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ENUミュージェネシスにおける高速突然変異検出法

Research Project

Project/Area Number 19650106
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Laboratory animal science
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

真下 知士  Kyoto University, 医学研究科, 産学官連携准教授 (80397554)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中島 玲子  大学共同利用機関法人情報システム研究機構, 融合プロジェクト, 特任研究員 (50372595)
Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Keywordsラット / ミュータジェネシス / トランスポゾンMu / スクリーニング / ポジショナルクローニング / ゲノムDNA / メッセンジャーRNA
Research Abstract

ラットENUミュータジェネシスにより作製された多数のミュータント動物の中から、標的遺伝子に点突然変異の導入された個体のみを効率的に検出するスクリーニング方法の開発を目的とした。
(1)ENU誘発突然変異動物群のゲノムDNAスクリーニング法の開発
我々はこれまで、約5000匹のENU誘発突然変異ラットのDNAバンクと精子バンクをアーカイブとして保存した。スクリーニング方法についての以下の点を検討した。1)蛍光標識Mu-END DNAによるMu反応。2)自動キャピラリー電気泳動装置(ABI3100)による電気泳動法。3)コンピューター解析により標的遺伝子の点突然変異保有個体を検出方法。以上の結果、一つの標的遺伝子(10プライマーセット)を対象にラットミュータントアーカイブ5000をスクリーニングするのに、一ヶ月(約20日)で実施可能な高速スクリーニング方法(MuT-POWER)を開発することができた。
(2)突然変異動物個体のメッセンジャーRNAスクリーニング
標的遺伝子合成cDNAプローブとENU誘発突然変異個体由来メッセンジャーRNA (mRNA)をハイブリダイゼーションさせ、Mu反応により点突然変異遺伝子を同定する方法について検討した。ENU誘発突然変異個体から十分量のmRNAを抽出して、標的遺伝子cDNAプローブとハイブリダイゼーションさせ、Mu反応で検討したが、検出感度の限界のために未知の点突然変異を効率的に検出することができなかった。本mRNA法については、引き続き感度を上げるなどの検討が必要である。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (29 results)

All 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (13 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (15 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Rat resources in biomedical research.2009

    • Author(s)
      Mashimo T, Serikawa T
    • Journal Title

      Current Phamaceutical Biotechnology 10(2)

      Pages: 214-220

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  • [Journal Article] An informative set of SSLP markers and genomic profiles in the rat MHC, the RT1 complex.2009

    • Author(s)
      Takagi Y, et al., 他7人, 6番目
    • Journal Title

      Immunogenetics 61(3)

      Pages: 189-197

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  • [Journal Article] Innate resistance to flavivirus infections and the functions of 2'-5' oligoadenylate synthetases.2008

    • Author(s)
      Mashimo T, Simon D, Guenet JL
    • Journal Title

      Current Topics in Microbiology and Immunology 321

      Pages: 85-100

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    • Author(s)
      Mashimo T, et al., 他3人
    • Journal Title

      Neuroscience Research 61(S1)

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  • [Journal Article] An ENU-induced mutant archive for gene-targeting in rats.2008

    • Author(s)
      Mashimo T, et al., 他9人
    • Journal Title

      Nature Genetics 40(5)

      Pages: 514-515

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  • [Journal Article] Progress and prospects in rat genetics : a community view.2008

    • Author(s)
      Aitman TJ, et al., 他30人, 18番目
    • Journal Title

      Nature Genetics 40(5)

      Pages: 516-522

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      Saar K, et al., 他48人, 30番目
    • Journal Title

      Nature Genetics 40(5)

      Pages: 560-566

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    • Author(s)
      Voigt B, et. al.
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      Physiological Genomics 32(3)

      Pages: 335-342

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    • Author(s)
      Mashimo T, et. al.
    • Journal Title

      Physiological Genomics 30

      Pages: 95-101

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    • Author(s)
      滝澤明子、他
    • Journal Title

      実験動物技術 42(1)

      Pages: 35-40

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  • [Journal Article] Scnla mutant rats established by gene-driven ENU mutagenesis.2007

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      Mashimo T, et. al.
    • Journal Title

      Neuroscience Research 58(S1)

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      Mashimo T, et. al.
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      Saar K, et. al.
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      Nature Genetics (in press)

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    • Author(s)
      真下知士, 芹川忠夫
    • Organizer
      第44回高血圧関連疾患モデル学会学術総会
    • Place of Presentation
      島根
    • Year and Date
      2008-11-22
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  • [Presentation] ENUミュータジェネシスを利用した標的遺伝子変異ラツトの作製方法2008

    • Author(s)
      真下知土
    • Organizer
      第11回生命工学トレーニングコース
    • Place of Presentation
      金沢
    • Year and Date
      2008-11-12
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  • [Presentation] KURMA : an ENU-induced mutant archive for gene-targeting in rats., Prasue, Czech Republic, Nov 2-5, 20082008

    • Author(s)
      Mashimo T, et al., 他4人
    • Organizer
      22nd International Mammalian Genome Conference
    • Place of Presentation
      Prague, Czech Republic
    • Year and Date
      2008-11-04
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  • [Presentation] Gene-targeted rat models of human diseases developed by ENU mutagenesis.2008

    • Author(s)
      Mashimo T, et al., 他6人
    • Organizer
      The 3rd AFLAS Congress
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2008-09-29
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  • [Presentation] 標的遺伝子変異ラット作製のためのENUミュータントアーカイブ2008

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      高温耐性ラットシンポジウム2008
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2008-09-13
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  • [Presentation] ユビキチンE3リガーゼのミスセンス変異により小脳性運動失調をおこすマウス2008

    • Author(s)
      真下知士, 他3人
    • Organizer
      Neuro2008 (第31回神経科学大会)
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2008-07-11
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  • [Presentation] TBLマウスの小脳性運動失調はユビキチンE3リガーゼのミスセンス変異に起因する2008

    • Author(s)
      真下知士, 他3人
    • Organizer
      第55回日本実験動物学会総会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2008-05-16
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  • [Presentation] ENUミュータジェネシスによる標的遺伝子変異ラットの開発2008

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第1回ラットリソースリサーチ研究会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2008-01-18
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  • [Presentation] Efficient generation of rat models of human diseases by gene driven ENU mutaenesis2007

    • Author(s)
      Mashimo T
    • Organizer
      The Jackson Laboratory Seminar,
    • Place of Presentation
      Maine, USA
    • Year and Date
      2007-12-10
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  • [Presentation] Gene-targeted rat models of human epilepsy efficiently developed by ENU mutagenesis.2007

    • Author(s)
      Mashimo T, et. al.
    • Organizer
      The 2007 meeting on Rat Genomics & Models
    • Place of Presentation
      New York, USA
    • Year and Date
      2007-12-09
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  • [Presentation] ENUミュータジェネシスにより作製したSCN1A遺伝子変異ラットの特徴について2007

    • Author(s)
      真下知士、他
    • Organizer
      第3回日本てんかん学会近畿地方会
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2007-11-17
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  • [Presentation] A missense mutation in the mouse gene encoding Hercl ubiquitin ligase results in Purkinje cells degeneration with severe ataxia.2007

    • Author(s)
      Mashimo T, et. al.
    • Organizer
      21st International Mammalian Genome Conference
    • Place of Presentation
      Kyoto
    • Year and Date
      2007-10-30
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  • [Presentation] ENUミュータジェネシスによる標的遺伝子改変ラットの作出方法2007

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第64回理研BRCセミナー
    • Place of Presentation
      筑波
    • Year and Date
      2007-06-15
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  • [Presentation] NBRPラットリソースのデータベース2007

    • Author(s)
      真下知士
    • Organizer
      第33回筑波実験動物研究会
    • Place of Presentation
      筑波
    • Year and Date
      2007-06-14
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  • [Presentation] ENUミュータジェネシスによるSCNIA遺伝子変異ラットの開発2007

    • Author(s)
      真下知士、他
    • Organizer
      第54回日本実験動物学会総会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2007-05-25
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      2007 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.anim.med.kyoto-u.ac.jp/serikawas%20Lab/03Publications.htm

    • Related Report
      2008 Annual Research Report

URL: 

Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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