Analysis of Otx genes expression and its regulation in cyclostome. Analysis of Otx genes expression and its regulation in cyclostome

• Project/Area Number: 19570200
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Developmental biology
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: KUROKAWA Daisuke The University of Tokyo, 大学院・理学研究科, 助教 (40342779)
• Project Period (FY): 2008 – 2009
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000); Fiscal Year 2008: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000); Fiscal Year 2007: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: 進化発生 / 発生進化 / 転写調節 / Otx遺伝子 / 頭部形成 / 遺伝子発現

Research Abstract

日本産ヤツメウナギ(Lethenteron japonicum)より得られた3つのOtx関連遺伝子(OtxA,OtxB, OtxC)の全長cDNA 配列を決定し、これまで明らかになっていなかった初期胚内での発現パターンをwhole mount in situ ハイブリダイゼーション法により記載した。明らかになった発現パターンを与える発現調節領域の同定を行う為にヤツメウナギBAC(大腸菌人工染色体)ライブラリーより、各遺伝子を含むBACクローンの単離を試み、OtxA遺伝子座を含むクローンの単離に成功し、ショットガンシーケンス法によりドラフト配列を得る事に成功した。

Research Products

• [Journal Article] Evolution of Otx paralogue usages inearly patterning of the vertebrate head (2009)
  • Author(s): Yoko Suda, Daisuke Kurokokawa, MasakiTakeuchi, Shigeru Kuratani, ChrisAmemiya, Shinichi Aizawa
  • Journal Title: (*These two authors contributed equallyto this work.)Developmental Biology 325 Pages: 282-295
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolution of Otx paralogue usages in early patterning of the vertebrate head (2009)
  • Author(s): 須田容子 他7名
  • Journal Title: Developmental Biology 325 Pages: 282-295
  • Peer Reviewed
• [Presentation] Cis-sequence conservation for Otx2expression in head organizers in jawedvertebrate (2008)
  • Author(s): 黒川大輔, 須田容子, 大村朋美, 荻野肇, Chris Amemiya, 相澤慎一
  • Organizer: Joint meeting of the French and JapaneseSocieties for Developmental Biology
  • Place of Presentation: フランス ジアン
  • Year and Date: 2008-09-15
• [Presentation] Cis-sequehce conservation for Otx2 expression in head organizers in jawed vertebrate. (2008)
  • Author(s): 黒川大輔 他5名
  • Organizer: Frontiers in developmental biology
  • Place of Presentation: フランス ジアン
  • Year and Date: 2008-09-15
• [Presentation] Lineage-specific usage of Otx paraloguesin vertebrate head development (2008)
  • Author(s): 須田容子, 黒川大輔, 竹内雅貴, 相澤慎一
  • Organizer: Joint meeting of the French and JapaneseSocieties for Developmental Biology
  • Place of Presentation: フランス ジアン
  • Year and Date: 2008-09-14
• [Presentation] 脊椎動物の頭部形成過程における系統依存的Otxパラログ発現 (2008)
  • Author(s): 黒川大輔, 須田 容子, 相沢 慎一
  • Organizer: 日本動物学会第79回大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2008-09-06
• [Presentation] 脊椎動物の頭部形成過程における系統依存的Otxパラログ発現 (2008)
  • Author(s): 黒川大輔
  • Organizer: 日本動物学会第79回大会
  • Place of Presentation: 福岡 福岡大学
  • Year and Date: 2008-09-05
• [Presentation] Evolution of Vertebrate Otx2 enhancers-from skate to mouse- (2008)
  • Author(s): 黒川大輔
  • Organizer: 日本発生生物学会第41回大会
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2008-05-27
• [Presentation] Evolution of Vertebrate Otx2 enhancers-from skate to mouse- (2008)
  • Author(s): 黒川大輔
  • Organizer: 第41回日本発生生物学会
  • Place of Presentation: 徳島 郷土文化会館
  • Year and Date: 2008-05-27
• [Presentation] Evolutionary constraint on Otx2-neuroectoderm enhancers (2007)
  • Author(s): 黒川大輔, 他3名
  • Organizer: First Pan American Congress in Developmental Biology
  • Place of Presentation: メキシコ カンクン
  • Year and Date: 2007-06-17
• [Presentation] Otx2 cis-sequences evolution for headdevelopment in vertebrate
  • Author(s): 黒川大輔, 須田容子, 大村朋美, 荻野肇, Chris Amemiya, 相澤慎一
  • Organizer: The Eight NIBB-EMBL Joint meeting
  • Place of Presentation: 岡崎