Molecular analysis of glycosyl carrier lipid flippase

• Project/Area Number: 19710178
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Living organism molecular science
• Research Institution: Tohoku University
• Principal Investigator: NOIKE Motoyoshi Tohoku University, 多元物質科学研究所, 助教 (20420010)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,490,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2008: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000); Fiscal Year 2007: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
• Keywords: 糖キャリア脂質 / フリッパーゼ

Research Abstract

真正細菌の細胞表層の生合成には、細胞質側で生合成されたオリゴ糖鎖と糖キャリア脂質との複合体が細胞質側からペリプラズム側に反転する過程が必須であり、この輸送は反転酵素によって触媒されて行われている。しかし、有効なアッセイ系がないため、その機構の詳細は明らかにされていない。本研究では、同機構の解明を行うことを目的とし、蛍光プローブを用いたアッセイ系の構築を行った。

Research Products

• [Journal Article] Cloning and Functional Analysis of cis-Prenyltransferase from Thermobifida fusca (2009)
  • Author(s): Ambo T, Noike M, Kurokawa H & Koyama T
  • Journal Title: J. Biosci. Bioeng 107(6) Pages: 620-622
  • NAID: 110007330984
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effect of mutagenesis at the region upstream from the G(Q/E) motif of three types of geranylgeranyl diphosphate synthase on product chain-length (2009)
  • Author(s): Noike M, Katagiri T, Nakayama T, Nishino T & Hemmi H
  • Journal Title: J. Biosci. Bioeng 107(3) Pages: 235-239
  • NAID: 110007160792
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cloning and Functional Analysis of cis-Prenyltransferase from Thermobifida fusca (2009)
  • Author(s): Takanori Ambo
  • Journal Title: J. Biosci. Bioeng (in press)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Effect of mutagenesis at the region upstream from the G(Q/E) motif of three types of geranylgeranyl diphosphate synthase on product chain-length (2009)
  • Author(s): Motoyoshi Noike
  • Journal Title: J. Biosci. Bioeng 107 Pages: 235-239
  • NAID: 110007160792
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Product chain-length determination mechanism of Z,E-farnesyl diphosphate synthase (2008)
  • Author(s): Noike M, Ambo T, Kikuchi S, Suzuki T, Yamashita S, Takahashi S, Kurokawa H, Mahapatra S, Crick DC & Koyama T
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun 377(1) Pages: 17-22
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cloning and functional analysis of novel short-chain cis-prenyltransferases (2008)
  • Author(s): Ambo T, Noike M, Kurokawa H & Koyama T
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res. Commun 375(4) Pages: 536-540
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The product chain length determination mechanism of type II geranylgeranyl diphosphate synthase requires subunit interaction (2008)
  • Author(s): Noike M, Katagiri T, Nakayama T, Koyama T, Nishino T & Hemmi H
  • Journal Title: FEBS Journal 275(15) Pages: 3921-3933
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Product chain-length determination mechanism of Z, E-farnesyl diphosph atesvnthase (2008)
  • Author(s): Motoyoshi Noike
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res 337 Pages: 17-22
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Cloning and functional analysis of novel short-chain cis-prenyltransferases (2008)
  • Author(s): Takanori Ambo
  • Journal Title: Biochem. Biophys. Res 375 Pages: 536-540
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The product chain length determination mechanism of type II geranylgeranyl diphosphate synthase requires subunit interaction (2008)
  • Author(s): Motoyoshi Noike
  • Journal Title: FEBS Journal 275 Pages: 3921-3933
  • Peer Reviewed
• [Presentation] シス型ファルネシル二リン酸合成酵素の基質特異性・生成物鎖長制御機構の解明 (2008)
  • Author(s): 安保貴永、野池基義、黒河博文、古山種俊
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] cis-Farnesyl diphosphate synthaseにおける生成物鎖長制御機構の解明 (2008)
  • Author(s): 安保貴永、野池基義、黒河博文、古山種俊
  • Organizer: 平成20年度化学系学協会東北大会
  • Place of Presentation: 八戸工業大学
  • Year and Date: 2008-10-12
• [Presentation] 真正細菌の細胞壁生合成における糖キャリア脂質リサイクル機構の解明 (2007)
  • Author(s): 野池基義、関俊輔、小関弘恵知、山下哲、高橋征司、黒河博文、古山種俊
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-13
• [Presentation] 新規基質アナログによるプレニルトランスフェラーゼ阻害機構の研究 (2007)
  • Author(s): 福地さと子、黒河博文、安保貴永、野池基義、槇雄二、古山種俊
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] シス型プレニルトランスフェラーゼの生成物特異性を決定する分子機構の研究 (2007)
  • Author(s): 鈴木俊秀、野池基義、安保貴永、菊地明香、Yugesh Kharel、山下哲、高橋征司、黒河博文、古山種俊
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] 糖キャリア脂質前駆体の生合成に関する酵素群の遺伝子クローニング、機能解析 (2007)
  • Author(s): 安保貴永、黒河博文、野池基義、古山種俊
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] シス型プレニルトランスフェラーゼの生成物特異性を決定する分子機構の研究 (2007)
  • Author(s): 鈴木俊秀、野池基義、安保貴永、菊地明香、Yugesh Kharel、山下哲、高橋征司、黒河博文、古山種俊
  • Organizer: 平成19年度化学系学協会東北大会
  • Place of Presentation: 山形大学
  • Year and Date: 2007-09-23
• [Presentation] 糖キャリア脂質前駆体の生合成に関する酵素群の遺伝子クローニング、機能解析 (2007)
  • Author(s): 安保貴永、黒河博文、野池基義、古山種俊
  • Organizer: 平成19年度化学系学協会東北大会
  • Place of Presentation: 山形大学
  • Year and Date: 2007-09-23
• [Presentation] 真正細菌の細胞壁生合成における糖キャリア脂質リサイクル機構の解明 (2007)
  • Author(s): 野池基義、関俊輔、小関弘恵知、山下哲、高橋征司、黒河博文、古山種俊
  • Organizer: 平成19年度化学系学協会東北大会
  • Place of Presentation: 山形大学
  • Year and Date: 2007-09-23
• [Presentation] Gene cloning and functional analysis of novel short-chain cis-prenyltransferase (2007)
  • Author(s): Takanori Ambo, Motoyoshi Noike, Hirofumi Kurokawa, Tanetoshi Koyama
  • Organizer: The 8th International symposium on Biocatalysis and Biotransformations
  • Place of Presentation: スペイン国オビエド市
  • Year and Date: 2007-07-12
• [Presentation] Product chain-length determination mechanism of cis-farnesyl diphosphate synthase (2007)
  • Author(s): Motoyoshi Noike, Takanori Ambo, Sayaka Kikuchi, Satoshi Yamashita, Seiji Takahashi, Hirofumi Kurokawa, Tanetoshi Koyama
  • Organizer: The 8th International symposium on Biocatalysis and Biotransformations
  • Place of Presentation: スペイン国オビエド市
  • Year and Date: 2007-07-12