新規シャペロンDmp1/2の構造解析を基盤としたプロテアソームの分子集合機構
Project/Area Number |
19044018
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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Allocation Type | Single-year Grants |
Review Section |
Biological Sciences
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Research Institution | Nagoya City University (2008) Nagoya University (2007) |
Principal Investigator |
水島 恒裕 Nagoya City University, 大学院・薬学研究科, 准教授 (90362269)
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Project Period (FY) |
2007 – 2008
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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Budget Amount *help |
¥7,400,000 (Direct Cost: ¥7,400,000)
Fiscal Year 2008: ¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
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Keywords | プロテアソーム / シャペロン / Dmp1-Dmp2複合体 / 蛋白質分解 / αリング |
Research Abstract |
プロテアソームは約100個のサブユニットが分子集合することにより形成された巨大な蛋白質分解酵素複合体であり、各サブユニットが厳密に配置することで非常に高度な機能を獲得し、生体内の様々な調節を行っている。新規シャペロンDmp1-Dmp2複合体は酵母20Sプロテアソームの分子集合においてαリング形成の足場としての役割が推定されている。これまでにDmp1-Dmp2複合体およびDmp1-Dmp2-α5サブユニット複合体の立体構造を決定したことから、立体構造情報をもとにαリングの形成に関与する機構を種々の複合体形成中問状態を作製しin vitroで解析を行った。Dmp1-Dmp2複合体を含む20Sプロテアソームの中間体モデルはDmp1-Dmp2-α5サブユニット、20Sプロテアソームの結晶構造から構築した。その結果、Dmp1-Dmp2はβサブユニットの結合サイトからα5と結合しており、中間体モデルの解析からα5と同時にα4、α6サブユニットとも相互作用することが示された。さらに、Dmp1-Dmp2が結合したαリングにβサブユニットが結合した時、β4、β5、β6サブユニットの結合時にDmp1-Dmp2との間に立体障害が生じることが明らかとなった。これまでにプロテアソームの中間体の解析よりαリングにはβ2、β3、β4の順に結合することが報告されていることから、Dmp1-Dmp2はβ4の結合により解離していると考えられる。また、Dmp1-Dmp2を含めたα4、α5、α6サブユニットの複合体形成機構の解析を行うことにより、Dmp1-Dmp2の存在がαサブユニットの特異的な複合体形成に関与している可能性が示された。
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Report
(2 results)
Research Products
(13 results)
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[Journal Article] Structural basis for sorting mechanism of p62 in selective autophagy2008
Author(s)
Ichimura Y, Kumanomidou T, Sou Y, Mizushima, T, Ezaki, J, Ueno T, Kominami E, Yamane T, Tanaka K, Komatsu M
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Journal Title
J. Biol. Chem 283
Pages: 22847-22857
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[Journal Article] Crystal structure of a chaperone complex that contributes to the assembly of yeast 20S proteasomes2008
Author(s)
Yashiroda H, Mizushima T, Okamoto K, Kameyama T, Hayashi H, Kishimoto T, Niwa S, Kasahara M, Kurimoto E, Sakata E, Takagi K, Suzuki A, Hirano Y, Murata S, Kato K, Yamane T, Tanaka K
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Journal Title
Nat Struct Mol Biol. 15
Pages: 228-236
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[Journal Article] Structures and physiological roles of 13 integral lipids of bovine heart cytochrome c oxidase.2007
Author(s)
Shinzawa-Itoh K, Aoyama H, Muramoto K, Terada H, Kurauchi T, Tadehara Y, Yamasaki A, Sugimura T, Kurono S, Tsujimoto K, Mizushima T, Yamashita E, Tsukihara T, Yoshikawa S
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Journal Title
EMBO Journal 26
Pages: 17131-1725
NAID
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[Journal Article] Crystal structure of Ufcl, the Ufml-conjugating enzyme2007
Author(s)
Mizushima T, Tatsumi K, Ozakai Y, Kawakami T, Suzuki A, Ogasahara K, Komatsu M, Kominami E, Tanaka K, Yamane T
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Journal Title
Biochem Biophys Res Commun 362
Pages: 1079-1084
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