Expansion of FD-LC-MS/MS method into the clinical proteomics:application to a mouse model for hepatitis C

• Project/Area Number: 19890230
• Research Category: Grant-in-Aid for Young Scientists (Start-up)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Medical pharmacy
• Research Institution: Musashino University
• Principal Investigator: ICHIBANGASE Tomoko Musashino University, 薬学研究所, 助教 (40453956)
• Project Period (FY): 2007 – 2008
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2008)
• Budget Amount: ¥2,967,000 (Direct Cost: ¥2,580,000、Indirect Cost: ¥387,000); Fiscal Year 2008: ¥1,677,000 (Direct Cost: ¥1,290,000、Indirect Cost: ¥387,000); Fiscal Year 2007: ¥1,290,000 (Direct Cost: ¥1,290,000)
• Keywords: プロテオーム解析 / 高速液体クロマトグラフィー / ロテオーム解析用発蛍光試薬 / DAABD-Cl / 蛍光誘導体化反応 / FD-LC-MS / MS 法 / ディファレンシャル解析 / C 型肝炎モデルマウス / プロテオーム解析用発蛍光試薬 / DAABD-C1 / MS法 / C型肝炎モデルマウス

Research Abstract

以前開発したタンパク質解析法(FD-LC-MS/MS 法)の利便性を活用して、生体試料(肝臓や血液)への適用性を精査し、C 型肝炎の病態関連タンパク質(バイオマーカー)を明らかにすることを目的とした。その結果、2007 年度では、本法の肝臓試料への適用性並びに有用性が示された。2008 年度では、血液試料への応用性を検討したところ、バイオマーカーの有用性を考察することはできなかったが、血液中タンパク質解析の分野で多用される前処理操作法の欠陥を発見し、この前処理法の安易な採用への警告を世界に発信ことができた。

Research Products

• [Journal Article] Limitation of immunoaffinity column for the removal of abundant proteins from plasma in quantitative plasma proteomics (2009)
  • Author(s): Tomoko Ichibangase, Kyoji Moriya, Kazuhiko Koike, Kazuhiro Imai
  • Journal Title: Biomedical Chromatography 23 Pages: 480-487
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] A Proteomics Method Revealing Disease-Related Proteins in Livers of Hepatitis-Infected Mouse Model (2007)
  • Author(s): Tomoko Ichibangase, Kyoji Moriya, Kazuhiko Koike, Kazuhiro Imai
  • Journal Title: Journal of Proteome Research 6
  • Peer Reviewed
• [Presentation] 定量的血漿プロテオミクスにおける血漿前処理用抗体カラム使用への提言/Fluorogenic Derivatization-Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry Method (FD-LC-MS/MS 法)を用いて (2009)
  • Author(s): 一番ヶ瀬 智子
  • Organizer: 第129年会 日本薬学会
  • Place of Presentation: 京都(京都大学(桂キャンパス)船井哲良記念講堂)
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] 定量的血漿プロテオミクスにおける血漿前処理用抗体カラム使用への提言/Fluorogenic Derivatization-Liquid Chromatography-Tandem Mass Spectrometry Method (FD-LC-MS/MS 法)を用いて (2009)
  • Author(s): 一番ヶ瀬 智子
  • Organizer: 第129年会 日本薬学会
  • Place of Presentation: 京都(グランドプリンスホテル京都)
  • Year and Date: 2009-03-28
• [Presentation] クロマトグラフィーの特性を利用した血漿前処理カラムの使用評価:FD-LC-MS/MS プロテオーム解析法による評価 (2008)
  • Author(s): 一番ヶ瀬 智子
  • Organizer: 第19回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 京都(グランドプリンスホテル京都)
  • Year and Date: 2008-12-01
• [Presentation] クロマトグラフィーの特性を利用した血漿前処理カラムの使用評価 : FD-LC-MS/MSプロテオーム解析法による評価 (2008)
  • Author(s): 一番ヶ瀬 智子
  • Organizer: 第19回クロマトグラフィー科学会議
  • Place of Presentation: 京都(京都大学(桂キャンパス)船井哲良記念講堂)
  • Year and Date: 2008-12-01