Exhaustive methylome analysis to identify the factor of prognosis of osteosarcoma

• Project/Area Number: 19591721
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Orthopaedic surgery
• Research Institution: Kyoto University
• Principal Investigator: AOYAMA Tomoki Kyoto University, 再生医科学研究所, 助教 (90378886)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): TOGUCHIDA Junya 京都大学, 再生医科学研究所, 教授 (40273502)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000); Fiscal Year 2008: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000); Fiscal Year 2007: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
• Keywords: 骨肉腫 / メチローム / M1 / メチル化 / エピゲノム

Research Abstract

骨肉腫の治療成績は飛躍的に進歩し、専門施設における5年生存率は約70%まで向上してきた。しかし最近10年間での進歩はなく、残る30%は症例の既存の治療法に対して抵抗性である。さらに初診時にすでに遠隔転移を生じている症例(以後M1症例)の予後は著しく不良であり、5年生存率は10-40%にまで低下する。この見地から、これまでM1症例の生物学的特徴について、ゲノムレベルのいくつかの研究がなされているが未だ共通した特質は明らかにされていない。本研究では近年発生、癌化、分化へ深く関与していることが明らかにされつつあるDNAメチル化に着目し、これまで数個の遺伝子について断片的に行われてきた解析を、ゲノム全体のメチル化プロファイル(以下メチロームと称する)の解析を通して、骨肉腫M1症例の特質を解明することを行った。

Research Products

• [Journal Article] Inverse correlation of the up-regulation of FZD10 expression and the activation of beta-catenin in synchronous colorectal tumors (2009)
  • Author(s): Nagayama S, Yamada E, Kohno Y, Aoyama T, Fukukawa C, Kubo H, Watanabe G, Katagiri T, Nakamura Y, Sakai Y, Toguchida J
  • Journal Title: Cancer Sci 100 Pages: 405-12
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Neuronal differentiation of synovial sarcoma and its therapeutic application (2008)
  • Author(s): Ishibe T, Nakayama T ,Aoyama T, Nakamura T, Toguchida J
  • Journal Title: Clin Orthop Relat Res 466 Pages: 2147-55
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cell-specific epigenetic regulation of ChM-I gene expression : crosstalk between DNA methylation and histone acetylation (2008)
  • Author(s): Aoyama T, Okamoto T, Kohno Y, Fukiage K, Otsuka S, Furu M, Ito K, Jin Y, Nagayama S, Nakayama T, Nakamura T, Toguchida J
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun 365 Pages: 124-30
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Expression of vascular cell adhesion molecule-1 indicates the differentiation potential of human bone marrow stromal cells (2008)
  • Author(s): Fukiage K, Aoyama T Nakamura T, , Shibata KR, Otsuka S, Furu M, Kohno Y, Ito K, Jin Y, Fujita S, Fujibayashi S, Neo M, Nakayama T, Toguchida J
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun 365(3) Pages: 406-12
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Neuronal differentiation of synovial sarcoma and its therapeutic application. (2008)
  • Author(s): Ishibe T, Nakayama T, Aoyama T, Nakamura T, Toguchida J.
  • Journal Title: Clin Orthop Relat Res. 466 Pages: 2147-55
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cell-specific epigenetic regulation of ChM-I gene expression : crosstalk between DNA methylation and histone acetylation. (2008)
  • Author(s): Aoyama T, Okamoto T, Kohno Y, Fukiage K, Otsuka S, Furu M, Ito K, Jin Y, Nagayama S, Nakayama T, Nakamura T, Toguchida J.
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun. 365 Pages: 124-30
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cell-specific epigenetic regulation of ChM-I gene expression: crosstalk between DNA methylation and histone acetvlation. (2008)
  • Author(s): Aoyama T, Toguchida J., et. al.
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun. 365 Pages: 124-130
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] In vitro transformation of mesenchymal stem cells by oncogenic H-ras(Val12) (2007)
  • Author(s): Shima Y, Okamoto T, Aoyama T, Yasura K, Ishibe T, Nishijo K, Shibata KR, Kohno Y, Fukiage K, Otsuka S, Uejima D, Nakayama T, Nakamura T, Kiyono T, Toguchida J
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun 353(1) Pages: 60-66
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Expression of the p16INK4A gene is associated closely with senescence of human mesenchymal stem cells and is potentially silenced by DNA methylation during in vitro expansion (2007)
  • Author(s): Shibata KR, Aoyama T, Shima Y, Fukiage K, Otsuka S, Furu M, Kohno Y, Ito K, Fujibayashi S, Neo M, Nakayama T, Nakamura T, Toguchida J
  • Journal Title: Stem Cells 25(9) Pages: 2371-82
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Inverse correlation of the up-regulation of FZD10 expression and the activation of beta-catenin in synchronous colorectal tumors.
  • Author(s): Nagayama S, Yamada E, Kohno Y, Aoyama T, Fukukawa C, Kubo H, Watanabe G, Katagiri T, Nakamura Y, Sakai Y, Toguchida J.
  • Journal Title: Cancer Sci. (In Press)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 軟部肉腫におけるRas遺伝子群の点突然変異解析 (2008)
  • Author(s): 金永輝、青山朋樹、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第31回近畿肉腫研究会
  • Place of Presentation: 豊岡市
  • Year and Date: 2008-12-13
• [Presentation] 肉腫におけるras遺伝子の変異解析 (2008)
  • Author(s): 金永輝、青山朋樹、布留守敏、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第67回日本癌学会学術集会
  • Place of Presentation: 名古屋市
  • Year and Date: 2008-10-28
• [Presentation] 肉腫転移関連因子C7059の機能解析および治療標的としての可能性の探索 (2008)
  • Author(s): 布留守敏、長山聡、梶田洋一郎、青山朋樹、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第41回日本整形外科学会骨・軟部腫瘍学術集会
  • Place of Presentation: 浜松市
  • Year and Date: 2008-07-17
• [Presentation] 分化誘導プロファイルを用いた肉腫細胞の起源へのアプローチ (2008)
  • Author(s): 青山朋樹、大塚聖視、石部達也、布留守敏、吹上謙一、光野芳樹、伊藤錦哉、金永輝、梶田洋一郎、那須 輝、長山聡、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第41回日本整形外科学会骨・軟部腫瘍学術集会
  • Place of Presentation: 浜松市
  • Year and Date: 2008-07-17
• [Presentation] 内因性ヒストンテール修飾因子によるコンドロモジュリン-I遺伝子発現制御機構の解析 (2008)
  • Author(s): 青山朋樹、光野芳樹、大塚聖視、吹上謙一、布留守敏、伊藤錦哉、長山聡、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第21回日本軟骨代謝学会
  • Place of Presentation: 京都市
  • Year and Date: 2008-03-21
• [Presentation] 骨髄間質細胞におけるCD106/VCAM-1の発現制御と機能意義 (2008)
  • Author(s): 吹上謙一、青山朋樹、柴田弘太郎ロバーツ、大塚聖視、布留守敏、伊藤錦哉、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第7回日本再生医療学会総会
  • Place of Presentation: 名古屋市
  • Year and Date: 2008-03-13
• [Presentation] 肉腫転移関連因子C7059の機能解析 (2008)
  • Author(s): 布留守敏、長山聡、梶田洋一郎、青山朋樹、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第23回日本整形外科学会基礎学術集会
  • Place of Presentation: 京都市
• [Presentation] 肉腫における転移関連新規因子C7059の機能解析 (2008)
  • Author(s): 布留守敏、長山聡、梶田洋一郎、青山朋樹、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: 第67回日本癌学会学術集会
  • Place of Presentation: 名古屋市
• [Presentation] 肉腫において組織幹細胞としての特質は癌幹細胞としての特質に連関するものなのか (2008)
  • Author(s): 戸口田淳也、大塚聖視、石部達也、青山朋樹
  • Organizer: 第67回日本癌学会学術集会
  • Place of Presentation: 名古屋市
• [Presentation] 大腸癌にて高発現している新規遺伝子の免疫組織化学染色による発現解析 (2008)
  • Author(s): 長山聡、布留守敏、青山朋樹、久保肇、渡辺剛、片桐豊雅、中村祐輔、戸口田淳也
  • Organizer: 第67回日本癌学会学術集会
  • Place of Presentation: 名古屋市
• [Presentation] Intrinsic epigenetic regulators determine the expression of lineage-specific gene in mesenchymal stem cells (2008)
  • Author(s): Tomoki Aoyama, Kenichi Fukiage, Kotaro R Shibata, Seiji Otsuka, Yoshiki Kohno, Kinya Ito, Yonghui Jin, Akira Nasu, Michiko Ueda, Satoshi Nagayama, Takashi Nakamura, Junya Toguchida
  • Organizer: ISSCR 6^<th> Annual Meeting
  • Place of Presentation: Philadelphia, USA
• [Presentation] 内因性ヒストンテール修飾因子によるコンドロモジュリン-I遺伝子発現制御機構の解析 (2007)
  • Author(s): 青山朋樹、光野芳樹、大塚聖視、吹上謙一、布留守敏、伊藤錦哉、長山聡、中山富貴、中村孝志、戸口田淳也
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜市
  • Year and Date: 2007-12-13
• [Presentation] 内因性ヒストンテール修飾因子によるコンドロモジュリン-I遺伝子発現制御機構の解析 (2007)
  • Author(s): 青山朋樹、戸口田淳也, 他
  • Organizer: BMB2007
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-13
• [Presentation] Junya Toguchida Multipledirectional differentiation property like mesenchymal stem cells of osteosarcomas in vitro and in vivo (2007)
  • Author(s): Seiji Otsuka, Tomoki Aoyama, Roberts Kotaro Shibata, Yasuko Shima, Kenichi Fukiage, Tomitaka Nakayama, Takashi Nakamura, Takanobu Otsuka
  • Organizer: CTOS 13th Annual Meeting
  • Place of Presentation: Seattle, USA
  • Year and Date: 2007-11-01
• [Presentation] Junya Toguchida Snail is a negative regulator controlling the construction of epithelial structure in SS (2007)
  • Author(s): Yoshiki Kohno, Satoshi Nagayama, Tomoki Aoyama Nakamura, Tomitaka Nakayama
  • Organizer: CTOS 13th Annual Meeting
  • Place of Presentation: Seattle, USA
  • Year and Date: 2007-11-01
• [Presentation] Junya Toguchida Isolation and functinal analysis of a novel protein assoicated with the distant metastasis of spindle cell sarcomas (2007)
  • Author(s): Moritoshi Furu, Satoshi Nagayama, Tatsuya Ishibe, Yasuko Shima, Daisuke, Uejima, Tomoki Aoyama, Tomitaka Nakayama, Takashi Nakamura, Toyomasa Katagiri, Yusuke Nakamura
  • Organizer: CTOS 13th Annual Meeting
  • Place of Presentation: Seattle, USA
  • Year and Date: 2007-11-01
• [Book] 再生医療に用いられる細胞・再生組織の評価と安全性 (2007)
  • Author(s): 青山朋樹、戸口田淳也
  • Total Pages: 332
  • Publisher: シーエムシー出版
• [Remarks]
  • URL: http://www.frontier.kyoto-u.ac.jp/ca02/index-j.htm