Function of the Itm2 family of membrane proteins on endosomes

• Project/Area Number: 19570178
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Cell biology
• Research Institution: Tokyo Institute of Technology
• Principal Investigator: KOMADA Masayuki Tokyo Institute of Technology, 大学院・生命理工学研究科, 准教授 (10225568)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2008: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000); Fiscal Year 2007: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
• Keywords: 細胞 / タンパク質 / ユビキチン / 脱ユビキチン化酵素 / メンブレントラフィック / 選別輸送 / エンドソーム / 癌 / 酵素 / 細胞・組織 / シグナル伝達 / 蛋白質 / 神経科学 / 痴呆 / 脳神経疾患

Research Abstract

遺伝性痴呆症の原因遺伝子産物であるItm2タンパク質が細胞内小器官であるエンドソームに局在するタンパク質複合体Hrs-STAMと結合することから、エンドソーム機能の痴呆症発症への関与が示唆されている。本研究では、エンドソームでHrs-STAM複合体と結合するItm2 タンパク質および脱ユビキチン化酵素UBPY とAMSH の解析を行い、1) Itm2タンパク質がエンドソームで働くこと、2) UBPYとAMSHが細胞質分裂においても重要な役割を果たすこと、そして3) AMSHの酵素活性の基質特異性の構造的基盤、を解明した。

Research Products

• [Journal Article] Nucleolar structure and function are regulated by the deubiquitylating enzyme USP36 (2009)
  • Author(s): Endo A, Matsumoto M, Inada T, Yamamoto A,Nakayama KI, Kitamura N, Komada M
  • Journal Title: J. Cell Sci 122 Pages: 678-686
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dispensable role of protein 4.1B/DAL-1 in rodent adrenal medulla regarding generation of pheochromocytoma and plasmalemmal localization of TSLC1 (2009)
  • Author(s): Ohno N, Terada N, Komada M, Saitoh S, Costantini F, Pace V, Germann PG, Weber K, Yamakawa H, Ohara O, Ohno S
  • Journal Title: Biochim. Biophys. Acta 1793 Pages: 506-515
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ユビキチン修飾系による細胞質分裂の制御 (2009)
  • Author(s): 駒田雅之、向井明子
  • Journal Title: 蛋白質核酸酵素 54 Pages: 11-19
  • NAID: 40016392332
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Nucleolar structure and function are regulated by the deubiquitylating enzyme USP36. (2009)
  • Author(s): Endo A
  • Journal Title: J. Cell Sci. 122 Pages: 678-686
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dispensable role of protein 4.1B/DAL-1 in rodent adrenal medulla regarding generation of pheochromocytoma and plasmalemmal localization of TSLC1. (2009)
  • Author(s): Ohno N
  • Journal Title: Biochim. Biophys. Acta 1793 Pages: 506-515
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] ユビキチン修飾系による細胞質分裂の制御 (2009)
  • Author(s): 駒田雅之
  • Journal Title: 蛋白質核酸酵素 54 Pages: 11-19
  • NAID: 40016392332
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dynamic regulation of ubiquitylation and deubiquitylation at the central spindle during cytokinesis (2008)
  • Author(s): Mukai A, Mizuno E, Kobayashi K, Matsumoto M, Nakayama KI, Kitamura N, Komada M
  • Journal Title: J. Cell Sci 121 Pages: 1325-1333
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Structural basis for selective cleavage of Lys63-linked polyubiquitin chains (2008)
  • Author(s): Sato Y, Yoshikawa A, Yamagata A, Mimura H, Yamashita M, Ookata K, Nureki O, Iwai K, Komada M, Fukai S
  • Journal Title: Nature 455 Pages: 358-362
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Sodium channel cluster, betaIV-spectrin and ankyrinG positive "hot spots" on dendritic segments of parvalbumin-containing neurons and some other neurons in the mouse and rat main olfactory bulbs (2008)
  • Author(s): Kosaka T, Komada M, Kosaka K
  • Journal Title: Neurosci. Res 62 Pages: 176-186
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Ubiquitin-mediated proteasomal degradation of non-synonymous SNP variants of human ABC transporter ABCG2 (2008)
  • Author(s): Nakagawa H, Tamura A, Wakabayashi K, Hoshijima K, Komada M, Yoshida T, Kometani S, Matsubara T, Mikuriya K, Ishikawa T
  • Journal Title: Biochem 411 Pages: 623-631
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Controlling receptor downregulation by ubiquitination and deubiquitination (2008)
  • Author(s): Komada M
  • Journal Title: Curr. Drug Discov. Technol 5 Pages: 78-84
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] エンドソームにおけるメンブレントラフィックと細胞質分裂の接点 (2008)
  • Author(s): 向井明子、駒田雅之
  • Journal Title: 増刊号「メンブレントラフィックの奔流」 53 Pages: 2094-2098
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Structural basis for selective cleavage of Lys63-linked polyubiquitin chains. (2008)
  • Author(s): Sato Y
  • Journal Title: Nature 455 Pages: 358-362
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dynamic regulation of ubiquitylation and deubiquitylation at the central spindle during cytokinesis. (2008)
  • Author(s): Mukai A
  • Journal Title: J. Cell Sci. 121 Pages: 1325-1333
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Ubiquitin-mediated proteasomal degradation of non-synonymous SNP variants of human ABC transporter ABCG2. (2008)
  • Author(s): Nakagawa H
  • Journal Title: Biochem. J. 411 Pages: 623-631
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Sodium channel cluster, betaIV-spectrin and ankyrinG positive hot spots on dendritic segments of parvalbumin-containing neurons and someother neurons in the mouse and rat main olfactory bulbs. (2008)
  • Author(s): Kosaka T
  • Journal Title: Neurosci. Res. 62 Pages: 176-186
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Controlling receptor downregulation by ubiquitination and deubiquitination. (2008)
  • Author(s): Komada M
  • Journal Title: Curr. Drug Discov. Technol. 5 Pages: 78-84
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] エンドソームにおけるメンブレントラフィックと細胞質分裂の接点 (2008)
  • Author(s): 向井明子
  • Journal Title: 蛋白質核酸酵素 53 Pages: 2094-2098
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Controlling receptor downregulation by ubiquitination and deubiquitination. (2008)
  • Author(s): Komada, M.
  • Journal Title: Curr. Drug. Discov. Technol. 5 Pages: 78-84
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Ubiquitin-mediated proteasomal degradation of non-synonymous SNP variants of human ABC transporter ABCG2. (2008)
  • Author(s): Nakagawa, H.
  • Journal Title: Biochem. J. 411 Pages: 623-631
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dynamic regulation of ubiquitination and deubiquitination at the central spindle during cytokinesis. (2008)
  • Author(s): Mukai, A.
  • Journal Title: J. Cell Sci. 121 Pages: 1325-1333
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Intramolecular disulfide hond is a critical checkpoint determining degradative fates of ATP-binding cassette (ABC) transporter ABCG2 protein. (2007)
  • Author(s): Wakabayashi, K.
  • Journal Title: J. Biol. Chem. 282 Pages: 27841-27846
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 14-3-3-dependent inhibition of the deubiquitinating activity of UBPY and its cancellation in the M phase. (2007)
  • Author(s): Mizuno, E
  • Journal Title: Exp. Cell Res. 313 Pages: 3624-3634
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Interaction of membrane skeletal protein, protein 4.1B and p55, and sodium bicarbonate cotransporter 1 in mouse renal S1-S2 proximal tubules. (2007)
  • Author(s): Terada, N.
  • Journal Title: J. Histochem. Cytochem. 55 Pages: 1199-1206
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Regulation of endosomal cargo sorting by deubiquitinating enzymes. (2007)
  • Author(s): Komada, M.
  • Journal Title: Research Advances in Biological Chemistry Pages: 27-38
• [Journal Article] 神経繊維ランビエ絞輪部近傍の軸索構築に関するタンパク質間相互作用 (2007)
  • Author(s): 寺田 信生
  • Journal Title: 生体の科学 58 Pages: 476-477
• [Presentation] LRRK1 はESCRT-0複合体と相互作用することでEGFR細胞内トラフィックを制御している (2008)
  • Author(s): 花房洋
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-12
• [Presentation] AMSHファミリーによるK63結合型ポリユビキチン鎖特異的な切断活性の構造的基盤 (2008)
  • Author(s): 佐藤裕介
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-12
• [Presentation] AMSHファミリーによるK63結合型ポリュビキチン鎖特異的な切断活性の構造的基盤 (2008)
  • Author(s): 佐藤裕介
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-12
• [Presentation] LRRK1はESCRT-O複合体と相互作用することでEGFR細胞内トラフィックを制御している (2008)
  • Author(s): 花房洋
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-12
• [Presentation] 脱ユビキチン化酵素USP36による核小体機能の制御 (2008)
  • Author(s): 遠藤彬則
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-11
• [Presentation] 脱ュビキチン化酵素USP36による核小体機能の制御 (2008)
  • Author(s): 遠藤彬則
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-11
• [Presentation] 中央部紡錘体における時空間的に制御されたタンパク質ユビキチン化 (2008)
  • Author(s): 駒田雅之
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-10
• [Presentation] 中央部紡錘体における時空間的に制御されたタンパク質ュビキチン化 (2008)
  • Author(s): 駒田雅之
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2008
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-10
• [Presentation] キイロショウジョウバエを用いた脱ユビキチン化酵素UBPYの機能解析 (2008)
  • Author(s): 向井明子
  • Organizer: 第60回日本細胞生物学会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2008-07-01
• [Presentation] エンドソームと細胞質分裂の接点-ユビキチン化と脱ユビキチン化による調節 (2008)
  • Author(s): 駒田雅之
  • Organizer: 第60回日本細胞生物学会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2008-07-01
• [Presentation] エンドソームで働く脱ユビキチン化酵素UBPYの活性調節とその意義 (2007)
  • Author(s): 駒田 雅之
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2007・ワークショップ
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-15
• [Presentation] 脱ユビキチン化酵素USP36の機能解析 (2007)
  • Author(s): 遠藤 彬則
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-14
• [Presentation] Disulfide bond formation plays a crucial role in protein stability of human ABCG2 (2007)
  • Author(s): 若林 香菜子
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-14
• [Presentation] キイロショウジョウバエにおける脱ユビキチン化酵素UBPYの機能解析 (2007)
  • Author(s): 向井 明子
  • Organizer: 日本生化学会/日本分子生物学会合同大会BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] ユビキチン化と脱ユビキチン化によるABCG2の発現レベル調節 (2007)
  • Author(s): 山口 徳之
  • Organizer: トランスポーター研究会 第1回関東部会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-10
• [Presentation] Activation of an endosomal deubiquitinating enzyme in M phase (2007)
  • Author(s): 駒田 雅之
  • Organizer: 国際シンポジウム"メンブレントラフィック"
  • Place of Presentation: 淡路島
  • Year and Date: 2007-11-28
• [Presentation] ユビキチン化/脱ユビキチン化による受容体ダウンレギュレーションの調節 (2007)
  • Author(s): 駒田 雅之
  • Organizer: 第2回トランスポーター研究会・特別講演
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2007-06-09
• [Presentation] Endosome-associated deubiquitinating enzyme UBPY is regulated by 14-3-3 proteins in the M phase (2007)
  • Author(s): 駒田 雅之
  • Organizer: 第59回日本細胞生物学会・ワークショップ
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2007-05-30
• [Book] バイオ系のための基礎化学問題集 (2008)
  • Author(s): 三原 久和
  • Publisher: 講談社サイエンティフィク
• [Book] トコトンやさしいタンパク質の本 (2007)
  • Author(s): 有坂 文雄
  • Publisher: 日刊工業新聞社
• [Book] バイオ研究のフロンティア3-医療に向けた先端バイオ科学
  • Author(s): 駒田雅之
  • Publisher: 増殖因子受容体の分解制御と制癌(印刷中)
• [Remarks]
  • URL: http://www.kitamura-komada-lab.bio.titech.ac.jp/