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カスパーゼをモデルとした蛋白質代謝ネットワーク解明に向けた基礎的技術開発

Research Project

Project/Area Number 19657041
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionEhime University

Principal Investigator

澤崎 達也  Ehime University, 無細胞生命科学工学研究センター, 准教授 (50314969)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords無細胞蛋白質合成系 / カスパーゼ3 / 蛋白質代謝 / 細胞死 / プロテアーゼ / 蛋白質ライブラリー / プロテインカイネース / 細胞内シグナル
Research Abstract

蛋白質は,細胞内もしくは細胞外でプロテアーゼにより“代謝"され,ペプチドホルモンなどの機能ペプチドとしてある種の生命現象の制御に関与していることが知られている。最近では、ホルモン機能以外にも,転写因子に直接結合することにより転写制御を行うペプチドの発見など,従来では予想されていなかった蛋白質の“代謝"産物ペプチドが多種多様な機能を有する可能性が示唆されている。これを裏付けるかのように,高等動物や植物のゲノム上には,プロテアーゼは500種類以上からなる大きなファミリーを形成しており,この数はシグナル伝達の中心的な役割を示すプロテインカイネースや転写因子ファミリーに匹敵する。この事は,高等生物ゲノムがコードする数万種類の蛋白質は,多種のプロテアーゼが関与した機構により代謝され,その産物(ペプチド)が生命現象制御に広く関与した,“蛋白質代謝ネットワーク"を形成している可能性を示唆するものである。本申請はこのようなネットワークを網羅的に調べることができる技術や方法論の開発を目指すものである。この技術の利用は,“代謝"される蛋白質情報だけでなく,機能を有したペプチドの同定が可能となり,まだリガンドが未同定なオーファン受容体との相互作用や,代謝ペプチドラィブラリーの構築への利用などの応用研究,『蛋白質の分解とその運命』という古くて新しい領域の解明につながるものと期待される。しかし,これらの方法論の構築には,ハイスループットな基質蛋白質合成と切断活性の検出法の構築が必要である。本年度は、昨年度見出した新規カスパーゼ3切断プロテインカイネースの切断部位および、アポトーシス誘導時の細胞内での切断を確認した.

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2009 2008 2007 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (3 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] A simple and high-sensitivity method for analysis of ubiquitination and polyubiquitination based on wheat cell-free protein synthesis.2009

    • Author(s)
      Takahashi. H, et al.
    • Journal Title

      BMC Plant Biology 9

      Pages: 39-39

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Wheat germ cell-free system-based production of malaria proteins for discovery of novel vaccine candidates.2008

    • Author(s)
      Tsuboi T, et al.
    • Journal Title

      Infect Immun. 76

      Pages: 1702-1708

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] RIP and RALyase cleave the sarcin/ricin domain, a critical domain for ribosome function, during senescence of wheat coleoptiles.2008

    • Author(s)
      Sawasaki T, et al.
    • Journal Title

      Biochem Biophys Res Commun. 370

      Pages: 561-565

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The wheat germ cell-free based screening of protein substrates of calcium/calmodulin-dependent protein kinase II delta.2008

    • Author(s)
      Masaoka T, et al.
    • Journal Title

      FEBS Lett. 582

      Pages: 1795-1801

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] DNA-binding profiling of human hormone nuclear receptors via fluorescence correlation spectroscopy in a cell-free system.2008

    • Author(s)
      Kobayashi T, et al.
    • Journal Title

      FEBS Lett. 582

      Pages: 2737-2744

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis HY5 protein functions as a DNA-binding tag for purification and functional immobilization of proteins on agarose/DNA microplate2008

    • Author(s)
      Tatsuya Sawasaki, et. al.
    • Journal Title

      FEBS Letters 582

      Pages: 221-228

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A set of ligation-independent in vitro translation vectors for eukaryotic protein production2008

    • Author(s)
      Viola Bardoczy, et. al.
    • Journal Title

      BMC Biotechnology 8

      Pages: 32-32

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of ScORK28,a transmembrane functional protein receptor kinase predominantly expressed in ovaries from the wild potato species Solanum chacoense2008

    • Author(s)
      Hugo Germain, et. al.
    • Journal Title

      FEBS Letters 581

      Pages: 5137-5142

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] カスパーゼ3により切断されるプロテインカイネースの網羅的探索2008

    • Author(s)
      田所大典ら
    • Organizer
      BMB2008 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)
    • Year and Date
      2008-12-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] カスパーゼ8により切断される膜貫通タンパク質の探索システムの構築2008

    • Author(s)
      赤木達也ら
    • Organizer
      BMB2008 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)
    • Year and Date
      2008-12-11
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] カスパーゼ3により切断されるプロテインカイネースの探索システムの構築2007

    • Author(s)
      赤木 達也
    • Organizer
      第30会日本分子生物学会年会第80会日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2007-12-12
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Book] In vitro Transwcription and Translation Protocols 2nd edit2007

    • Author(s)
      Guido Grandi
    • Total Pages
      276
    • Publisher
      Humana Press
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ehime-u.ac.jp/~cellfree/endolab/

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.ehime-u.ac.jp/~cellfree/endolab/

    • Related Report
      2007 Annual Research Report

URL: 

Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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