• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Protein engineering of the enzymes for clinical analysis based on their three dimensional structures

Research Project

Project/Area Number 19570108
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionNagasaki University

Principal Investigator

ITO Kiyoshi  Nagasaki University, 大学院・医歯薬学総合研究科(薬学系), 准教授 (50201926)

Research Collaborator YOSHIMOTO Tadashi  長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科(薬学系), 教授 (60088870)
NAKAJIMA Yoshitaka  長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科(薬学系), 助教 (80372770)
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥4,290,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥990,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywordsタンパク質と酵素 / SDRファミリー / 3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素 / ケトン体 / X線結晶構造解析 / 基質認識機構 / コンフォメーション変化 / 結晶構造解析 / 臨床検査 / MDRファミリー / 基質特異性
Research Abstract

糖尿病治療時のケトン体の測定試薬として有用なD-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素(HBDH)について、基質結合と触媒反応に重要なクローズド型構造を再現できるシステムを見いだし、その結晶構造と構造変化に重要なアミノ酸残基を解明することができた。また、腎機能の指標として重要なクレアチニンを測定するためのキー酵素であるクレアチニナーゼの基質認識に関わる2つの重要なトリプトファン残基の役割を明らかにした。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (27 results)

All 2009 2008 2007

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (20 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Closed Complex of the D-3-Hydroxybutyrate Dehydrogenase Induced by an Enantiomeric Competitive Inhibitor2009

    • Author(s)
      Kanako Nakashima, Kiyoshi Ito, Yoshitaka Nakajima, Ryuji Yamazawa, Syunsuke Miyakawa, and Tadashi, Yoshimoto
    • Journal Title

      J. Biochem. 145(4)

      Pages: 467-479

    • NAID

      10026302096

    • Related Report
      2008 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Closed complex of the D-3-hydroxybutyrate dehydrogenase induced by an enantiomeric competitive inhibitor.2009

    • Author(s)
      Kanako Nakashima, Kiyoshi Ito, et al.
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry (in press)(掲載確定)

    • NAID

      10026302096

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dipeptidyl Aminopeptidase IV from Stenotrophomonas maltophilia Exhibited an Activity against Substrate Containing 4-Hydroxyproline Residue2008

    • Author(s)
      Yoshitaka Nakajima, Kiyoshi Ito, Tsubasa Toshima, Takashi Egawa, Heng Zheng, Hiroshi Oyama, Wu Yu-Fan, Eiji Takahashi, Kiyoshi Kyono, and Tadashi Yoshimoto
    • Journal Title

      J. Bacteriol. 190(23)

      Pages: 7819-7829

    • Related Report
      2008 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel Inhibitor for Prolyl Tripeptidyl Aminopeptidase from Porphyromonas gingivalis and Details of Substrate-Recognition Mechanism2008

    • Author(s)
      Yue Xu, Yoshitaka Nakajima, Kiyoshi Ito, Heng Zheng, Hiroshi Oyama, Ulrich Heiser, Torsten Hoffmann, Ulf-Torsten Gartner, Hans-Ulrich Demuth, and Tadashi Yoshimoto
    • Journal Title

      J. Mol. Biol. 375(3)

      Pages: 708-719

    • NAID

      120006984748

    • Related Report
      2008 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dipeptidyl aminopeptidase IV from Stenotrophomonas maltophilia exhibited an activity against substrate containing 4-hydroxyproline residue.2008

    • Author(s)
      Yoshitaka Nakajima, Kiyoshi Ito, et al.
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology 190

      Pages: 7819-7829

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel inhibitor for prolyl tripeptidyl aminopeptidase from Porphyromonas gingivalis and details of substrate-recognition mechanism2008

    • Author(s)
      Y.Xu, Y.Nakajima, K.Ito, et. al.
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology 375

      Pages: 708-719

    • NAID

      120006984748

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素変異体のX線結晶構造解析2009

    • Author(s)
      伊藤潔、他6名
    • Organizer
      日本薬学会第129年会
    • Place of Presentation
      京都市
    • Year and Date
      2009-03-26
    • Related Report
      2008 Annual Research Report 2008 Final Research Report
  • [Presentation] L-3-ヒドロキシ酪酸によって誘導されたD-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素のクローズド型構造2008

    • Author(s)
      中島可奈子、伊藤潔、他7名
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会・第31回日本分子生物学会年会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2008-12-09
    • Related Report
      2008 Annual Research Report 2008 Final Research Report
  • [Presentation] クレアチニナーゼの触媒機構と基質認識に関与する2つのTrp残基の役割2008

    • Author(s)
      中嶋義隆、伊藤潔、他7名
    • Organizer
      第81回日本生化学会大会・第31回日本分子生物学会年会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸市
    • Year and Date
      2008-12-09
    • Related Report
      2008 Annual Research Report 2008 Final Research Report
  • [Presentation] クレアチニナーゼ変異体のX線結晶構造解析と基質結合2008

    • Author(s)
      松下隼±、伊藤潔、他5名
    • Organizer
      第25回日本薬学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      延岡市
    • Year and Date
      2008-12-07
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] セリン脱水素酵素の基質特異性と結晶化2008

    • Author(s)
      山澤龍治, 他4名
    • Organizer
      第25回日本薬学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      延岡市
    • Year and Date
      2008-12-07
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素の部位特異的変異体を用いた基質結合機構の解析2008

    • Author(s)
      宮川俊介、伊藤潔、他5名
    • Organizer
      第15回日本生物工学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      熊本市
    • Year and Date
      2008-12-06
    • Related Report
      2008 Annual Research Report 2008 Final Research Report
  • [Presentation] クレアチニナーゼの酵素活性に関与するTrp174の役割2008

    • Author(s)
      山下絹代、伊藤潔、他5名
    • Organizer
      平成20年度日本農芸化学会西日本支部大会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2008-09-20
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素のThr190変異体の構造解析2008

    • Author(s)
      宮川俊介、伊藤潔、他6名
    • Organizer
      平成20年度日本農芸化学会西日本支部大会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2008-09-20
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] クレアチニナーゼの酵素活性に関与するTrpl74の役割2008

    • Author(s)
      山下絹代, 他4名
    • Organizer
      平成20年度日本農芸化学会西日本支部大会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2008-09-20
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素のThrl90変異体の構造解析2008

    • Author(s)
      宮川俊介, 他5名
    • Organizer
      平成20年度日本農芸化学会西日本支部大会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2008-09-20
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] タンパク質工学的手法によるクレアチニナーゼの基質親和性改良2008

    • Author(s)
      平尾理恵、伊藤潔、他8名
    • Organizer
      第60回日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      仙台市
    • Year and Date
      2008-08-27
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] タンパク質工学的手法によるクレアチニナーゼの基質親和性改良2008

    • Author(s)
      平尾理恵, 他7名
    • Organizer
      第60回 日本生物工学会大会
    • Place of Presentation
      仙台市
    • Year and Date
      2008-08-27
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素とL-3-ヒドロキシ酪酸との複合体構造2008

    • Author(s)
      伊藤潔、他4名
    • Organizer
      日本薬学会第128年会
    • Place of Presentation
      横浜市
    • Year and Date
      2008-03-28
    • Related Report
      2008 Final Research Report 2007 Annual Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素の基質認識機構について2007

    • Author(s)
      中島可奈子、伊藤潔、他6名
    • Organizer
      第80回日本生化学会大会・第30回日本分子生物学会年会合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-11
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] Streptococcus由来プリンヌクレオシドホスホリラーゼの構造と基質特異性2007

    • Author(s)
      武吉智也、螺、他4名
    • Organizer
      第24回日本薬学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      福岡市
    • Year and Date
      2007-12-09
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素のクローズド型構造2007

    • Author(s)
      中島可奈子、伊藤潔、他4名
    • Organizer
      第14回日本生物工学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2007-12-01
    • Related Report
      2008 Final Research Report 2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌スレオニン脱水素酵素の基質特異性2007

    • Author(s)
      山澤龍治、伊藤潔、他4名
    • Organizer
      第14回日本生物工学会九州支部大会
    • Place of Presentation
      長崎市
    • Year and Date
      2007-12-01
    • Related Report
      2008 Final Research Report 2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 感染症予防治療薬の開発を目指した構造生物学2007

    • Author(s)
      伊藤潔、他3名
    • Organizer
      第59回日本生物工学会大会シンポジウム(バイオテクノロジーへの応用的戦略を踏まえたタンパク質構造解析)
    • Place of Presentation
      東広島市
    • Year and Date
      2007-09-26
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素の部位特異的変異体の解析2007

    • Author(s)
      伊藤潔、他4名
    • Organizer
      平成19年度日本生化学会九州支部例会
    • Place of Presentation
      宮崎市
    • Year and Date
      2007-05-20
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] D-3-ヒドロキシ酪酸脱水素酵素の部位特異的変異体の解析2007

    • Author(s)
      伊藤 潔, 中島 加奈子, 中島 義隆, 芳本 忠
    • Organizer
      日本生化学会九州支部例会
    • Place of Presentation
      宮崎市
    • Year and Date
      2007-05-20
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] 構造生物学-ポストゲノム時代のタンパク質研究-(倉光,杉山編)(腎機能を知るためのタンパク質)2007

    • Author(s)
      芳本忠,伊藤潔,中島義隆
    • Publisher
      共立出版
    • Related Report
      2008 Final Research Report

URL: 

Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi