Development of statistical methodology for detecting factors of disease mechanism based on clinical omics data
| Project/Area Number |
19300100
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Statistical science
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| Research Institution | Japanese Foundation For Cancer Research |
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Principal Investigator |
MATSUURA Masaaki Japanese Foundation For Cancer Research, がんゲノム研究部, 部長 (40173794)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
EGUCHI Shinto 統計数理研究所, 数理推測研究系, 教授 (10168776)
FUJISAWA Hironori 統計数理研究所, 数理推測研究系, 準教授 (00301177)
HOSHIKAWA Yutaka 財団法人癌研究会, 癌研究所がんゲノム研究部, 研究員 (80280626)
ISOMURA Minoru 財団法人癌研究会, ゲノムセンター, 研究員 (40272497)
MIYATA Satoshi 財団法人癌研究会, ゲノムセンター, 研究員 (60360343)
USHIJIMA Masaru 財団法人癌研究会, ゲノムセンター, 研究員 (60328565)
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| Project Period (FY) |
2007 – 2008
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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| Budget Amount *help |
¥18,980,000 (Direct Cost: ¥14,600,000、Indirect Cost: ¥4,380,000)
Fiscal Year 2008: ¥8,710,000 (Direct Cost: ¥6,700,000、Indirect Cost: ¥2,010,000)
Fiscal Year 2007: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
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| Keywords | 統計数学 / ゲノム / マイクロアレイ / プロテオーム / 生体生命情報学 / 統計数単 / 遺伝子発現 / オミックスデータ / 機械学習 |
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| Research Abstract |
マイクロアレイデータと臨床情報を用いて疾患のメカニズムに関連する候補遺伝子を探索するために、生物学的情報を加味した遺伝子評価法を開発し、複数の予測モデルを組み合わせた論理和予測モデルを用いて予測性能の検証も行った。また、各患者で50万箇所以上におよぶ一塩基多型(SNP)データに対して、特定の複数SNPを組合わせた場合にのみ、表現型と関連するSNPの組を探索するための高速な統計的手法の開発に成功し、特許申請を行っ
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Report
(3 results)
Research Products
(34 results)
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[Journal Article]
Author(s)
牛嶋大, 宮田敏, 松浦正明
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Journal Title
「マイクロアレイデータ解析法」,遺伝子医学MOOK10号「DNAチップ/マイクロアレイ臨床応用の実際-基礎・最新技術、臨床・創薬応用への実際から今後の展開・問題まで-」(株式会社メディカルドゥ、東京) 2008
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