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モデル微生物への細胞死スイッチの導入の試み

Research Project

Project/Area Number 19651034
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Environmental technology/Environmental materials
Research InstitutionToyohashi University of Technology

Principal Investigator

田中 照通  Toyohashi University of Technology, 工学部, 准教授 (30273337)

Project Period (FY) 2007 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2009: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Keywords細胞死 / 分子スイッチ / リボヌクレアーゼP / バイオリメディエーション / 微生物制御
Research Abstract

本申請研究では環境修復そのものの手法ではなく環境修復後の標的環境の正常化を目指している。その手法として環境修復に利用した生物を環境修復後に系から除去するための手法として、分子レベルで制御が可能な細胞死スイッチを構築し、それを道具として使用する微生物に導入することで環境修復と環境修復後の正常状態への復帰を目指す。これまでの研究では、細胞死スイッチのためのモデル系構築を目標とし、具体的には全生物において普遍的に存在し、かつ、必須の酵素であるリボヌクレアーゼPという酵素を細胞死のための分子スイッチとしての利用を検討している。
経過年度において酵素内のP3ドメインと呼ばれる部位だけでなく、新たにP12ドメインと呼ばれる部位を利用した酵素活性制御の系の構築が可能なことを明らかにしてきた。またこの部位を利用することでより酵素活性の制御が確実に行えることを種々の解析によって明らかにした。
本年度の成果としては、2つの部位を同時に標的とした酵素活性スイッチを構築することでより効率的な分子スイッチを構築できること、を明らかにした。
またこの研究を通して標的とした酵素の基質認識機構を開明することができ、今後の分子スイッチのデザインにおいて有益な情報を得ることができた。今後はこれらの情報をもとにした分子スイッチをよりエレガントなモノへと改良を進める一方で、構築した分子スイッチを細胞死へと応用する系を立ち上げる。

Report

(3 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (24 results)

All 2010 2009 2008 2007

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 9 results) Presentation (12 results) Book (2 results)

  • [Journal Article] Extracellular production of an RNA aptamer by ribonuclease-free marine bacteria harboring engineered plasmids : a proposal for industrial RNA drug production2010

    • Author(s)
      Hiromichi Suzuki, Tomoaki Ando, So Umekage, Terumichi Tanaka, Yo Kikuchi
    • Journal Title

      Applied Env.Microbiol. 76

      Pages: 786-793

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      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Analysis on substrate specificity of Escherichia coli ribonuclease P using shape variants of pre-tRNA : Proposal of subsite model for substrate shape recognition2009

    • Author(s)
      Satoshi Suwa, Yasuhiro Nagai, Akihiro Fujimoto, Yo Kikuchi, Terumichi Tanaka
    • Journal Title

      J.Biochem. 145

      Pages: 151-160

    • NAID

      10026301399

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Extracellular tRNAs of the marine photosynthetic bacterium Rhodovulum sulfidophilum are not aminoacylated2009

    • Author(s)
      Hiromichi Suzuki, So Umekage, Terumichi Tanaka, Yo Kikuchi
    • Journal Title

      Biosci.Biotechnol.Biochem. 73

      Pages: 425-427

    • NAID

      10027537724

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      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of extracellular DNA production and flocculation of the marine photosynthetic bacterium Rhodovulum sulfidophilum2009

    • Author(s)
      Hiromichi Suzuki, Masahide Daimon, Tomoyuki Awano, So Umekage, Terumichi Tanaka, Yo Kikuchi
    • Journal Title

      Applied Microbiol.Biotechbnol. 84

      Pages: 349-356

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  • [Journal Article] Substrate recognition of pre-tRNA by ribonuclease P---subsite model of natural ribozyme originated from Escherichia coli2009

    • Author(s)
      Akihiro Fujimoto, Yo Kikuchi, Terumichi Tanaka
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symps.Ser. 53

      Pages: 35-36

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      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article]2009

    • Author(s)
      田中照通, 他7名
    • Journal Title

      ノーベル賞の生命科学入門・RNAが拓く新世界(講談社サイエンティフィック)

      Pages: 50-63

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      2009 Annual Research Report
  • [Journal Article] Analysis on substrate specificity of Escherichia coli ribonuclease P using shape variants of pre-tRNA : Proposal of subsite model for substrate shape recognition.2009

    • Author(s)
      Satoshi Suwa, Yasuhiro Nagai, Akihiro Fujimoto, Yo Kikuchi, Terumichi Tanaka
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry 145

      Pages: 151-160

    • NAID

      10026301399

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      2008 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Extracellular tRNAs of the marine photosynthetic bacterium Rhodovulum sulfidophilum are not aminoacylated.2009

    • Author(s)
      Hiromichi Suzuki, So Umekage, Terumichi Tanaka, Yo Kikuchi
    • Journal Title

      Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry (印刷中)

    • NAID

      10027537724

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      2008 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Subsites for substrate recognition by bacterial ribonuclease P.2008

    • Author(s)
      Akihiro Fujimoto, Satoshi Suwa, Yasuhiro Nagai, Yo Kikuchi, Terumichi Tanaka
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series No. 52

      Pages: 207-208

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      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Mutational analysis on the S-domain of bacterial RNaseP.2007

    • Author(s)
      Terumichi Tanaka, and YoKikuchi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symposium Series No.51

      Pages: 371-372

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  • [Presentation] Substrate recognition of pre-tRNA by ribonuclease P --- subsite model of natural ribozyme originated from Escherichia coli2009

    • Author(s)
      Akihiro Fujimoto, Yo Kikuchi, Terumichi Tanaka
    • Organizer
      The Sixth International Sympsium on Nucleic Acids Chemistry 2009
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      Takayama, Gifu, dapan
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  • [Presentation] 大腸菌リボヌクレアーゼPの基質認識に関してのSドメインの役割2009

    • Author(s)
      藤本章裕, 菊池洋, 田中照通
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (横浜市)
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    • Author(s)
      藤田能亘, 鈴木宏道, 梅影創, 田中照通, 菊池洋
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜 (横浜市)
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Subsites for substrate recognition by bacterial ribonuclease P.2008

    • Author(s)
      Akihiro Fujimoto, Satoshi Suwa, Yasuhiro Nagai, Yo Kikuchi, Terumichi Tanaka
    • Organizer
      Joint Symposium of 18th International Roundtable on Nucleosides, Nucleptides and Nucleic Acids and 35th International Sympsium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      神戸
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 海洋性光合成細菌Rhodovulum sulfidophilumを用いた機能性RNA生産法2008

    • Author(s)
      鈴木宏道, 安藤智朗, 梅影創, 田中照通, 平石明, 菊池洋
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Place of Presentation
      名古屋
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌リボヌクレアーゼPによる基質認識におけるSドメインの役割の解析2008

    • Author(s)
      藤本章裕, 菊池洋, 田中照通
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Place of Presentation
      札幌
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌リボヌクレアーゼPにおける基質錦メカニズムの解析2008

    • Author(s)
      藤本章裕, 菊池洋, 田中照通
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Place of Presentation
      札幌
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 機能性RNAの発酵生産2008

    • Author(s)
      鈴木宏道, 安藤智朗, 梅影創, 田中照通, 平石明, 菊池洋
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Place of Presentation
      札幌
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 真正細菌リボヌクレアーゼPにおけるヘアピン型RNA基質とL字型町tRNA前駆体基質の認識の違い2008

    • Author(s)
      田中照通, 菊池洋
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸
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  • [Presentation] 海洋性光合成細菌Rhodovulum sulfidophimumが生産する菌体外DNAの挙動と解析2008

    • Author(s)
      鈴木宏道, 粟野智幸, 大門正英, 梅影影創, 田中照通, 菊池洋
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神戸
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  • [Presentation] 海洋性光合成細菌Rhodovulum sulfidophilumが菌体外へ生成するtRNAの解析2007

    • Author(s)
      鈴木 宏道・梅影 創・田中 照通・平石 明・菊池 洋
    • Organizer
      日本RNA学会
    • Place of Presentation
      名古屋
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  • [Presentation] 海洋性光合成細菌Rhodovulum sulfidophilumを用いた機能性RNA生産法2007

    • Author(s)
      鈴木 宏道・安藤 智朗・梅影創・田中 照通・平石 明・菊池 洋
    • Organizer
      日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      横浜
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  • [Book] 生態恒常性工学-持続可能な未来社会のために-2008

    • Author(s)
      田中 照通, 他22名
    • Publisher
      コロナ社
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  • [Book] 「ノーベル賞の生命科学入門・RNAの新世界」第3章「逆転写酵素の発見」2008

    • Author(s)
      田中 照通, 他7名
    • Publisher
      講談社サイエンティフック(未定)
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      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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