昆虫における、転移因子マリナーの水平伝播機構およびゲノム進化に及ぼす影響
| Project/Area Number |
19658023
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Applied entomology
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| Research Institution | University of the Ryukyus |
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Principal Investigator |
中島 裕美子 University of the Ryukyus, 熱帯生物圏研究センター, 准教授 (70244340)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
伴戸 久徳 北海道大学, 大学院・農学研究院, 教授 (20189731)
間野 修平 名古屋市立大学, 大学院・システム自然科学研究科, 准教授 (20372948)
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| Project Period (FY) |
2007 – 2009
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2009)
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| Budget Amount *help |
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2007: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
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| Keywords | MLE(mariner-like element) / mosl / バキュロウイルス / AcB-TPmos, AcB-GHmos / BmTNML座位 / L1Bm、BMC1,BmmaT1 / Coalescent methods / マクロアレイ / S2細胞 / Amp,Gm、Cm / MLE / 遺伝的浮動 / 多次元拡散モデル / マイクロアレイ / mariner-like element / Cecropia-ITR-MLE / ブートストラップ標本 / SALL |
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| Research Abstract |
1) カイコ第6染色体上のBmTNML座位(MLEにL1Bm,BMC1が挿入されたユニットで、クワコではMLEにBmmaT1が挿入されている)における、4種類の転移因子の挿入、切り出しの順番と年代、TMRCAを、アジア各地に生息するクワコの配列を用い、Coalescent methodsに基づき推定した。この座位におけるMLEのゲノムへの挿入は約1000万年前後であることをこと、L1Bmがその後MLEに挿入され、クワコの一部の集団においては新しい年代にBmamaT1が挿入され、一部の集団ではこれが切り出され、またカイコの系統のみで、L1BmへのBMC1の挿入が比較的最近おこったことが推定された。これらの結果は、特定のMLEがゲノム進化時計としてのひとつの指標となる可能性を示唆した。2)mos1のTransposase(TP)発現バキュロウイルス(AcB-TPmos)と、 mos1のITRでgfpおよびハイグロマイシン耐性遺伝子を挟んだ転移ユニットを組み込んだウイルス(AcB-GHmos)を作製した。この2つのウイルスを用いてバキュロウイルスを介したmos1転移活性を、魚類細胞を用いて解析し、形質転換細胞が得られた。この結果はmos1がバキュロウイルスを介して魚類細胞に導入される可能性を示唆した。一方、哺乳動物細胞におけるバキュロウイルス遺伝子の発現制御について解析した結果、哺乳動物細胞内ではバキュロウイルス遺伝子の発現が宿主のエピジェネティック修飾により抑制されていることが判明した。このことから、自然界において哺乳動物細胞ゲノムへのmos1転移がバキュロウイルスを介して生じる可能性は低いことが推定された。3)mos1をショウジョウバエ、w1118系統にP-elementを用いて導入した系統を数系統作成し、このうちの2系統を用いて、マイクロアレイ実験を行ったところ、2つのレトロトランスポゾン(Doc, 297)の遺伝子発現レベルの上昇が確認された。この結果から活性型トランスポゾンのTPがレトロトランスポゾンの遺伝子発現の上昇に寄与している可能性が示唆された。
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Report
(3 results)
Research Products
(17 results)
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[Journal Article] 台湾産クワコからのマリナー様転移因子の単離とその系統解析2009
Author(s)
鎌内悠, 川西祐一, 矢後勝也, 小田切顕一, 上田恭一郎, 伴野豊, 前川秀彰, Yu-Feng Hsu, 黄勇平, 日高道雄, 中島裕美子
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Journal Title
Entomotech 33
Pages: 31-35
Related Report
Peer Reviewed
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[Journal Article] Method for rapid distinction of Bombyx mandarina (Japan) from B. Mamdarina (China) based on rDNA sequence difference.2008
Author(s)
Kawanishi, Y., Banno, Y., Fujimoto, H., Nho, S. K., Tu, Z., Mita, K., Tshuchida, K., Takada, N., Maekawa, H., Nakajima, Y.
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Journal Title
Journal of Insect Biotechnology and Sericology 77(2)
Pages: 79-85
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Peer Reviewed
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[Journal Article] A novel maT-type transposable element, BmamaT1, in Bombyx mandarina, homologous to the B. mori mariner-like element Bmmar6.2008
Author(s)
Kawanishi, Y., Morimoto, M., Banno, Y., Nho, S. K., Maekawa, H., and Nakajima, Y.
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Journal Title
Journal of Insect Biotechnology and Sericology 77(1)
Pages: 45-52
NAID
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Peer Reviewed
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[Journal Article] Sequence comparison of mariner-like elements among the population of Bombyx mandarina inhabiting China, Korea, and Japan.2007
Author(s)
Kawanishi, Y., Takaishi, R., Banno, Y., Fujimoto, H., Nho, S. K., Maekawa, H., and Nakajima, Y.
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Journal Title
Journal of Insect Biotechnology and Sericology 76(2)
Pages: 79-87
NAID
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Peer Reviewed
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[Presentation] The analysis of the specific mariner Transposon in some insects, BmTNML locus and the R2 retrotransposable elements of B.mandarina compared with those of B.mori.2009
Author(s)
Y.Kawanishi, Y.Kamauchi, S.Okuma, S.Mano, Y.Banno, S.K.Nho, Yu-Feng Hsu, K.Ueda, M.Yago, K.Odagiri, T.H.Eickbush, H.Maekawa, Y.Nakajima
Organizer
The 6th Asia-Pacific Congress of Entomology
Place of Presentation
Beijing, China
Year and Date
2009-10-21
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[Presentation] クワコのrDNAの5.8S-28S領域の配列を指標にした比較系統解析2009
Author(s)
川西祐一, 味村博, 三田和英, 山本公子, 伴野豊, 藤本浩文, 屠振力, 盧時甲, 日高道雄, 中島裕美子, 前川秀彰
Organizer
日本蚕糸学会第79回大会
Place of Presentation
東京農工大学農学部
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