Study of molecular mechanism of Ars insulator function

• Project/Area Number: 19770005
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Genetics/Genome dynamics
• Research Institution: Hiroshima University
• Principal Investigator: SAKAMOTO Naoaki Hiroshima University, 大学院・理学研究科, 准教授 (00332338)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,630,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2008: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000); Fiscal Year 2007: ¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
• Keywords: インスレーター / クロマチン / DNA 構造 / DNA構造

Research Abstract

Arsインスレーターの作用機構を解明するために、ArsインスレーターにおけるDNA立体構造、クロマチン構造(ヌクレオソーム形成能)、インスレーター活性に必要なコア領域を解析したところ、それらには相関がみられた。したがって、Arsインスレーター中央部分における特殊なDNA立体構造がヌクレオソームの形成を阻害し、それによって生じる開かれたクロマチン構造がArsインスレーターの活性に重要であることが示唆された。

Research Products

• [Journal Article] The Ars insulator facilitates I-SceI meganuclease-mediated transgenesis in the sea urchin embryo. (2008)
  • Author(s): Ochiai, H., Sakamoto, N., Suzuki, K., Akasaka, K., and Yamamoto T.
  • Journal Title: Developmental Dynamics Vol. 237 Pages: 2475-2482
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Analysis of cis-regulatory elements controlling spatio-temporal expression of T-brain gene in sea urchin, Hemicentrotus pulcherrimus. (2008)
  • Author(s): Ochiai, H., Sakamoto, N., Momiyama, A., Akasaka, K., and Yamamoto T.
  • Journal Title: Mechamism of Development Vol. 125 Pages: 2-17
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The Ars insulator facilitates I-SceI meganuclease-mediated transgenesis in the sea urchin embryo (2008)
  • Author(s): 落合博
  • Journal Title: Developmental Dynamics 237 Pages: 2475-2482
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Analysis of cis-regulatory e1ements controlling spatio-temporal expression of T-brain gene in sea urchin, Hemicentrotus pu/cherrimus. (2008)
  • Author(s): 落合 博
  • Journal Title: Mechamism of Development 125 Pages: 2-17
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] DNA variations within the sea urchin Otx gene enhancer. (2007)
  • Author(s): Yamamoto, T., Kawamoto, R., Fujii, T., Sakamoto, N., and Shibata T.
  • Journal Title: FEBS Letters Vol. 581 Pages: 5234-5240
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] DNA variations within the sea urchin otx gene enhancer (2007)
  • Author(s): 山本 卓
  • Journal Title: FEBS Letter 581 Pages: 5234-5240
  • Peer Reviewed
• [Presentation] バフンウニ初期発生におけるDicerホモログの機能解析 (2008)
  • Author(s): 岡光憂佳
  • Organizer: 日本動物学会第79回大会
  • Place of Presentation: 福岡大学七隈キャンパス
  • Year and Date: 2008-09-06
• [Presentation] バフンウニvasa(HpVasa)遺伝子の発現と機能 (2008)
  • Author(s): 住吉範子
  • Organizer: 日本動物学会第79回大会
  • Place of Presentation: 福岡大学七隈キャンパス
  • Year and Date: 2008-09-06
• [Presentation] バフンウニvasa(Hp Vasa)遺伝子の発現と機能 (2008)
  • Author(s): 住吉範子
  • Organizer: 日本動物学会第79回大会
  • Place of Presentation: 福岡大学七隈キャンパス
  • Year and Date: 2008-09-05
• [Presentation] Arsインスレーター機能の分子メカニズムの解析 (2007)
  • Author(s): 坂本尚昭
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-15
• [Presentation] クロマチン再構成系を用いたArsインスレーターの解析 (2007)
  • Author(s): 稲井優太
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] Arsインスレーター機能の分子メカニズムの解析 (2007)
  • Author(s): 坂本 尚昭
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] クロマチン再構成系を用いたArsインスレーターの解析 (2007)
  • Author(s): 稲井 優太
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2007-12-12