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Search for genes associated with the severest form of rheumatoid arthritis

Research Project

Project/Area Number 19591164
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field 膠原病・アレルギー・感染症内科学
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

OHMURA Koichiro  Kyoto University, 医学研究科, 助教 (40432372)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山田 亮  東京大学医科学研究所, ヒトゲノム解析センター・ゲノム機能解析分野, 准教授 (50301106)
島田 浩太  (独)国立病院機構, 相模原病院・リウマチ科, 流動研究員 (10392995)
Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) YAMADA Ryo  東京大学, 医科学研究所, 准教授 (50301106)
SHIMADA Kohta  独立行政法人国立病院機構, 相模原病院, 流動研究員 (10392995)
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2007: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Keywords関節リウマチ / SNP / ムチランス / 疾患関連遺伝子 / 重症化 / 全ゲノム関連解析
Research Abstract

関節リウマチ(RA)の重症化に関連する遺伝子を検索するために、最重症RAと最軽症RA患者の遺伝子を比較した。候補遺伝子は絞らずすべての遺伝子を対象とした全ゲノム解析とし、DNAチップを用いた解析を行った。3病院から計78例の最重症型、計64例の最軽症型RA検体が収集されSNPタイピングおよび解析を行ったが、症例数が十分でなく有意差を認める遺伝子発見には至らなかった。そこで、収集した全RA患者(3195例)と健常人(3044例)のDNAを用いてRAの発症に関わる遺伝子を同様に全ゲノム関連解析にて検索したところ、これまで既報のHLA, PADI4遺伝子のほかに第15, 18, 21染色体に関連部位を発見した。

Report

(3 results)
  • 2008 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2008 2007

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] 抗CCP抗体の臨床的意義2008

    • Author(s)
      大村浩一郎、三森経世
    • Journal Title

      炎症と免疫 16巻

      Pages: 215-222

    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Journal Article] 関節リウマチの2つのサブセット2008

    • Author(s)
      大村浩一郎
    • Journal Title

      リウマチ科 40巻

      Pages: 309-315

    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Journal Article] Primer : SNP-associated studies and what they can teach us2008

    • Author(s)
      Yamada R
    • Journal Title

      Nature clinical practice 4(4)

      Pages: 210-7

    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Journal Article] Functional SNPs in CD244 increase the risk of rheumatoid arthritis in a Japanese population2008

    • Author(s)
      Suzuki A, Yamada R, Kochi Y, Sawada T, Okada Y, Matsuda K, et.al.
    • Journal Title

      Nat Genet 40(10)

      Pages: 1224-9

    • Related Report
      2008 Final Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 抗CCP抗体の臨床的意義2008

    • Author(s)
      大村浩一郎, 三森経世
    • Journal Title

      炎症と免疫 16

      Pages: 215-222

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Journal Article] 抗CCP抗体の臨床的意義2008

    • Author(s)
      大村浩一郎、三森経世
    • Journal Title

      炎症と免疫 16

      Pages: 79-85

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Journal Article] Lessons from a Genomewide Association Study of Rheumatoid Arthritis2007

    • Author(s)
      Yamamoto K, Yamada R.
    • Journal Title

      N Engl J Med 357(12)

      Pages: 1250-1

    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Journal Article] Mechanisms of disease : genetics of rheumatoid arthritis-ethnic differences in disease-associated genes2007

    • Author(s)
      Yamada R, Yamamoto K.
    • Journal Title

      Nature clinical practice 3(11)

      Pages: 644-50

    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] 日本人、白人のリウマチ検体を用いたゲノムワイド相関解析2008

    • Author(s)
      寺尾知可史、大村浩一郎, 他
    • Organizer
      「テーラーメイド医療を目指したゲノム情報活用基盤技術」第4回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-08-01
    • Related Report
      2008 Final Research Report
  • [Presentation] 日本人、白人のリウマチ検体を用いたゲノムワイド相関解析2008

    • Author(s)
      寺尾知可史, 山田亮, 他
    • Organizer
      「テーラーメイド医療を目指したゲノム情報活用基盤技術」第4回公開シンポ
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-08-01
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本人RA患者を用いたTRAF1/C5遺伝子の多型と疾患感受性の検討2008

    • Author(s)
      寺尾知可史、大村浩一郎, 他
    • Organizer
      第52回日本リウマチ学会総会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2008-04-20
    • Related Report
      2008 Annual Research Report 2008 Final Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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