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生命進化における原始RNPネットワーク・モデルの人工再構成

Research Project

Project/Area Number 19657071
Research Category

Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Evolutionary biology
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

井川 善也  Kyushu University, 大学院・工学研究院, 准教授 (70281087)

Project Period (FY) 2007 – 2009
Project Status Completed (Fiscal Year 2009)
Budget Amount *help
¥3,400,000 (Direct Cost: ¥3,400,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2008: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
KeywordsRNA / RNP / ポリペプチド / 複合体 / 分子進化
Research Abstract

本研究では、申請者が従来行ったRNA酵素の分子デザインとRNP複合体の人工創製の研究成果を展開し、未踏領域であるRNAワールドと現存の生命システムを結ぶ「RNPワールド」の再構成に挑戦する。特に「RNAとポリペプチド間のcross-catalysisとそのネットワーク化」に焦点をあて、最もシンプルなモデル系をデザインし実験的に再構成することに挑戦する。
H21年度は、ポリペプチドの連結反応を促進する鋳型分子として最適なRNA構造の探索と最適化を行った。
H20年度にテトラヒメナ・イントロンRNAを基盤とした鋳型RNAがポリペプチドの連結反応を効果的に促進する事を見いだしたが、RNAとペプチド間の静電相互作用によるバックグランド反応も併発する事が明らかとなった。この副反応を最小化するため、テトラヒメナ・イントロンRNAより小型の天然由来のRNA構造と人工デザインしたRNA構造を計4種用いて鋳型RNAをデザインし、その効果を比較した。
その結果、いずれのRNAも非特異的バックグランド反応は顕著に減少した。3種類の1分子からなる構造RNAは小型化に伴う構造の不安定化のため、目的とする特異的反応の収率も低下した。しかし、人工設計された自己2量化能力を有するRNA(tectoRNA)を基盤とした鋳型RNAは特異的反応の収率低下を伴わず、むしろ反応効率の向上が見られ、バックグランド反応も抑制された。これはリボソームが複数のRNAサブユニットから形成される事実と照らし、機能性RNAの進化に対して興味深い結果である。

Report

(3 results)
  • 2009 Annual Research Report
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2009 2008 2007

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Designed RNAs with two peptide-binding units as artificial templates for native chemical ligation of RNA-binding peptides2009

    • Author(s)
      N.Kashiwagi, et al.
    • Journal Title

      ChemBioChem 10

      Pages: 2745-2752

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Toward a Reciprocal Evolution System between RNA and Peptides as an Artificial Model for the Early RNP World2009

    • Author(s)
      Y.Ikawa, et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp.Ser 53

      Pages: 33-34

    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Journal Article] Primitive templated catalysis of a peptide ligation byself-folding RNAs.2009

    • Author(s)
      N. Kashiwagi, et al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research. 37(In press)

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Design and analysis of a structural RNA that acts as a template for peptide liation2007

    • Author(s)
      N. Kashiwagi, et. al.
    • Journal Title

      Nucleic Acids Symp Ser(Oxf) 51

      Pages: 387-388

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Toward a Reciprocal Evolution System between RNA and Peptides as an Artificial Model for the Early RNP World2009

    • Author(s)
      井川善也
    • Organizer
      The 6^<th> international symposium on nucleic acids chemistry
    • Place of Presentation
      高山
    • Year and Date
      2009-09-28
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] 二量化RNAをプラットフォームとするプログラム型ペプチド連結システムの構築2008

    • Author(s)
      K. Yamashita, et al.
    • Organizer
      BMB 2008
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-10
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] RNP形成によりペプチド連結反応塗促進するデザイン型RNA構造体の作成と解析2007

    • Author(s)
      N. Kashiwagi, et. al.
    • Organizer
      第9回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場
    • Year and Date
      2007-07-30
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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