Development and application of the microarray for the isolation of target genes of transcriptional regulators in periodontal pathogens

• Project/Area Number: 19592139
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 一般
• Research Field: Morphological basic dentistry
• Research Institution: Aichi Gakuin University
• Principal Investigator: NISHIKAWA Kiyoshi Aichi Gakuin University, 歯学部, 講師 (50340146)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 佐藤 啓子 長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (70410579)
• Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha): SATO Keiko 長崎大学, 大学院・医歯薬学総合研究科, 助教 (70410579)
• Research Collaborator: NIWA Daisuke 愛知学院大学, 歯学部, 大学院生 ; MARGARET Duncan 米国フォーサイス研究所, 上級主任研究員
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2008: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2007: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
• Keywords: 歯周病原細菌 / 転写因子 / 二成分制御系 / 標的遺伝子 / ゲノムタイリングアレイ / クロマチン免疫沈降法 / ChIP-on-chip / センサーキナーゼ / ヒスチジンキナーゼ / マイクロアレイ

Research Abstract

歯周病原細菌P. gingivalis標準株の全ゲノム配列を搭載した新規マイクロアレイとクロマチン免疫沈降法とを組合わせた解析手法を用い、本菌の主要病原因子FimA線毛の生合成を調節する二成分制御系転写因子FimRのゲノム上の結合配列を特定した。更に線毛非形成株W83では、FimRにリン酸基を供与するセンサータンパク質FimSがATP結合領域の一部を欠失した機能不全型であることをも明らかにした。

Research Products

• [Journal Article] Surface components of Porphyromonas gingivalis (2009)
  • Author(s): Yoshimura, F., Murakami, Y., Nishikawa, K., Hasegawa, Y., and Kawaminami, S.
  • Journal Title: Journal of Periodontal Research 44 Pages: 1-12
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 歯周病原細菌Porphyromonas gingivalisの線毛非形成株に認められるFimSヒスチジンキナーゼの機能低下とfimS遺伝子の変異 (2009)
  • Author(s): 西川清
  • Journal Title: 第38回東海乳酸菌研究会研究報告書 38 Pages: 37-42
• [Journal Article] Surface components of Porphyromonas gingivalis (2009)
  • Author(s): Fuminobu Yoshimura, et al
  • Journal Title: Journal of Periodontal Research 44 Pages: 1-12
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 歯周病原細菌Porphyromonas gingivalisの線毛非形成株に認められるFimSヒスチジンキナーゼの機能低下とfimS遺伝子の変異 (2009)
  • Author(s): 西川 清
  • Journal Title: 第38回東海乳酸菌研究会研究報告書 38 Pages: 37-42
• [Journal Article] Surface components of Porphyromonas gingivalis (2008)
  • Author(s): Fuminobu Yoshimura, et. al.
  • Journal Title: Journal of Periodontal Research (投稿中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Characterization of RagA and RagB in Porphyromonas gingivalis : study using gene-deletion mutants (2007)
  • Author(s): Nagano, K., Murakami, Y., Nishikawa, K., Sakakibara, J., Shimozato, K. and Yoshimura, F.
  • Journal Title: Journal of Medical Microbiology 56 Pages: 1536-1548
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The RprY response regulator of Porphyromonas gingivalis (2007)
  • Author(s): Duran-Pinedo, A., Nishikawa, K., and Duncan, M.J.
  • Journal Title: Molecular Microbiology 64 Pages: 1061-1074
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The RprY response regulator of Porphyromonas gingivalis (2007)
  • Author(s): Ana E. Duran-Pinedo, et. al.
  • Journal Title: Molecular Microbiology 64 Pages: 1061-1074
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 歯周病原細菌Porphyromonas gingivalisの線毛非形成株に認められるFimSヒスチジンキナーゼの機能低下とfimS遺伝子の変異 (2009)
  • Author(s): 西川清
  • Organizer: 平成20年度東海乳酸菌研究会研究報告会
  • Place of Presentation: 中日パレス(名古屋)
  • Year and Date: 2009-02-07
• [Presentation] 歯周病原細菌Porphyromonas gingivalisの線毛非形成株に認められるFimSヒスチジンキナーゼの機能低下とfimS遺伝子の変異 (2009)
  • Author(s): 西川 清
  • Organizer: 平成20年度 東海乳酸菌研究会 研究報告会
  • Place of Presentation: 中日パレス(名古屋)
  • Year and Date: 2009-02-07
• [Presentation] Proteomic analyses of a two-component regulator mutant of Tannerella forsythensis (2008)
  • Author(s): Niwa, D., Nishikawa, K., Murakami, Y., Nakamura, H., and Yoshimura, F.
  • Organizer: The 56th Annual Meeting of Japanese Association for Dental Research
  • Place of Presentation: Aichi-Gakuin University(Nagoya)
  • Year and Date: 2008-11-30
• [Presentation] Tannerella forsythensisレスポンスレギュレーター変異株のプロテオーム解析 (2008)
  • Author(s): 丹羽大介, 西川清, 中村洋
  • Organizer: 第129回日本歯科保存学会2008年度秋季学術大会
  • Place of Presentation: 富山国際会議場(富山)
  • Year and Date: 2008-11-06
• [Presentation] 微生物部門ワークショップ「口腔病原細菌のゲノム解析とその応用」Porphyromonas gingivalis線毛の発現調節機構 (2008)
  • Author(s): 西川清
  • Organizer: 第50回歯科基礎医学会学術大会および総会
  • Place of Presentation: TOC有明コンベンションホール(東京)
  • Year and Date: 2008-09-25
• [Presentation] Generation and proteomic analysis of a two-component regulator mutant of Tannerella forsythensis (2008)
  • Author(s): Niwa, D., Nishikawa, K., Murakami, Y., Nakamura, H., and Yoshimura, F.
  • Organizer: American Society for Microbiology 108^<th> General Meeting, Abstract H-009
  • Place of Presentation: Boston Convention & Exhibition Center(Boston, MA, USA)
  • Year and Date: 2008-06-02
• [Presentation] Generation and proteomic analysis of a two - Component regulator mutant of Tannerella forsythensis. (2008)
  • Author(s): Daisuke Niwa, et al
  • Organizer: American Society for Microbiology 108^<th> General Meeting
  • Place of Presentation: Boston Convention & Exhibition Center (Boston, MA, USA)
  • Year and Date: 2008-06-02
• [Presentation] Porphyromonas gingivalisのMfa1線毛構成成分mfa2の機能解析 (2008)
  • Author(s): 長谷川義明, 西川清, 佐藤啓子, 村上幸孝, 中村洋, 吉村文信
  • Organizer: 第81回日本細菌学会総会
  • Place of Presentation: 京都国際会館(京都)
  • Year and Date: 2008-03-24
• [Presentation] Porphyromonas gingivalis鉄輸送関連タンパク質 (2007)
  • Author(s): 佐藤啓子, 西川清, 大野公稔, 雪竹英治, 村上幸孝, 中山浩次, 吉村文信
  • Organizer: 第49回歯科基礎医学会学術大会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌)
  • Year and Date: 2007-08-31
• [Presentation] Tannerella forsythensisの2成分制御系変異株作成と表現型の解析 (2007)
  • Author(s): 丹羽大介, 西川清, 村上幸孝, 中村洋, 吉村文信
  • Organizer: 第49回歯科基礎医学会学術大会
  • Place of Presentation: 北海道大学(札幌)
  • Year and Date: 2007-08-31
• [Presentation] The key membrane proteins for Porphyromonas gingivalis fimbriation (2007)
  • Author(s): Nishikawa, K., Duncan, M.J., and Yoshimura, F. FimX-Y
  • Organizer: American Society for Microbiology 107^<th> General Meeting
  • Place of Presentation: Metro Toronto Convention Centre(Toronto, Canada)
  • Year and Date: 2007-05-25
• [Presentation] FimX-Y: The key membrane proteins for Porphyromonas gingivalis fimbriation. (2007)
  • Author(s): Kiyoshi Nishikawa, et. al.
  • Organizer: American Society for Microbiology 107th General Meeting
  • Place of Presentation: Metro Toronto Convention Centre, Toronto, Canada
  • Year and Date: 2007-05-25