Research Project
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
消化器癌においてジェネティックな異常に加え、DNAメチル化やヒストン修飾異常などのエピジェネティックな異常が関与する。ゲノム上の多数の遺伝子がエピジェネティックな異常を有すると考えられ、その全貌を明らかにすることは、消化器癌の診断および治療法開発の上で重要である。本研究では、ゲノム網羅的メチル化解析法と多数の検体を定量的に解析する方法の開発を目指す。Methylated CpG island amplification (MCA)法により、メチル化しているCpG islandを効率よく増幅し、大腸癌細胞株から抽出したDNAから作成したMCAアンプリコンをCy5で、正常大腸組織より抽出したDNAから作成したMCAアンプリコンをCy3でラベルし、Agilent社のwhole genome promoter arrayにハイブリダイズすることにより得られたシグナルを解析し、高メチル化している遺伝子を同定した。また、得られた結果を、ゲノムブラウザBLAT上に表示し、クロマチン免疫沈降法(ChIP on ChIP)のデータと比較することにより、DNAメチル化、ヒストンH3リジン4、リジン27のメチル化との統合解析を可能にした。DNMTあるいはDicerを遺伝学的にノックアウトした大腸癌細胞を用いて、MCA microarrayを行い、DNAメチル化およびヒストン修飾のプロファイルを作成した。本研究により開発された新しいエピゲノム法により消化器癌発生の分子機構の解明や、診断や治療の標的遺伝子の同定に有用と考えられる。
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Gastroenterol, Published on line
Oncogene (in press)
Clin Cancer Res (in press)
Int J Cancer 124
Pages: 2607-2615
J Biol Chem 284
Pages: 872-883
Methods Mol Biol 512
Pages: 55-69
Current Colorectal Cancer Reports 5
Pages: 84-89
Cancer Sci 100
Pages: 787-791
Cancer Sci. 100
Curr. Colorectal Cancer Rep. 5
Gastroenterol 136(In press)
Int J Cancer 124(In press)
Cancer Res 68
Pages: 4123-4132
Gastroenterol 135
Pages: 142-151
Pages: 2570-2575
Mol Cancer Res 6
Pages: 395-406
Cancer Sci 99
Pages: 958-966
10024006089
Carcinogenesis 29
Pages: 1312-1318
Mol Cancer Ther 7
Pages: 779-787
Int J Oncol 32
Pages: 1253-1261
J. Gastroenterol 43
Pages: 378-389
10021268741
Cancer Epidemiol Biomarkers Prev 17
Pages: 2555-2564
Pharmacogenomics 9
Pages: 1917-1928
British J Cancer 98
Pages: 1147-1156
Br. J. Haematol 142
Pages: 745-753
Cancer Res. 68
Gastroenterol. 135
Pages: 2670-2675
Care inogenes is 29
Mol. Cancer Ther. 7
Mol. Cancer Res. 6
J. Gastroenterol. 43
Br. J. Cancer 98
Cancer Sci. 99
Cancer Epidemiol. Biomarker. Prev. 17
Mol Cancer Res. 6
Brit J. Cancer 98
Carcinogenesis 29(In press)
Cancer Sci 99(In press)
Proc Natl Acad Sci U S A 104
Pages: 18654-18659
Cancer Res 67
Pages: 9649-9657
Plos Genet 3
Pages: 1709-1723
Cancer Sci 98
Pages: 88-95
Cancer Biol Ther 6
Pages: 1058-1066
Oncogene 26
Pages: 4699-4713
130004927598
Clin Cancer Res 13
Pages: 4786-4794
Carcinogenesis 28
Pages: 2459-2466
130004436413
Proc Natl Acad Sci USA. 104
Plos Genet. 3
Cancer Sci. 98
Cancer Biol Ther. 6