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遺伝子変異のインビボ修復による疾患治療法の開発

Research Project

Project/Area Number 19659084
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Human genetics
Research InstitutionJapan Advanced Institute of Science and Technology

Principal Investigator

塚原 俊文  Japan Advanced Institute of Science and Technology, ナノマテリアルテクノロジーセンター, 教授 (60207339)

Project Period (FY) 2007 – 2008
Project Status Completed (Fiscal Year 2008)
Budget Amount *help
¥3,200,000 (Direct Cost: ¥3,200,000)
Fiscal Year 2008: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2007: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords遺伝子治療 / 遺伝子修復 / 化学的脱アミノ化 / カルボキシビニルウリジン / オリゴデオキシヌクレオチド / 光化学反応 / ATPase 6 / PCR-RFLP / ATPase6
Research Abstract

本研究は、Leigh症候群患者に存在するミトコンドリアATPase6遺伝子のT→C点変異症例を対象に、患者由来細胞を用いたin vivo実験を行って遺伝子修復するための方法を確立することを目的としている。これまでに、患者細胞由来の全DNA、全RNAあるいはin vitroで調製した変異を持つ全長のATPase6-mRNAをターゲットに塩基配列特異的な光化学的脱アミノ化を試み、ヘアピン型CVU含有ODNを用いた部位特異的なCの脱アミノ化が可能であることを示した。RNAの修復効率は、in vitroで合成した全長のATPase 6-mRNAをターゲットした場合は10.8%、Leigh脳症患者由来の全RNAの場合は7.6%であった。
本年度はin vivoで同様のRNA修復を確認するため、ヘアピン型CVU含有ODNを患者細胞内に導入し、RNA修復の有無を調べることを目的に実験を行った。まず、無菌状態でのUV照射法を検討するため、様々な条件で細胞培養皿を介した脱アミノ化を試みたところ、スライドグラスを介してUV照射を行った場合に、最も塩基置換の効率が高いことが示された。この結果から、以後の実験にはガラスボトムディッシュ:ホール径27mmを用いた。引き続き、Leigh脳症患者由来の初代培養線維芽細胞にヘアピンにヘアピン型CVU含有ODNを導入後、UV照射を行ってRNAの修復を試み、RFLPによって脱アミノ化を確認した。しかし、RNAの修復は全く認められなかった。GFPプラスミドを指標として確認したところ、本培養細胞は遺伝子導入効率が高いとされるLipofectamine LTXやFuGENE 6によっても遺伝子が導入されなかったことから、今回の変異修復の失敗はODNの導入効率が極めて低いことが原因であると考えられた。今後、物理的導入法も含め、効率の高い遺伝子導入法の検索が必要であると結論した。

Report

(2 results)
  • 2008 Annual Research Report
  • 2007 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2009 2008 2007

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] Localization of c-mos mRNA around the animal pole in the zebrafish oocyte with Zor-1/Zorba.2009

    • Author(s)
      Suzuki, Tsukaha, T, Inoue K.
    • Journal Title

      BioScience Trends 3(In press)

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 'Protected DNA Probes' capable of strong hybridization without removal of base protecting groups.2008

    • Author(s)
      Ohkubo A, Kasuya R, SakamotoK, Miyata K, Taguchi H, Nagasawa H, Tsukahara T, WatanobeT, Maki Y, Seio K, Sekine M
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 36

      Pages: 1952-1964

    • Related Report
      2008 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Protected DNA Probes' capable of strong hybridization without removal of base protecting groups2008

    • Author(s)
      Ohkubo A, Kasuya R, Sakamoto K, Miyata K, Taguchi H, Nagasawa H, Tsukahara T, Watanobe T, Maki Y, Seio K, Sekine M
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res. 36

      Pages: 1952-1964

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A New Hydrophobic Linker Effective for the in situ Synthesis of DNA-CPG Conjugates as Tools for SNP Analysis2007

    • Author(s)
      Ohkubo A, Taguchi H, Seio K, Nagasawa H, Tsukahara T, Sekine M
    • Journal Title

      Tetrahedron Letters 48

      Pages: 5147-5150

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] An effective method for the in situ synthesis of DNA-CPG conjugates using chemical ligation technology as tools for SNP analysis2007

    • Author(s)
      Ohkubo A, Tanaka K, Taguchi H, Seio K, Nagasawa H, Tsukahara T, Sekine M
    • Journal Title

      Bioorg Med Chem Lett. 17

      Pages: 5969-5973

    • Related Report
      2007 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 神経細胞特異的な選択的スプライシングの網羅的解析2008

    • Author(s)
      佐野塚原俊文, 鈴木仁
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会大会合同大
    • Place of Presentation
      神戸・ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-08
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] 組織特異的Mef2cアイソフォームの転写制御機構の解析2008

    • Author(s)
      関山佳治, 鈴木仁, 塚原俊文
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸・ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-08
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      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] The Regulation of Neural and Muscular Specific Alternative Splicing of Mef2c2008

    • Author(s)
      AbHakim NH, Kounishi T, TsukaharT, Suzuki H
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸・ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-08
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] Change of Expression of ACTNl and Sr3A Genes During Early Stage of Neural Differentiation in P19 Cells2008

    • Author(s)
      Alam, A. H. M. K, Suzuki H, sukahara T
    • Organizer
      第31回日本分子生物学会年会、第81回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸・ポートアイランド
    • Year and Date
      2008-12-08
    • Related Report
      2008 Annual Research Report
  • [Presentation] NSSR/SRp38による選択的スプライシング制御機構の解析2007

    • Author(s)
      幸西寿樹、塚原俊文、鈴木仁
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会、第80回日本生化学会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞内遺伝子修復の可能性と疾患治療への応用2007

    • Author(s)
      大岡雄、鈴木仁、藤本健造、塚原俊文
    • Organizer
      第30回日本分子生物学会、第80回日本生化学会 合同大会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2007-12-12
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Development of a next generation oligo-DNA microarray with probe-on-carriers2007

    • Author(s)
      Tsukahara T, Nagasawa H, Ohkubo A, Seio K, Sekine M, Suzuki H
    • Organizer
      Malaysia-Japan International Symposium on Advanced Technology 2007
    • Place of Presentation
      Kuala Lumpur, Malaysia
    • Year and Date
      2007-11-05
    • Related Report
      2007 Annual Research Report
  • [Presentation] Alternative splicing variants of Mef2c in P19 cells and P19CL6 cells2007

    • Author(s)
      Ab Hakim N-H, Tsukahara T, Suzuki H
    • Organizer
      Malaysia-Japan International Symposium on Advanced Technology 2007
    • Place of Presentation
      Kuala Lumpur, Malaysia
    • Year and Date
      2007-11-05
    • Related Report
      2007 Annual Research Report

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Published: 2007-04-01   Modified: 2016-04-21  

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