Regulation of biofilm formation by GGDEF/EAL proteins

• Project/Area Number: 19880011
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Applied microbiology
• Research Institution: Niigata University
• Principal Investigator: SUZUKI Kazushi Niigata University, 自然科学系, 准教授 (00444183)
• Research Collaborator: TONY Romeo フロリダ大学, 微生物細胞科学, 教授
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥2,874,000 (Direct Cost: ¥2,520,000、Indirect Cost: ¥354,000); Fiscal Year 2008: ¥1,534,000 (Direct Cost: ¥1,180,000、Indirect Cost: ¥354,000); Fiscal Year 2007: ¥1,340,000 (Direct Cost: ¥1,340,000)
• Keywords: 大腸菌 / バイオフィルム / GGDEFドメイン / EALドメイン / c-di-GMP / Csrシステム / small RNA

Research Abstract

自然環境中の固体表面に細菌が付着し形成する「バイオフィルム」の形成制御メカニズムを解明するため、small RNAの安定性を制御するGGDEF/EAL蛋白質CsrDと細胞内のシグナル物質c-di-GMPの代謝に関わるGGDEF/EAL蛋白質に関する研究を行った。CsrDの機能に重要と思われるアミノ酸残基をアラニン残基に置換した変異型CsrDの解析の結果、CsrDの活性に重要な領域が明らかとなった。また、GGDEF/EAL蛋白質は多糖であるPGAの産生を調節することでバイオフィルムを制御していることが明らかとなった。

Research Products

• [Presentation] 大腸菌CsrB/C RNAの安定性を制御するCsrDの解析 (2008)
  • Author(s): 水野孝彦、Tony Romeo、渡邉剛志、鈴木一史
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会, 第81回日本生化学会大会・合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド、神戸
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] 大腸菌CsrB/C RNAの安定性を制御するCsrDの解析 (2008)
  • Author(s): 水野孝彦, Tony Romeo, 渡邉剛志, 鈴木一史
  • Organizer: 第31回日本分子生物学会年会,第81回日本生化学会大会・合同大会
  • Place of Presentation: 神戸ポートアイランド、神戸
  • Year and Date: 2008-12-09
• [Presentation] Site-Directed Mutagenesis of CsrD, a Specificity Factor for Degradosome-Mediated Decay of CsrB/C RNAs in Escherichia coli (2008)
  • Author(s): Kazushi Suzuki, Yasuhiro Fujiu, Takahiko Mizuno, Takeshi Watanabe, and Tony Romeo
  • Organizer: American Society for Microbiology 108th General Meeting
  • Place of Presentation: Boston Convention and Exposition Center、ボストン・アメリカ合衆国
  • Year and Date: 2008-06-05
• [Presentation] PGA Accumulation and Biofilm Formation in Escherichia coli : Modulation by c-di-GMP (2008)
  • Author(s): Carrlos C. Goller, Archana Pannuri, Yoshikane Itoh, Kazushi Suzuki, and Tony Romeo
  • Organizer: American Society for Microbiology 108th General Meeting
  • Place of Presentation: Boston Convention and Exposition Center、ボストン・アメリカ合衆国
  • Year and Date: 2008-06-03
• [Presentation] 大腸菌small RNA CsrB/C の安定性を制御するCsrD のアラニン置換変異による解析 (2008)
  • Author(s): 藤生康宏、水野孝彦、Tony Romeo、渡邉剛志、鈴木一史
  • Organizer: 日本農芸化学会2008年度大会
  • Place of Presentation: 名城大学、名古屋
  • Year and Date: 2008-03-28
• [Presentation] 大腸菌small RNA CsrB/Cの安定性を制御するCsrDのアラニン置換変異による解析 (2008)
  • Author(s): 鈴木 一史
  • Organizer: 日本農芸化学会2008年度大会
  • Place of Presentation: 名古屋(名城大学)
  • Year and Date: 2008-03-28
• [Remarks]
  • URL: http://www.agr.niigata-u.ac.jp/profile/suzuki/index.html
• [Remarks]
  • URL: http://www.agr.niigata-u.ac.jp/profile/suzuki/index.html