Regulation of gene expression and chromosome structure by cohesin

• Project/Area Number: 19710161
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: 基礎ゲノム科学
• Research Institution: Tokyo Institute of Technology
• Principal Investigator: BANDO Masashige Tokyo Institute of Technology, バイオ研究基盤支援総合センター, 助教 (90360627)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,780,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥480,000); Fiscal Year 2008: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000); Fiscal Year 2007: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
• Keywords: ゲノム構造 / ゲノム発現 / コヒーシン / コルネリアデランゲ症候群 / ChIP-chip解析 / インシュレーター / 転写制御 / CTCF

Research Abstract

ヒトコヒーシンは、姉妹染色体間の接着以外の機能として遺伝子発現の調節に寄与することがいわれてきたが詳細は不明であった。本研究でのChIP-chip解析より、コヒーシンがインシュレーター因子CTCFと染色体上で共局在すること、さらにインシュレーター活性にコヒーシンが必要であることを明らかにした。また、コヒーシン関連の遺伝病患者由来のB細胞を用いたコヒーシンのChIP-chip解析や転写解析から、コヒーシンの転写因子としての役割を担っている可能性の結果が得られた。

Research Products

• [Journal Article] Cohesin mediates transcriptional insulation by CCCTC-binding factor 451 (2008)
  • Author(s): Kerstin S. Wendt , Keisuke Yoshida, Takehiko Itoh , Masashige Bando, Birgit Koch, Erika Schirghuber, Shuichi Tsutsumi, Genta Nagae, Ko Ishihara, Tsuyoshi Mishiro, Kazuhide Yahata, Fumio Imamoto, Hiroyuki Aburatani, Mitsuyoshi Nakao, Naoko Imamoto, Kazuhiro Maeshima, Katsuhiko Shirahige, Jan-Michael Peters
  • Journal Title: Nature Pages: 796-801
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cohesin mediates transcriptional insulation by CCCTC-binding factor (2008)
  • Author(s): Kerstin S. Wendt, Keisuke Yoshia, Takehiko Itoh, Masashige Bando, Birgit Koch, Erika Schirghuber, Shuichi Tsutsumi, Genta Nagae, Ko Ishihara, Tsuyoshi Mishiro, Kazuhide Yahata, Fumio Imamoto, Hiroyuki Aburatani, Mitsuyoshi Nakao, Naoko Imamoto, Kazuhiro Maeshima, Katsuhiko Shirahige, Jan-Michael Peters
  • Journal Title: Nature 451 Pages: 796-801
  • Peer Reviewed