Regulation of nitrogen fixation in the energy metaboliting deficient mutants

• Project/Area Number: 19580067
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Plant nutrition/Soil science
• Research Institution: Kagawa University
• Principal Investigator: TAJIMA Shigeyuki Kagawa University, 農学部, 教授 (50116894)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): AGARIE Mika 香川大学, 農学部, 准教授 (50294749)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2008: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2007: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: バクテロイド / ダイズ / 根粒菌 / 共生窒素固定 / プロテオーム解析

Research Abstract

根粒菌が土壌中で生活しているスタイルから共生スタイルへ変化する時のタンパク質の変化や、根粒オルガネラ(ミトコンドリア)タンパク質について網羅的に解析を行い、共生窒素固定に関与するタンパク質を検索した。このプロテオーム解析結果を利用してダイズ根粒菌バクテロイドで発現するタンパク質発現を抑制させた根粒菌破壊株を作製し、根粒形成あるいは共生窒素固定に関与するバクテロイドタンパク質を検索した。その結果、Bj80変異株が共生窒素固定に関与する遺伝子を欠損していることが明らかとなった。

Research Products

• [Journal Article] The 5'-end expressed sequence tags of Lotus japonicus Plant (2008)
  • Author(s): Nomura, M., Tan, D.V., Arunothayanan, H., Asamizu, E., Tabata, S., Kouchi, H. and Tajima, S.
  • Journal Title: Biotechnology 25 Pages: 173-175
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] NAD-Malic Enzyme Affects Nitrogen Fixing Activity of B. japonicum USDA 110 Bacteroids in Soybean Nodules (2008)
  • Author(s): Dao,T.V., Nomura, M., Hamaguchi, R., Kato, K., Itakura, M., Minamisawa, K., Sinsuwongwat, S., Le, H.T.P, Kaneko, T., Tabata, S., and Tajima, S.
  • Journal Title: Microbes and Environment 23, 3 Pages: 215-220
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Soybean Seed Extracts Preferentially Express Genomic Loci of Bradyrhizobium japonicum in the Initial Interaction with Soybean (2008)
  • Author(s): Min, Wei, Yokoyama, T., Minamisawa, K., Mitsui, H., Itakura, M., Kaneko, T., Tabata, S., Saeki, K., Omori, H., Tajima, S., Uchiumi, T., Abe, M. and Ohwada, T.
  • Journal Title: Glycine max(L.) Merr DNA Research 23 Pages: 215-220
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The 5'-end expressed sequence tags of Lotus japonicus (2008)
  • Author(s): Nomura. M., Tan, D. V., Arunothayanan, H., Asamizu, E., Tabata, S., Kouchi, H., Tajima, S
  • Journal Title: Plant Biotechnology 25 Pages: 173-175
  • NAID: 10021913054
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Soybean Seed Extracts Preferentially Express Genomic Loci of Bradyrhizobium japonicum in the Initial Interaction with Soybean, Glycine max (L. ) Merr (2008)
  • Author(s): Min, Wei, Yokoyama, T., Minamisawa, K., Mitsui, H., Itakura, M., Kaneko, T., Tabata, S., Saeki, K., Omori, H., Taiima, S., Uchiumi, T., Abe, M., Ohwada, T.
  • Journal Title: DNA Research 15(4) Pages: 201-214
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] NAD-malic enzyme regulates nitrogen fixation activity of B. japonicum USDA 110 bacteroids in soybean nodules (2008)
  • Author(s): T. V. Dao, M. Nomura, R, Hamaguchi, K. Kato, M. Itakura, K. Minamisawa, S. t Sinsuwongwat, H. T-P Le, T. Kaneko, S. Tabata, S. Tajima
  • Journal Title: Microbes and Environment 23 Pages: 215-220
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Direct production of L-tagatose from L-psicose by Enterobacter aerogenes 230S (2008)
  • Author(s): D, Rao, P. Gullapalli, A. Yoshihara, K. Morimoto, G. Takata, S, Tajima, K. Akimitu, S. F. Jenkinson, G. W. J. Fleet, K. Izumori
  • Journal Title: J. Biosci. and Bioeng 106(5) Pages: 473-480
  • NAID: 110007005173
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The 5'-end expressed sequence tags of Lotus japonicus (2008)
  • Author(s): Nomura M., Tan D.V., Arunothayanan H., Asamizu E., Tabata S., Kouchi H., Tajima S
  • Journal Title: Plant Biotechnology 25 Pages: 173-175
  • NAID: 10021913054
  • Peer Reviewed
• [Presentation] ミヤコグサ変異体を用いた共生窒素固定に関与する遺伝子群の解析 (2008)
  • Author(s): 上田知幸、Nanthipak Thapanapongwora-kul,、熊谷研吾、当真公彦、畑信吾、野村美加、田島茂行
  • Organizer: 日本土壌肥料学会関西支部
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2008-11-28
• [Presentation] ミヤコグサSNARE遺伝子の機能解析 (2008)
  • Author(s): 長岡功微菜, 古味光紗, 真鍋友美, 神吉陽輔, 浅水絵里香, 佐藤修正, 田畑哲之, 野村美加, 田島茂行
  • Organizer: 日本土壌肥料学会関西支部
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2008-11-28
• [Presentation] ダイズ・ミヤコグサ根粒バクテロイドプロテオーム解析から見えてくること (2008)
  • Author(s): 野村美加、Dao Van Tan, 田島茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 奈良
• [Presentation] 共生窒素固定に関与するバクテロイドタンパク質の機能解析 (2008)
  • Author(s): 野田朱花、Dao Van Tan, Hattahaya Arunothayanan, Nanthipak Thapanapongworakul, 上田知幸、熊谷研吾、当真公彦、南澤究、板倉学、野村美加、田島茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 奈良
• [Presentation] Nobel metalloshaperone in the assembly of cytochrome c oxidase of soybean nodule bacteroids (2008)
  • Author(s): Hattahaya Arunothayanan, Tan Van Dao, Rie Hamaguchi, Ayaka Noda, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] Screening of Mesorhizobium loti mutants for symbiotic N2 fixation in Lotus japonicus (2008)
  • Author(s): Nanthipak Thapanapongworakul, Tan Van Dao, Kimihiho Toma, Shusei Sato, Yoshikazu Shimoda, Satoshi Tabata, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] Screening of Mesorhizobium loti mutants for symbiotic N2 fixation in Lotus Japonicus (2008)
  • Author(s): Nanthipak Thapanapongworakul, Tan Van Dao, Kimihiho Toma, Shusei Sato, Yoshikazu Shimoda, Satoshi Tabata, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima.
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] obel metalloshaperone in the assembly of cytochrome c oxidase of soybean nodule bacteroids (2008)
  • Author(s): Hattahaya Arunothayanan, Tan Van Dao, Rie Hamaguchi, Ayaka Noda, Manabu Itakura, Kiwamu Minamisawa, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima.
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 名古屋
• [Presentation] ミヤコグサSNARE遺伝子群の機能解析 (2008)
  • Author(s): 真鍋友美, 古味光紗, 長岡功微菜, 神吉陽輔, 浅水絵里香, 佐藤修正, 田畑哲之, 野村美加, 田島茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 奈良
• [Presentation] Proteome analysis of Bradyrhizobium japonicum USDA110 bacteroid differentiation during soybean nodule development (2008)
  • Author(s): 野村美加, 田島茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 奈良
• [Presentation] PEPC酵素を抑制した形質転換ミヤコグサ根粒における代謝産物の解析 (2007)
  • Author(s): 上田知幸・藤井美帆・野村美加・田島茂行
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] Proteome analysis of Bradyrhizobium japonicum USDA110 bacteroid differentiation during soybean nodule development (2007)
  • Author(s): Dao Van Tan, Le Phuong Hoa, Mika Nomura, Kazuhiko Saeki, Kiwamu Minamisawa, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Shigeyuki Tajima
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] ミヤコグサ根粒菌との共生に関与するミヤコグサSNARE遺伝子群の検索 (2007)
  • Author(s): 古味光紗、真鍋友美、長岡功微菜、浅水絵里香、佐藤修正、田畑哲之、竹川薫、野村美加、田島茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 鹿児島
• [Presentation] 共生窒素固定に関与するダイズ根粒菌(Bradyrhizobium japonicum USDA110)バクテロイドタンパク質の検索 (2007)
  • Author(s): 野田朱花、DAO VAN TAN、濱口理恵、加藤賢祐、南澤究、板倉学、野村美加、田島茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 鹿児島
• [Presentation] Characterization of mitochondrial proteins from soybean and Lotus japonicus nodules (2007)
  • Author(s): Hattahaya Arunothayanan, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 鹿児島
• [Presentation] ミヤコグサ根粒菌との共生に関与するミヤコグサSNARE遺伝子群の検索 (2007)
  • Author(s): 古味 光紗、真鍋 友美、長岡 功微菜、浅水 絵里香、佐藤 修正、田畑 哲、竹川 薫、野村 美加、田島 茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
• [Presentation] 共生窒素固定に関与するダイズ根粒菌(Bradyrhizobium japonicum USDA110)バクテロイドタンパク質の検索 (2007)
  • Author(s): 野田 朱花、DAOVAN TAN、濱口 理恵、加藤 賢祐、南澤 究、板倉 学、野村 美加、田島 茂行
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
• [Presentation] Characterization of mitochondrial proteins from soybean and Lotus j aponicus nodules (2007)
  • Author(s): Hattahaya Arunothayanan, Mika Nomura, Shigeyuki Tajima,
  • Organizer: 植物微生物研究会
  • Place of Presentation: 鹿児島大学
• [Presentation] PEPC酵素を抑制した形質転換ミヤコグサ根粒における代謝産物の解析 (2007)
  • Author(s): 上田 知幸, 藤井 美帆, 野村 美加, 田島 茂行
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 東京農業大学
• [Presentation] Proteome analysis of Bradyrhizoium japonicum USDA110 bacteroid differentiation during soybean nodule development (2007)
  • Author(s): Dao Van Tan, LePhuong Hoa, Mika Nomura, Kazuhiko Saeki, Kiwamu Minamisawa, Takakazu Kaneko, Satoshi Tabata, Shigeyuki Tajima
  • Organizer: 日本土壌肥料学会
  • Place of Presentation: 東京農業大学