Molecular mechanisms of genomic instability induced by transcription

• Project/Area Number: 19570172
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Molecular biology
• Research Institution: National Institute for Basic Biology
• Principal Investigator: JOHZUKA Katsuki National Institute for Basic Biology, ゲノム動態研究部門, 助教 (40291893)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2008: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2007: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
• Keywords: 染色体 / 遺伝学 / 分子生物学 / コンデンシン / 合成致死 / リボソーム遺伝子 / 染色体凝集 / ゲノムダイナミクス / 染色体分配 / 染色体凝縮 / リボソーム / ゲノム動態

Research Abstract

細胞が分裂するとき、遺伝情報をコードしたDNA鎖は分裂期染色体へのその形状を大きく変化させコンパクトに折りたたまれます。染色体凝縮と呼ばれるこの現象でDNAに作用して重要な役割を果たすのがコンデンシンと呼ばれる複合体ですが、染色体のどこに、どのようにして結合し、どのような作用をするのか依然として不明です。本研究では酵母を用いて、コンデンシンが結合するDNA部位とその結合に必要な因子を明らかとしました。この成果は染色体高次構造を分子レベルで理解するために大きく貢献します。

Research Products

• [Journal Article] The cis element and factors required for condensing recruitment to chromosomes (2009)
  • Author(s): Johzuka K., Horiuchi T.
  • Journal Title: Mol. Cell 34 Pages: 26-35
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The cis element and factors required for condensin recruitment to chromosomes (2009)
  • Author(s): Johzuka K., Horiuchi T.
  • Journal Title: Molecular Cell 34 Pages: 26-35
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] RNA polymerase I transcription obstructs condensing association with 35S rRNA coding region and can cause contraction of long repeat in Saccaromyces cerevisiae (2007)
  • Author(s): Johzuka K., Horiuchi T.
  • Journal Title: Genes Cells 12 Pages: 759-771
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] RNA polymerase I transcription obstructs condensin association with 35SrRNA coding regions and can cause contraction of long repeat in Saccharomyces cerevisiae (2007)
  • Author(s): Johzuka K., and Horiuchi T.
  • Journal Title: Genes to Cells 12 Pages: 759-771
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 減数分裂期染色体上でおきるコンデンシンの大規模な局在変化 (2009)
  • Author(s): 板津昌子、定塚勝樹
  • Organizer: 第28回染色体ワークショップ
  • Place of Presentation: ウエルサンピア姫路
  • Year and Date: 2009-01-27
• [Presentation] 減数分裂期染色体上でおきるコンデンシンの大規模な局在変化 (2009)
  • Author(s): 板津昌子、定塚勝樹
  • Organizer: 第28回染色体ワークショップ
  • Place of Presentation: ウエルサンピア姫路(兵庫県)
  • Year and Date: 2009-01-27
• [Presentation] 対数増殖期と減数分裂期におけるrDNAとセントロメア領域を中心としたコンデンシンの局在変化 (2008)
  • Author(s): 板津昌子、定塚勝樹
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル
  • Year and Date: 2008-12-11
• [Presentation] コンデンシン結合のシス配列とその結合の分子機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル
  • Year and Date: 2008-12-11
• [Presentation] コンデンシン結合のシス配列とその結合の分子機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 2008-12-11
• [Presentation] 対数増殖機と減数分裂期におけるrDNAとセントロメア領域を中心としたコンデンシンの局在変化 (2008)
  • Author(s): 板津昌子、定塚勝樹
  • Organizer: BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 2008-12-11
• [Presentation] The cis element and factors required for condensing recruitment to chromosomes (2008)
  • Author(s): Johzuka K.
  • Organizer: International 3R Symposium 2008
  • Place of Presentation: ヤマハリゾートつま恋
  • Year and Date: 2008-10-28
• [Presentation] The cis element and factors required for condensin recruitment to chromosomes (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹
  • Organizer: International 3R symosium 2008
  • Place of Presentation: 掛川ヤマハリゾート(静岡県)
  • Year and Date: 2008-10-28
• [Presentation] コンデンシン結合のシス配列とその結合の分子機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 第41回酵母遺伝学フォーラム
  • Place of Presentation: 北海道大学
  • Year and Date: 2008-09-10
• [Presentation] コンデンシン結合のシス配列とその結合の分子機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 酵母遺伝学フォーラム第41回研究報告会
  • Place of Presentation: 北海道大学(北海道)
  • Year and Date: 2008-09-10
• [Presentation] コンデンシンが結合するシス配列とその結合の分子機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 第80回日本遺伝学会
  • Place of Presentation: 名古屋大学
  • Year and Date: 2008-09-04
• [Presentation] コンデンシンが結合するシス配列とその結合の分子機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 日本遺伝学会第80会大会
  • Place of Presentation: 名古屋大学(愛知県)
  • Year and Date: 2008-09-04
• [Presentation] Condensinが特異的に結合するDNA領域とその結合機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹
  • Organizer: 大阪大学蛋白質研究所セミナー
  • Place of Presentation: 大阪大学
  • Year and Date: 2008-03-14
• [Presentation] Condensinが特異的に結合するDNA領域とその結合機構 (2008)
  • Author(s): 定塚 勝樹
  • Organizer: 平成20年度蛋白研セミナー
  • Place of Presentation: 大阪大学・蛋白質研究所
  • Year and Date: 2008-03-14
• [Presentation] 酵母CondensinとrDNA領域にある複製フォーク停止部位(RFB)との特異的結合機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 組換え・複製ワークショップ
  • Place of Presentation: ラフォーレ修善
  • Year and Date: 2008-03-05
• [Presentation] 酵母CondensinとrDNA領域にある複製フォーク停止部位(RFB)との特異的結合機構 (2008)
  • Author(s): 定塚 勝樹、堀内 嵩
  • Organizer: 2007年度組換え・複製合同ワークショップ
  • Place of Presentation: ラフォーレ修善寺
  • Year and Date: 2008-03-05
• [Presentation] 出芽酵母コンデンシンと複製フォーク停止部位(RFB)との結合機構 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 第25回染色体ワークショップ
  • Place of Presentation: 湯河原厚生年金会館
  • Year and Date: 2008-02-01
• [Presentation] 染色体の凝縮と分配におけるCondensinの作用機序 (2008)
  • Author(s): 定塚 勝樹
  • Organizer: 第一回染色体サイクル公開領域会議
  • Place of Presentation: 東京大学
  • Year and Date: 2008-01-08
• [Presentation] 染色体の凝縮と分配におけるCondensinの作用機序 (2008)
  • Author(s): 定塚勝樹
  • Organizer: 染色体サイクル公開班会議
  • Place of Presentation: 東京大学
  • Year and Date: 2008-01-07
• [Presentation] 酵母コンデンシンとrDNAリピートにある複製フォーク停止部位(RFB)との結合機構 (2007)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 日本分子生物学会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] 酵母コンデンシンとrDNAリピートにある複製フォーク停止部位(RFB)との結合機構 (2007)
  • Author(s): 定塚 勝樹、堀内 嵩
  • Organizer: 2007日本分子生物学会・生化学会合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] 出芽酵母コンデンシンのリボソームRNA遺伝子領域への結合機構 (2007)
  • Author(s): 定塚 勝樹、堀内 嵩
  • Organizer: 2007日本遺伝学会
  • Place of Presentation: 岡山大学
  • Year and Date: 2007-09-21
• [Presentation] 出芽酵母コンデンシンのリボソームRNA遺伝子領域への結合機構 (2007)
  • Author(s): 定塚勝樹、堀内嵩
  • Organizer: 日本遺伝学会
  • Place of Presentation: 岡山大学
  • Year and Date: 2007-09-19
• [Presentation] RNA polymerise I transcription obstructs condensin association with 35SrRNA coding regions and can cause contraction of lone repeat in Saccharomyces cerevisiae (2007)
  • Author(s): Johzuka K, Horiuchi T
  • Organizer: 16th International Chromosome Conference
  • Place of Presentation: The Amsterdam RAI Exhibition and Congress Centre
  • Year and Date: 2007-08-27
• [Presentation] RNA polymerise I transcription obstructs condensin association with 35SrRNA coding reeions and can cause contraction of lone repeat in Saccharomyces cerevisiae (2007)
  • Author(s): Johzuka K, Horiuchi T
  • Organizer: Gordon Research Conference
  • Place of Presentation: University of New England ME,USA
  • Year and Date: 2007-08-13
• [Presentation] RNA polymerase I transcription obstructs condensing association with 35S rRNA coding regions and can cause contraction of long repeat in Saccharomyces cerevisiae (2007)
  • Author(s): Johzuka K., Horiuchi T.
  • Organizer: 16th International Chromosome Conference
  • Place of Presentation: アムステルダム(オランダ)
• [Presentation] RNA polymerase I transcription obstructs condensing association with 35S rRNA coding regions and can cause contraction of long repeat in Saccharomyces cerevisiae (2007)
  • Author(s): Johzuka K., Horiuchi T.
  • Organizer: Gordon Research Conference
  • Place of Presentation: Univ. New England ME (アメリカ合衆国)
• [Remarks] 報道関連情報日経産業新聞2009年4月10日11面掲載日刊工業新聞2009年4月16日23面掲載科学新聞2009年4月24日4面掲載