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発現多様性を産み出すゲノム動態を介したHIV-1発現制御機構の解析

Research Project

Project/Area Number 19041020
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

水谷 壮利  The University of Tokyo, 医科学研究所, 助教 (00376617)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 伊庭 英夫  東京大学, 医科学研究所, 教授 (60111449)
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥8,100,000 (Direct Cost: ¥8,100,000)
Fiscal Year 2008: ¥4,100,000 (Direct Cost: ¥4,100,000)
Fiscal Year 2007: ¥4,000,000 (Direct Cost: ¥4,000,000)
KeywordsHIV-1 / レトロウイルス / SWI / SNF複合体 / SNF
Research Abstract

これまでの我々の研究の結果、レトロウイルスの発現維持に重要な機能を果たすことが考えられるクロマチン構造変換因子、Brm型SWI/SNF複合体はTat非依存的なHIV-1の発現維持能にも必須であることを明らかにした。またBrmを始めとするSWI/SNF複合体構成因子はHIV-1が活発に増殖する場である末梢血由来の活性化T細胞では一過的に発現上昇がみられ、一方、潜伏感染化するとされる静止期T細胞においてはその発現量が非常に抑えられていることから、これらの発現量の違いは宿主内におけるHIV-1の発現挙動に密接に関与していることが示唆された。またBrm欠失細胞株で見られるTat非依存的なHIV-1プロモーターの発現抑制は転写が開始しているにもかかわらず, 転写伸長が効率よく進んでいないことをRT-PCRにより明らかにした。さらにRNase Protection assayの結果からほぼ60nt近傍において、その転写が停止していること明らかにした。一方、BrmはSWI/SNF複合体としてLTRに動員されることをクロマチン免疫沈降法により示し、それに伴い転写開始点直下に形成されるヌクレオソーム-1の破壊がおこり転写伸長が回復することを観察している。以上の結果からBrm型SWI/SNFはその性状からHIV-1の転写伸長時におけるヌクレオソーム-1のクロマチン構造変換を介してHIV-1の転写に寄与していることが示唆された。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All 2009 2008 2007

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Cdx2 and the Brm-type SWI/SNF complex cooperatively regurate villin expression in gastrointestinal cells2009

    • Author(s)
      Yamamichi N, Inada K, Furukawa C, Sakurai K, Tando T, Ishizaka A, Haraguchi T, Mizutani T, Fujishiro M, Shimomura. R, Oka M, Ichinose M, Tsutsumi Y, Omata M, Iba H.
    • Journal Title

      Experimental cell Reseach (in press)

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] miR-21 Gene Expression Triggered by AP-1 Is Sustained through a Double-Negative Feedback Mechanism.2008

    • Author(s)
      Fujita S, Ito T, Mizutani T, Minoguchi S, Yamamichi N, Sakurai K, Iba H.
    • Journal Title

      J Mol Biol. (In press)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Class-specific regulation of pro-inflammatory genes by MYD88 pathways and Ikappa Bzeta.2008

    • Author(s)
      Kayama H, Ramirez-Carrozzi VR, Yamamoto M, Mizutani T, Kuwata H, Iba H, Matsumoto M, Honda K, Smale ST, Takeda K.
    • Journal Title

      J Biol Chem. (In press)

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Brm transactivates the telomerase reverse transcriptase (TERT) gene and modulates the splicing patterns of its transcripts inconcert with p54(nrb).2008

    • Author(s)
      Ito T, Watanabe H, Yamamichi N, Kondo S, Tando T, Haraguchi T, Mizutani T, Sakurai K, Fujita S, Izumi T, Isobe T, Iba H.
    • Journal Title

      Biochem J. 411(1)

      Pages: 201-9

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Frequent loss of Brm expression in gastric cancer correlates with histologic features and differentiation state.2007

    • Author(s)
      Yamamichi N, Inada K, Ichinose M, Yamamichi-Nishina M, Mizutani T, Watanabe H, Shiogama K, Fujishiro M, Okazaki T, Yahagi N, Haraguchi T, Fujita S, Tsutsumi Y, Omata M, Iba H.
    • Journal Title

      Cancer. Res. 67(22)

      Pages: 10727-35

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] SiRNAs do not induce RNA-dependent transcriptional silencing of retrovirus in human cells.2007

    • Author(s)
      Haraguchi T, Mizutani T, Yamamichi N, Ito T, Minoguchi S, Iba H.
    • Journal Title

      FEBS Lett. 581(25)

      Pages: 4949-54

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Brm, a catalytic subunit of SVI/SNF complex is required for Tat-independent stable expression of HIV-12008

    • Author(s)
      水谷壮利、石坂彩、山道信毅、伊庭英夫
    • Organizer
      The 8^<th> Awaiishima International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      兵庫県淡路島夢舞台国際会議場
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] HIV-1のTat非依存的な発現を維持するSWI/SNF複合体の作用点の解析2008

    • Author(s)
      石坂彩、水谷壮利、山道信毅、原口健、富沢麻利子、岩本愛吉、伊庭英夫
    • Organizer
      第56回日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      岡山コンベンションセンター
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Brm, a catalytic subunit of SWI/SNF complex is required for Tat-independent stable expression of HIV-12007

    • Author(s)
      水谷 壮利、石坂 彩、山道信毅、伊庭英夫
    • Organizer
      The 7th Awajishima International Forum on Infection and Immunity
    • Place of Presentation
      兵庫県 淡路島夢舞台国際会議場
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] HIV-1のTat非依存的な発現におけるSWI/SNF複合体の機能解析2007

    • Author(s)
      水谷 壮利、石坂 彩、山道信毅、伊庭英夫
    • Organizer
      第55回 日本ウイルス学会学術集会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2018-03-28  

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