Title

      Plant Journal 61

      Pages: 339-349

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of Zinc-Responsive Proteins in the Roots of Arabidopsis thaliana using a Highly Improved Method of Two-Dimensional Electrophoresis.2009

    • Author(s)
      Yoichiro Fukao
    • Journal Title

      Plant Cell Physiology 50

      Pages: 2234-2239

    • NAID

      10027345640

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Threonine at position 306 of the KAT1 potassium channel is essential for channel activity and is a target site for ABA-activated SnRK2/OST1/SnRK2.6 protein kinase.2009

    • Author(s)
      Aiko Sato
    • Journal Title

      Biochemical Journal 10

      Pages: 439-448

    • Related Report
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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Efficient operation of NAD (P) H dehydrogenase-dependent cyclic electron flow requires the supercomplex formation with photosystem I via minor LHCI in Arabidopsis.2009

    • Author(s)
      Peng Lianwei
    • Journal Title

      Plant Cell 21

      Pages: 3623-3640

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Proteome analysis of detergent-resistant membranes (DRMs) associated with OsRacl-mediated innate immunity in rice.2009

    • Author(s)
      Masayuki Fujiwara
    • Journal Title

      Plant Cell Physiology 50

      Pages: 1191-1200

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Isolation and identification of ubiquitin-related proteins from Arabidopsis seedlings.2009

    • Author(s)
      Tomoko Igawa
    • Journal Title

      Journal of Experimental Botany 60

      Pages: 3067-3073

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  • [Journal Article] The putative RNA-processing protein, THO2, is a microtubule-associated protein in tobacco.2009

    • Author(s)
      Takahiro Hamada
    • Journal Title

      Plant Cell Physiology 50

      Pages: 801-811

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  • [Journal Article] Alterations in detergent-resistant plasma membrane microdomains in Ara bidopsis thaliana during cold accumulation.2009

    • Author(s)
      Anzu Minami
    • Journal Title

      Plant Cell Physiology 50

      Pages: 798-809

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      2008 Annual Research Report
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  • [Journal Article] A novel role for oleosins in freezing tolerance of oilseeds in Arabidopsis thaliana.2008

    • Author(s)
      Takashi L.Shimada
    • Journal Title

      Plant Journal 55

      Pages: 798-809

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      2008 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Antagonistic jacalin-related lectins regulate the size of ER body-type beta-glucosidase complexes in Arabidopsis thaliana.2008

    • Author(s)
      Atsushi J.Nagano
    • Journal Title

      Plant Cell Physiology 49

      Pages: 969-980

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      2008 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Cytosolic HSP90 regulates the heat shock response that is responsible for heat acclimation in Arabidopsis thaliana.2007

    • Author(s)
      Kenji Yamada
    • Journal Title

      J. Biol. Chem. 282

      Pages: 37794-37804

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      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] iTRAQ解析を用いた過剰量亜鉛による成育阻害機構の解明2010

    • Author(s)
      深尾陽一朗
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      2010-03-19
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Shotgun proteomics of protein complexes using mass spectrometry.2009

    • Author(s)
      深尾陽一朗
    • Organizer
      5th SPNB
    • Place of Presentation
      フィレンツェ
    • Year and Date
      2009-05-27
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  • [Presentation] ショットガン解析による複合体タンパク質のハイスループット解析法2009

    • Author(s)
      深尾陽一朗
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2009-03-22
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] プロテオミクスを用いた亜鉛に応答して変動する新規細胞膜タンパク質の探索2009

    • Author(s)
      西森由佳
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2009-03-22
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] PROTEOMICS OF ZINC STRESS RESPONSE IN ARABIDOPSIS.2008

    • Author(s)
      深尾陽一朗
    • Organizer
      Proteomlux 2008
    • Place of Presentation
      ルクセンブルク
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 二次元ゲル電気泳動を利用した膜タンパク質の解析2007

    • Author(s)
      深尾陽一朗
    • Organizer
      日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2007-03-21
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

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