Alternative splicing mechanisms of higher plants in response to environmental stresses

• Project/Area Number: 19770037
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: 植物生理・分子
• Research Institution: Chubu University
• Principal Investigator: YOSHIMURA Kazuya Chubu University, 応用生物学部, 講師 (90379561)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥3,670,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2008: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000); Fiscal Year 2007: ¥2,500,000 (Direct Cost: ¥2,500,000)
• Keywords: 植物 / 選択的スプライシング / SRタンパク質 / 転写後調節 / ストレス応答 / シロイヌナズナ

Research Abstract

植物における環境ストレス応答性の選択的スプライシング制御機構を明らかにすることを目的として、シロイヌナズナにおけるストレス応答性SRタンパク質、atSR30およびatSR45aの機能解析を試みた。atSR30およびatSR45aの発現は強光に対して迅速に誘導された。また、それら自身の選択的スプライシング効率は強光により変化していた。酵母two-hybrid法およびBiFC法による解析の結果、atSR45aは5'および3'スプライス部位で機能するU1-70KおよびU2AF35bや、スプライソソーム形成後期に5'スプライス部位で機能するPRP38と相互作用することが明らかになった。これらのことから、atSR30およびatSR45aは強光を含めた環境ストレスに応答した選択的スプライシング効率の制御に深く関与することが示された。

Research Products

• [Journal Article] Plant-specific SR-related protein atSR45a interacts with spliceosomal proteins in plant nucleus (2009)
  • Author(s): Tanabe, N, et.al.
  • Journal Title: Plant Molecular Biology (印刷中)
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Identification of interacting factors with a high-light responsible SR protein, atSR45a, involved in the regulation of alternative splicing in Arabidopsis. Photosynthesis (2008)
  • Author(s): Tanabe, T., Kimura, A., Yoshimura, K., Shigeoka, S.
  • Journal Title: Energy from the Sun Pages: 1347-1350
• [Journal Article] 選択的スプライシングを介した植物の環境ストレス応答/耐性機構-セリン/アルギニンリッチ(SR)タンパク質の関与- (2008)
  • Author(s): 田部記章、吉村和也、重岡成
  • Journal Title: 化学と生物 46 Pages: 224-226
  • NAID: 10021176977
• [Journal Article] Identification of interacting factors with a high-light responsible SR protein, atSR45a, involved in the regulation of alternative splicing in Arabi dopsis (2008)
  • Author(s): Tanabe, T, et.al.
  • Journal Title: Photosynthesis. Energy from the Sun Pages: 1347-1350
• [Journal Article] 選択的スプライシングを介した植物の環境ストレス応答/耐性機構-セリン/アルギニンリッチ(SR)タンパク質の関与- (2008)
  • Author(s): 田部記章, ら
  • Journal Title: 化学と生物 46 Pages: 224-226
• [Journal Article] Differential expression of alternatively spliced mRNAs of Arabidopsis SR protein homologues, atSR30 and atSR45a, in response to environmental stress (2007)
  • Author(s): Tanabe, N., Yoshimura, K., Kimura, A., Yabuta, Y., Shigeoka, S.
  • Journal Title: Plant Cell Physiol 48 Pages: 1036-1049
• [Journal Article] Differential expression of alternatively spliced mRNAs of Arabidopsis SR protein homologues, atSR30 and atSR45a, in response to environmental stress. (2007)
  • Author(s): Tanabe, N.
  • Journal Title: Plant Cell Physiology 48 Pages: 1036-1049
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] AtNUDX1, an8-oxo-7, 8-dihydro-2'-deoxyguanosine 5'-triphosphate pyrophosphohy drolase, is responsible for eliminating oxidized nucleotides in Arabidopsis. (2007)
  • Author(s): Yoshimura, K.
  • Journal Title: Plant Cell Physiology 48 Pages: 1438-1449
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Light regulation of ascorbate biosynthesis is dependent on the photosynthetic electron transport chain but independent of sugars in Arabidopsis. (2007)
  • Author(s): Yabuta, Y.
  • Journal Title: Journal of Experimental Botany 58 Pages: 2661-2671
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] レドックス制御に関わるアスコルビン酸およびヌクレオシドニリン酸類縁体(Nudix) (2007)
  • Author(s): 吉村和也
  • Journal Title: ビタミン 81 Pages: 83-93
  • NAID: 110006242194
• [Journal Article] 植物のレドックス制御機構と環境ストレス応答への関与 (2007)
  • Author(s): 薮田行哲
  • Journal Title: 蛋白質 核酸 酵素 52 Pages: 578-584
• [Journal Article] Plant-specific SR-related protein atSR45a interacts with spliceosomal proteins in plant nucleus
  • Author(s): Tanabe, N., Kimura, A., Yoshimura, K., Shigeoka, S
  • Journal Title: Plant Mol. Biol. (in press)
• [Presentation] 強光応答性SRタンパク質atSR45aのスプライソソーム形成に果たす役割 (2009)
  • Author(s): 田部記章、森達也、木村彩子、吉村和也、重岡成
  • Organizer: 農芸化学学会 2009年度大会
  • Place of Presentation: 福岡
  • Year and Date: 2009-03-29
• [Presentation] 強光応答性SRタンパク質atSR45aのスプライソソーム形成に果たす役割 (2009)
  • Author(s): 田部記章, ら
  • Organizer: 農芸化学学会2009年度大会
  • Place of Presentation: マリンメッセ福岡(福岡県)
  • Year and Date: 2009-03-29
• [Presentation] 選択的スプライシング制御機構におけるストレス応答性SRタンパク質atSR30およびatSR45aの機能解析 (2009)
  • Author(s): 田部記章、吉村和也、木村彩子、森達也、重岡成
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2009-03-22
• [Presentation] 選択的スプライシング制御機構におけるストレス応答性SRタンパク質atSR30およびatSR45aの機能解析 (2009)
  • Author(s): 田部記章, ら
  • Organizer: 第50回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 名古屋大学(愛知県)
  • Year and Date: 2009-03-22
• [Presentation] 強光応答性SRタンパク質atSR45aのpre-mRNAスプライシングにおける役割 (2008)
  • Author(s): 田部記章、吉村和也、木村彩子、重岡成
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: 神戸
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] 強光応答性SRタンパク質atSR45aのpre-mRNAスプライシングにおける役割 (2008)
  • Author(s): 田部記章, ら
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会・第81回日本生化学会大会合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル(兵庫県)
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] 植物SRタンパク質, atSR30およびatSR45aによる強光応答性選択的スプライシング制御 (2008)
  • Author(s): 田部記章、吉村和也、木村彩子、重岡成
  • Organizer: 第23回ユーグレナ研究会
  • Place of Presentation: 奈良
  • Year and Date: 2008-11-15
• [Presentation] 植物SRタンパク質, atSR30およびatSR45aによる強光応答性選択的スプライシング制御 (2008)
  • Author(s): 田部記章, ら
  • Organizer: 第23回ユーグレナ研究会
  • Place of Presentation: 近畿大学(奈良県)
  • Year and Date: 2008-11-15
• [Presentation] グルタレドキシンatGRX S13の選択的スプライシング産物の生理機能の解析 (2008)
  • Author(s): 田部記章、浦野由佳、吉村和也、重岡成
  • Organizer: 農芸化学学会 2008名古屋大会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2008-03-27
• [Presentation] 強光ストレス応答性SRタンパク質, atSR30, atSR45aによる選択的スプライシング制御機構の解析 (2008)
  • Author(s): 木村彩子、高橋香織、田部記章、吉村和也、重岡成
  • Organizer: 農芸化学学会 2008名古屋大会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2008-03-27
• [Presentation] グルタレドキシンatGRX S13の選択的スプライシング産物の生理機能の解析 (2008)
  • Author(s): 田部記章
  • Organizer: 農芸化学学会2008名古屋大会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2008-03-27
• [Presentation] 強光ストレス応答性SRタンパク質,atSR30,atSR45aによる選択的スプライシング制御機構の解析 (2008)
  • Author(s): 木村彩子
  • Organizer: 農芸化学学会2008名古屋大会
  • Place of Presentation: 名古屋
  • Year and Date: 2008-03-27
• [Presentation] 強光応答性SRタンパク質atSR45aのスプライセオソーム形成における役割 (2008)
  • Author(s): 田部記章、木村彩子、高橋香織、吉村和也、重岡成
  • Organizer: 第49回日本植物生理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌
  • Year and Date: 2008-03-21
• [Presentation] 強光応答性SRタンパク質atSR45aによる選択的スプライシング制御機構の解析 (2007)
  • Author(s): 田部記章、木村彩子、吉村和也、重岡成
  • Organizer: 第30回日本分子生物学会年会・第80回日本生化学会大会 合同大会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2007-12-12
• [Presentation] 強光応答性スプライシング制御因子atSR45aの相互作用因子の同定 (2007)
  • Author(s): 田部記章、木村彩子、高橋香織、吉村和也、重岡成
  • Organizer: 日本農芸化学会 関西支部中部支部合同大会
  • Place of Presentation: 愛知
  • Year and Date: 2007-09-22
• [Presentation] 選択的スプライシングによる植物の環境ストレス応答 (2007)
  • Author(s): 吉村和也、田部記章、木村彩子、重岡成
  • Organizer: 日本進化学会 第9回京都大会
  • Place of Presentation: (京都)シンポジウム
  • Year and Date: 2007-09-02
• [Presentation] 選択的スプライシングによる植物の環境ストレス応答 (2007)
  • Author(s): 吉村和也
  • Organizer: 日本進化学会 第9回京都大会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2007-09-02
• [Presentation] Identification of interacting with a high-light responsible SR protein, atSR45a, involved in the regulation of alternative splicing in Arabidopsis (2007)
  • Author(s): Tanabe, T., Kimura, A., Yoshimura, K., Shigeoka, S.
  • Organizer: 14th Photosynthesis Congress (22nd to 27th July 2007, at the SECC in Glasgow UK)
  • Place of Presentation: Glasgow UK
  • Year and Date: 2007-07-22
• [Presentation] Identification of interacting factors with a high-light responsible SR protein, atSR45a, involved in the regulation of alternative splicing in Arabidopsis. (2007)
  • Author(s): Tanabe, N.
  • Organizer: 14th Photosynthesis Congress
  • Place of Presentation: Glasgow, UK
  • Year and Date: 2007-07-22