| Project/Area Number |
19500252
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Bioinformatics/Life informatics
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| Research Institution | Nagaoka University of Technology |
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Principal Investigator |
SODA Kunitsugu Nagaoka University of Technology, 工学部, 教授 (10011686)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
SEKI Yasutaka 長岡技術科学大, 工学部, 助教 (30377220)
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| Project Period (FY) |
2007 – 2008
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
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| Keywords | 柔構造 / 分子動力学 / 原子充填密度 / 分子内空隙 / 圧力効果 |
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| Research Abstract |
PDB (蛋白質立体構造データベース) に登録されている869種の蛋白質分子立体構造の網羅的解析により, 球状蛋白質は, これ迄広く認められていたよりも有意に低い原子充填密度を持つこと, 及び蛋白質分子水溶液への分子動力学模擬計算法の適用により, 球状蛋白質はTHz域に, 所謂Boson Peak に相当する振動モードを示すことを見出すと共に, その生成の分子機構を明らかにした。
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