Phylogenetic analyses of the nucleotide sequence diversity in the genome of Trypanosoma cruzi

• Project/Area Number: 19590436
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Parasitology (including Sanitary zoology)
• Research Institution: Juntendo University
• Principal Investigator: NARA Takeshi Juntendo University, 医学部, 准教授 (40276473)
• Research Collaborator: SUZUKI Shigeo 順天堂大学, 医学部, 技術員
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2008: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2007: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
• Keywords: トリパノソーマ / 遺伝的多様性 / 1塩基置換(SNPs) / 遺伝子重複 / ピリミジン生合成酵素

Research Abstract

シャーガス病の病原体Trypanosoma cruziは無性分裂を行なう2倍性の寄生原虫で、遺伝学的に6系統に分類される。T. cruziにおける遺伝的多様性創出機構を解明することを目的として、T. cruzi のdihydroorotate dehydrogenase(DHOD)遺伝子のコピー数および1塩基置換をT. cruzi分離株間で比較した。DHOD遺伝子は調べた分離株全てで4コピー存在し、系統IibではDHOD遺伝子の多型度は分離株間よりも同一個体内に存在する遺伝子コピー間での遺伝的多型度が大きかった。従来T. cruziでは、有性生物に見られるように個体内での遺伝的多様度が極めて小さいと報告されていたが、本研究で初めて無性生物に特有の進化学的特徴を明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] Proteome approach for identification of schistosomiasis japonica vaccine candidate antigen (2009)
  • Author(s): Abdel-Hafeez EH, Kikuchi M, Watanabe K, Ito T, Yu C, Chen H, Nara T, Arakawa T, Aoki Y, Hirayama K
  • Journal Title: Parasitol Int 58(1) Pages: 36-44
  • NAID: 10025329984
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Proteome approach for identification of schistosomiasis japonica vaccine candidate antigen (2009)
  • Author(s): Abdel-Hafeez EH, Kikuchi M, Watanabe K, Ito T, Yu C, Chen H, Nara T, Arakawa T, Aoki Y, Hiravama K.
  • Journal Title: Parasitol Int 58(1) Pages: 36-44
  • NAID: 10025329984
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Structures of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase complexed with substrates and products : Atomic resolution insights into mechanisms of dihydroorotate oxidation and fumarate reduction (2008)
  • Author(s): Inaoka DK, Sakamoto K, Shimizu H, Shiba T, Kurisu G, Nara T, Aoki T, Kita K, Harada S
  • Journal Title: Biochemistry 47(41) Pages: 10881-10891
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolutionary analysis of synteny and gene fusion for pyrimidine biosynthetic enzymes in Euglenozoa : An extraordinary gap between kinetoplastids and diplonemids (2008)
  • Author(s): Makiuchi T, Annoura T, Hashimoto T, Murata E, Aoki T, Nara T
  • Journal Title: Protist 159(3) Pages: 459-470
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Pulmonary paragonimiasis with coincidental malignant mesothelioma (2008)
  • Author(s): Yamazaki M, Ohwada A, Miyaji A, Yamazaki H, Nara T, Hirai S, Fujii H, Uekusa T, Suzuki M, Iwase A, Takahashi K
  • Journal Title: Intern Med 47(11) Pages: 1027-1031
  • NAID: 130000078662
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Pulmonary paragonimiasis with coincidental malignant mesothelioma (2008)
  • Author(s): Yamazaki M, Ohwada A, Miyaji A, Yamazaki H, Nara T, Hirai s, Fujii H, Uekusa T, Suzuki M, Iwase A, Takahashi K
  • Journal Title: Intern Med 47(11) Pages: 1027-1031
  • NAID: 130000078662
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Structures of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase complexed with substrates and products : Atomic resolution insights into mechanisms of dihvdroorotate oxidation and fumarate reduction (2008)
  • Author(s): Inaoka DK, Sakamoto K, Shimizu H, Shiba T, Kurisu G, Nara T, Aoki T, Kita K, Harada S
  • Journal Title: Biochemistry 47(41) Pages: 10881-10891
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dihydroorotate dehydrogenase arises from novel fused gene product with aspartate carbamoyltransferase in Bodo saliens (2007)
  • Author(s): Annoura T, Sariego I, Nara T, Makiuchi T, Fujimura T, Taka H, Mineki R, Murayama K, Aoki T
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun 358(1) Pages: 253-258
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Occurrence of multiple, independent gene fusion events for the fifth and sixth enzymes of pyrimidine biosynthesis in different eukaryotic groups (2007)
  • Author(s): Makiuchi T, Nara T, Annoura T, Hashimoto T, and Aoki T
  • Journal Title: Gene 394 Pages: 78-86
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Antibody isotype responses to paramyosin, a vaccine candidate for schistosomiasis, and their correlations with resistance and fibrosis in patients infected with Schistosoma japonicum in Leyte, the Philippines (2007)
  • Author(s): Nara T, Iizumi K, Ohmae H, Sy O, Tsubota S, Inaba Y, Tsubouchi A, Tanabe M, Kojima S, Aoki T
  • Journal Title: Am J Trop Med Hyg 76(2) Pages: 384-391
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Occurrence of multiple, independent gene fusion events for the fifth and sixth enzymes of pyrimidine biosynthesis in different eukaryotic groups (2007)
  • Author(s): Makiuchi T, Nara T, Annours T, Hashimoto T, Aoki T
  • Journal Title: Gene 394 Pages: 78-86
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Dihydroorotate dehydrogenase arises from novel fused gene product with aspartate carbamoyltransferase in Bodo saliens (2007)
  • Author(s): Annoura T, Sariego I, Nara T, Makiuchi T, Fujimura T, Taka H, Mineki R, Murayama K, Aoki T
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun 358 Pages: 253-258
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Evolutionary analysis of synteny and gene fusion for pyrimidine biosyntheticenzymes in Euglenozoa:An extraordinary gap between kinetoplastids and diplonemids
  • Author(s): Makiuchi T, Annoura T, Hashimoto T, Murata E, Aoki T, Nara T
  • Journal Title: Protist (In press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] トリパノソーマクルージのジヒドロオロト酸脱水素酵素 : 立体構造に基づいて設計された新規阻害剤との複合体構造 (2009)
  • Author(s): 稲岡ダニエル健, ら、他15名
  • Organizer: 第78回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] トリパノソーマクルージのジヒドロオロト酸脱水素酵素 : 立体構造に基づいて設計された新規阻害剤との複合体構造 (2009)
  • Author(s): 稲岡ダニエル健ら, 他15名(9番目)
  • Organizer: 第78回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 千代田区
• [Presentation] トリパノソーマの固有オルガネラ"グリコソーム"の成立起原 : 近縁種ディプロネマ類におけるグリコソーム様オルガネラの探索 (2008)
  • Author(s): 牧内貴志、案浦健、橋本宗明、奈良武司、青木孝
  • Organizer: 第77回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 長崎
• [Presentation] Trypanosoma cruziジヒドロオロト酸脱水素酵素の結晶構造に基づいた薬剤設計 : 5-ハロゲン及び5-アルキル誘導体シリーズとの複合体構造 (2008)
  • Author(s): 稲岡ダニエル健, ら、他10名
  • Organizer: 第77回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 長崎
• [Presentation] 日本住血吸虫パラミオシン抗原を用いた粘膜ワクチンに関する研究 (2008)
  • Author(s): 原國哲也、菊地美穂子、奈良武司、宮田健、平山謙二、新川武
  • Organizer: 第77回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 長崎
• [Presentation] Lateral gene transfer plays a key role in establishing gene fusion in protists (2008)
  • Author(s): Nara T
  • Organizer: International Symposium on Protist Biology
  • Place of Presentation: Tsukuba
• [Presentation] トリパノソーマの固有オルガネラ“グリコソーム"の成立起原 : 近縁種デイプロネマ類におけるグリコソーム様オルガネラの探索 (2008)
  • Author(s): 牧内貴志, 案浦健, 橋本宗明, 奈良武司, 青木孝
  • Organizer: 第77回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 長崎市
• [Presentation] Trypanosoma cruziジヒドロオロト酸脱水素酵素の結晶構造に基づいた薬剤設計 : 5-ハロゲン及び5-アルキル誘導体シリーズとの複合体構造 (2008)
  • Author(s): 稲岡ダニエル健ら, 他10名(7番目)
  • Organizer: 第77回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 長崎市
• [Presentation] 日本住血吸虫パラミオシン抗原を用いた粘膜ワクチンに関する研究 (2008)
  • Author(s): 原國哲也, 菊地美穂子, 奈良武司, 宮田健, 平山謙二, 新川武
  • Organizer: 第77回日本寄生虫学会大会
  • Place of Presentation: 長崎市
• [Presentation] Dihydroorotate dehydrogenase of Trypanosoma cruzi:Anewchemotherapeutic target against Chagas'disease (2007)
  • Author(s): Nara T, Annours T, Sariego I, Inaoka DK, Kita K, Aoki T
  • Organizer: 第8回中米カリブ寄生虫学熱帯医学会議/第7回キューバ微生物寄生虫学会議合同会議
  • Place of Presentation: キューバ、ハバナ
  • Year and Date: 2007-12-05
• [Presentation] トリパノソーマ科原虫の固有オルガネラ"グリコソーム"の成立起原の解明 (2007)
  • Author(s): 牧内 貴志、案 浦健、橋本 宗明、奈良 武司、青木 孝
  • Organizer: 第6回分子寄生虫・マラリアフォーラム
  • Place of Presentation: 愛媛県松山市
  • Year and Date: 2007-10-27
• [Presentation] 木孝フィリピン日本住血吸虫症患者におけるパラミオシンに対する抗体応答と病態との相関 (2007)
  • Author(s): 奈良 武司、飯泉 恭一、大前 比呂思、Orlando S. Sy、坪田 聡一、稲葉 裕、坪内 暁子、田邉 将信、小島 荘明、青木 孝
  • Organizer: 第48回日本熱帯医学会
  • Place of Presentation: 大分県別府市
  • Year and Date: 2007-10-11
• [Presentation] フィリピン日本住血吸虫症患者におけるパラミオシンに対する抗体応答と病態との相関 (2007)
  • Author(s): 奈良 武司、飯泉 恭一、大前 比呂思、Orlando S. Sy、坪田 聡一、稲葉 裕、坪内 暁子、田邉 将信、小島 荘明、青木 孝
  • Organizer: 第67回日本寄生虫学会東日本支部会
  • Place of Presentation: 東京都文京区
  • Year and Date: 2007-10-06
• [Presentation] トリパノソーマにおける遺伝子水平転移と寄生適応 (2007)
  • Author(s): 奈良 武司
  • Organizer: 日本進化学会第9回京都大会ワークショップ
  • Place of Presentation: 京都市左京区
  • Year and Date: 2007-08-31
• [Presentation] Dihydroorotate dehydrogenase of Trypanosoma cruzi : A new chemotherapeutic target against Chagas' disease (2007)
  • Author(s): Nara T, Annoura T, Sariego I, Inaoka DK, Kita K, Aoki T
  • Organizer: 第8回中米カリブ寄生虫学熱帯医学会議/第7回キューバ微生物学寄生虫学会議合同会議
  • Place of Presentation: キューバ、ハバナ
• [Presentation] Dihydroorotate dehydrogenase arises from novel fused gene product with aspartate carbamoyltransferase in Bodo saliens (2007)
  • Author(s): Annoura T, Sariego I, Nara T, Makiuchi T, Fujimura T, Taka H, Mineki R, Murayama K, Aoki T
  • Organizer: 第8回中米カリブ寄生虫学熱帯医学会議/第7回キューバ微生物学寄生虫学会議合同会議
  • Place of Presentation: キューバ、ハバナ
• [Presentation] フィリピン日本住血吸虫症患者におけるパラミオシンに対する抗体応答と病態との相関 (2007)
  • Author(s): 奈良武司、飯泉恭一、大前比呂思、Orlando S. Sy、坪田聡一、稲葉裕、坪内暁子、田邉将信、小島荘明、青木孝
  • Organizer: 第67回日本寄生虫学会東日本支部会
  • Place of Presentation: 東京
• [Presentation] フィリピン日本住血吸虫症患者におけるパラミオシンに対する抗体応答と病態との相関 (2007)
  • Author(s): 奈良武司、飯泉恭一、大前比呂思、Orlando S. Sy、坪田聡一、稲葉裕、坪内暁子、田邉将信、小島荘明、青木孝
  • Organizer: 第48回日本熱帯医学会
  • Place of Presentation: 大分
• [Presentation] トリパノソーマ科原虫の固有オルガネラ"グリコソーム"の成立起原の解明 (2007)
  • Author(s): 牧内貴志、案浦健、橋本宗明、奈良武司、青木孝
  • Organizer: 第6回分子寄生虫・マラリアフォーラム
  • Place of Presentation: 松山
• [Presentation] トリパノソーマにおける遺伝子水平転移と寄生適応 (2007)
  • Author(s): 奈良武司
  • Organizer: 日本進化学会第9回京都大会ワークショップ
  • Place of Presentation: 京都
• [Book] トリパノソーマ. バイオセーフティの事典第8章 : 病原微生物の特性と対策 (2008)
  • Author(s): 奈良武司
  • Publisher: みみずく舎/医学評論社
• [Book] 赤痢アメーバ. 感染症診断の迅速化を目指して-感染症検査のPOCTを中心に-. 臨床と微生物34(増) (2007)
  • Author(s): 奈良武司
  • Publisher: 近代出版
• [Book] マラリア. 感染症診断の迅速化を目指して-感染症検査のPOCTを中心に-. 臨床と微生物34(増) (2007)
  • Author(s): 奈良武司
  • Publisher: 近代出版
• [Book] 赤痢アメーバ.感染症診断の迅速化を目指して-感染症検査のPOCTを中心に-臨床と微生物 (2007)
  • Author(s): 奈良 武司
  • Total Pages: 4
  • Publisher: 近代出版
• [Book] マラリア.感染症診断の迅速化を目指して-感染症検査のPOCTを中心に-臨床と微生物 (2007)
  • Author(s): 奈良 武司
  • Total Pages: 3
  • Publisher: 近代出版
• [Book] アメーバ症および自由生活性アメーバ感染症. ハリソン内科学原著第17版、202章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] マラリア. ハリソン内科学原著第17版、203章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] バベシア症. ハリソン内科学原著第17版、204章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] リーシュマニア症. ハリソン内科学原著第17版、205章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] トリパノソーマ症. ハリソン内科学原著第17版、206章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] Toxoplasma感染症. ハリソン内科学原著第17版、207章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] 消化管内原虫感染症とトリコモナス症. ハリソン内科学原著第17版、208章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] 住血吸虫症とその他の吸虫感染症. ハリソン内科学原著第17版、212章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] 条虫類. ハリソン内科学原著第17版、213章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] マラリアおよびバベシア症の血液塗抹アトラス. ハリソン内科学原著第17版、e18章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] シャーガス病Chagas' Disease : 診断と管理の進歩. ハリソン内科学原著第17版、e37章
  • Author(s): 奈良武司訳
  • Publisher: メディカル・サイエンス・インターナショナル(印刷中)
• [Book] 寄生虫症.感染症.図説臨床看護医学(DVD-ROM版)
  • Author(s): 奈良 武司
  • Publisher: 同朋舎メディアプラン
• [Book] トリパノソーマ.病原微生物の概要.バイオセーフティの事典-病原微生物とハザード対策の実際
  • Author(s): 奈良 武司
  • Publisher: 医学評論社
• [Remarks]
  • URL: http://www.juntendo.ac.jp/graduate/laboratory/labo/kiseityu/k6.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.juntendo.ac.jp/graduate/laboratory/labo/kiseityu/k6.html