Genome-wide analyses of organ-specific DNA methylation and transcription in Arabidopsis thaliana
| Project/Area Number |
19688017
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Young Scientists (A)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Research Field |
Applied molecular and cellular biology
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| Research Institution | Nara Institute of Science and Technology |
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Principal Investigator |
SHIBA Hiroshi Nara Institute of Science and Technology, バイオサイエンス研究科, 助教授 (20294283)
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| Co-Investigator(Renkei-kenkyūsha) |
ECKER Joseph R. Salk institute of biological studies, 教授
YAZAKI Junshi Salk institute of biological studies, 博士研究員
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| Project Period (FY) |
2007 – 2008
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2008)
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| Budget Amount *help |
¥19,630,000 (Direct Cost: ¥15,100,000、Indirect Cost: ¥4,530,000)
Fiscal Year 2008: ¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2007: ¥10,530,000 (Direct Cost: ¥8,100,000、Indirect Cost: ¥2,430,000)
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| Keywords | DNAメチル化 / ゲノムタイリングアレイ / 組織特異的発現 / エピジェネティクス / 器官特異的 / mCIP |
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| Research Abstract |
植物でも組織特異的なDNAメチル化の変動が見られるかどうかを明らかにすることを目的に、Col-0株の花序、成葉、根のメチローム・トランスクリプトーム統合解析を行った。またDNAメチル化の影響を具体的に示すためにDNAメチル化酵素変異株ホモ株当代の花序および成葉のメチローム・トランスクリプトーム解析を行い、Col-0株の結果と比較した。その結果、器官特異的なDNAメチル化・脱メチル化が見られた遺伝子を多数見出した。またメチル化によって遺伝子発現が制御されていると見られる遺伝子も多数見出した
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Report
(3 results)
Research Products
(23 results)
