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Phylogeographic and environment adaptability study of Fagus crenata using SNPs in chloroplast genome

Research Project

Project/Area Number 19380096
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field 林学・森林工学
Research InstitutionForestry and Forest Products Research Institute

Principal Investigator

TAKAHASHI Makoto  Forestry and Forest Products Research Institute, 林木育種センター遺伝資源部, 研究室長 (90370824)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 陶山 佳久  東北大学, 農学研究科, 准教授 (60282315)
原 正利  千葉県立中央博物館, 環境科学研究科, 主席研究員 (20250144)
渡邉 敦史  森林総合研究所, 林木育種センター育種部育種第二課育種研究室, 研究室長 (10360471)
戸丸 信弘  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 教授 (50241774)
Project Period (FY) 2007 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥19,760,000 (Direct Cost: ¥15,200,000、Indirect Cost: ¥4,560,000)
Fiscal Year 2009: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2008: ¥5,200,000 (Direct Cost: ¥4,000,000、Indirect Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2007: ¥11,570,000 (Direct Cost: ¥8,900,000、Indirect Cost: ¥2,670,000)
Keywords森林生態・保護・保全 / 遺伝子撹乱 / ブナ / 葉緑体ゲノム / SNP / ハプロタイプ / 系統地理 / 遺伝子攪乱 / イヌブナ
Research Abstract

As needs of human society to forest ecosystem diversifying, planting of broad-leaved trees is now increasing. Currently, there are no rules regarding the seed transfer of broad-leaved trees. It is crucial to use appropriate planting stocks to achieve conservation of adaptive genetic variation that harbored in each of different regions, avoiding the risks of genetic disturbance. Fagus crenata as targeted species, we identified DNA polymorphisms on chloroplast genome, and developed SNP markers. 4,321 samples were collected from 698 locations covering almost whole range of F. crenata, and surveyed 18 SNPs at three regions in the large single copy region of the chloroplast genome, and determined their haplotype. We investigated relationship of chloroplast haplotypes, and constructed fine haplotype map.

Report

(4 results)
  • 2009 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (52 results)

All 2011 2010 2009 2008 2007

All Journal Article (16 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (33 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Japanese beech (Fagus crenata) plantations established from seedlings of non-native genetic lineages.2011

    • Author(s)
      Koyama, Y., 高橋誠, M., Murauchi, Y., Fukatsu, K., 渡邊, A., Tomaru, N.
    • Journal Title

      Journal of Forest Research Vol.16, In Press

    • NAID

      10030336760

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    • Journal Title

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    • Journal Title

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      Hara, M.
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      Pages: 344-347

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      110007466443

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      Pages: 24-27

    • NAID

      40016875919

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      原正利、関剛、小澤洋一、鈴木まほろ、菅野洋
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      Pages: 153-170

    • NAID

      110007522396

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      原正 利, ほか
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      植生学会誌 24

      Pages: 153-170

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      110007522396

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      陶山佳久
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      東北大学川渡共同セミナーセンター
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      第58回日本森林学会中部支部大会
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      名古屋大学(愛知県名古屋市)
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      山形大学小白川キャンパス
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      京都大学(京都府京都市)
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      渡邉次郎、小澤創、宮本尚子、高橋誠
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      第120回日本森林学会大会
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      京都大学(京都府京都市)
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      2009-03-26
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      原正利
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      高橋誠、平岡宏一、戸丸信弘
    • Organizer
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      岩手県立大学(岩手県滝沢村)
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      2009-03-19
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      高橋誠, 平岡宏一, 戸丸信弘
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      岩手県立大学(岩手県滝沢村)
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      陶山佳久
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      福島大学(福島県福島市)
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      陶山佳久
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      原正利
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      高橋, M., 原正利, M., Fujii, N., Suyama, Y., 渡邊, A., Fukatsu, E., Tomaru, N.
    • Place of Presentation
      大沼国際セミナー・ハウス(北海道七飯町)
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      2008-09-09
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      大沼国際セミナー・ハウス(北海道七飯町)
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      2008-09-09
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    • Author(s)
      Suyama, Y.
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      大沼国際セミナー・ハウス(北海道七飯町)
    • Year and Date
      2008-09-09
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      大沼国際セミナー・ハウス(北海道七飯町)
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      2008-09-09
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  • [Presentation] 長野県ブナ人工林の系統と環境適応性2007

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      小山泰弘、成瀬友季、高橋誠、渡邉敦史、戸丸信弘
    • Organizer
      第118回日本森林学会大会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2007-04-03
    • Related Report
      2009 Final Research Report
  • [Presentation] ブナ葉緑体ハプロタイプの地理的分布とハプロタイプ間の類縁関係2007

    • Author(s)
      高橋誠、原正利、小山泰弘、小谷二郎、斉藤真己、小澤創、西川浩己、陶山佳久、菅野学、渡邉敦史、武津英太郎、戸丸信弘
    • Organizer
      第118回日本森林学会大会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2007-04-03
    • Related Report
      2009 Final Research Report
  • [Presentation] ブナ葉緑体ハプロタイプの地理的分布とハプロタイプ間の類縁関係2007

    • Author(s)
      高橋 誠, ほか
    • Organizer
      第118回日本森林学会大会
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡市)
    • Year and Date
      2007-04-03
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] ブナ林再生の応用生態学((寺澤和彦・小山浩正編)ブナ集団の遺伝的変異と遺伝的構造)2008

    • Author(s)
      戸丸信弘
    • Total Pages
      310
    • Publisher
      文一総合出版
    • Related Report
      2009 Final Research Report
  • [Book] 北海道における林木育種と森林遺伝資源(北海道林木育種協会監修)(ブナ)2008

    • Author(s)
      河原孝行、高橋誠
    • Total Pages
      216
    • Related Report
      2009 Final Research Report
  • [Book] ブナ林再生の応用生態学(ブナ集団の遺伝的変異と遺伝的構造 187〜211ページ)2008

    • Author(s)
      戸丸信弘
    • Total Pages
      310
    • Publisher
      文一総合出版
    • Related Report
      2008 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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