Development of rapid and accurate method to monitor microorganisms for the advancement of wastewater treatment processes

• Project/Area Number: 19760377
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Civil and environmental engineering
• Research Institution: National Institute of Advanced Industrial Science and Technology
• Principal Investigator: NODA Naohiro National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, 生物機能工学研究部門, 研究員 (70415727)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,780,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥480,000); Fiscal Year 2008: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000); Fiscal Year 2007: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
• Keywords: RNA 定量 / キャピラリー電気泳動 / 複合微生物モニタリング / 16S rRNA / DNA定量 / 複合微生物 / 微生物モニタリング / rRNA

Research Abstract

ACE(Affinity Capillary Electrophoresis)法を基盤とした新規な複合微生物群解析手法の開発を行った。Escherichia coliおよびPseudomonas putidaからそれぞれ抽出したtotal RNAを用いて、2種混合模擬複合系を構築した。いずれの微生物をターゲットとした場合においても、total RNAの混合比率の増加とともに検出されるピーク面積が増加し、5-50%の範囲において定量的に検出可能であることが示された。また、実際の排水処理リアクターより採取した活性汚泥中のE. coliおよびP. putidaの検出を行った結果、同時に行った定量的PCR法の結果とほぼ同等の定量結果が得られた。

Research Products

• [Journal Article] Affinity capillary electrophoresis with magnetic beads for multiplex quantitative analysis of bacterial 16S rRNA (2009)
  • Author(s): 足立賢, 山口正裕, 中繁誠, 金川貴博,鳥村政基, 常田聡,関口勇地,野田尚宏(CA)
  • Journal Title: J. Biosci. Bioeng. 107(6) Pages: 662-667
  • NAID: 110007330976
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Affinity capillary electrophoresis with magnetic beads for multiplex 4 quantitative analysis of bacterial 16S rRNA
  • Author(s): K. Adachi, M. Yamaguchi, M. Nakashige, T. Kanagawa, M. Torirmura, S. Tsuneda, Y Sekiguchi, and N. Noda
  • Journal Title: Journal of Bioscience and Bioengineering (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Presentation] マグネティックビーズを用いたアフィニティーキャピラリー電気泳動法による16S rRNAの検出 (2009)
  • Author(s): 足立 賢
  • Organizer: 化学工学会第74年会
  • Place of Presentation: 横浜国立大学
  • Year and Date: 2009-03-20
• [Presentation] マグネティックビーズを用いたアフィニティキャピラリー電気泳動法による16S rRNA の検出 (2009)
  • Author(s): 足立賢,山口正裕,中繁誠人,金川貴博,常田聡,関口勇地,野田尚宏
  • Organizer: 化学工学会第74 年会
  • Place of Presentation: 横浜
• [Presentation] アフィニティーキャピラリー電気泳動法を用いた特定rRNAの連続的定量手法の開発 (2008)
  • Author(s): 山口 正裕
  • Organizer: 日本生物工学会
  • Place of Presentation: 東北学院大学
  • Year and Date: 2008-08-29
• [Presentation] アフィニティーキャピラリー電気泳動法を用いた特定rRNAの連続的定量手法の開発 (2008)
  • Author(s): 山口 正裕
  • Organizer: 日本農芸化学会2008年度大会
  • Place of Presentation: 名城大学天白キャンパス
  • Year and Date: 2008-03-28
• [Presentation] アフィニティーキャピラリー電気泳動法を用いた特定rRNA の連続的定量手法の開発 (2008)
  • Author(s): 山口正裕,足立賢,中繁誠人,常田聡,関口勇地,野田尚宏
  • Organizer: 2008 年年度日本生物工学会大会
  • Place of Presentation: 仙台
• [Presentation] アフィニティーキャピラリー電気泳動法を用いた特定rRNA の連続的定量手法の開発 (2008)
  • Author(s): 山口正裕,足立賢,中繁誠人,常田聡,関口勇地,野田尚宏
  • Organizer: 日本農芸化学会2008 年度大会
  • Place of Presentation: 名古屋