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Analysis of total regulatory mechanism of gene expression mediated by transcription speed control

Research Project

Project/Area Number 19H00973
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Medium-sized Section 43:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

Murakami Yota  北海道大学, 理学研究院, 教授 (20260622)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 梶谷 卓也  福井大学, その他部局等, 日本学術振興会特別研究員 (20883078)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥45,500,000 (Direct Cost: ¥35,000,000、Indirect Cost: ¥10,500,000)
Fiscal Year 2021: ¥13,910,000 (Direct Cost: ¥10,700,000、Indirect Cost: ¥3,210,000)
Fiscal Year 2020: ¥13,910,000 (Direct Cost: ¥10,700,000、Indirect Cost: ¥3,210,000)
Fiscal Year 2019: ¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Keywords転写速度 / 遺伝子発現 / クロマチン / RNAポリメラーゼⅡ / CTDリン酸化 / 転写終結 / 転写一時停止 / ヘテロクロマチン / 分裂酵母 / クロマチン構造 / 転写 / RNAポリメラーゼ / RNAi / RNAプロセシング / RNAポリメラーゼII / エピゲノム
Outline of Research at the Start

RNAのプロセシングや輸送といったRNA動態制御やエピゲノム制御などの遺伝子発現制御の初期段階は転写と共役して協調的に制御される考えられるが、その全体像や分子機構の詳細はまだわかっていない。本研究では「RNAの動態やエピゲノムがどのように転写と協調的に制御されているのか」という疑問に答えるために、RNAポリメラーゼⅡ(Pol2)のC末ドメインのSer7(CTD-S7)のリン酸化が転写のブレーキとして転写速度を制御し、それがエピゲノム制御、RNA動態制御に深く関与するという独自の知見にもとづき、CTD-S7リン酸化による転写速度制御を介したゲノムワイドな遺伝子発現の協調的制御機構を明らかにする。

Outline of Final Research Achievements

We previously showed that phosphorylation of Ser7 (S7-P) of RNA polymerase II C-terminal domain (CTD) is important for the regulation of transcription speed by RNA polymerase II. In this study, based on the previous results, we analyzed the function and action mechanism of S7-P using fission yeast. We found that S7-P functions as a “brake” of transcription at the transcription initiation site and that the braking mechanism includes the control of the chromatin structure at the initiation site. Furthermore, we indicated the multiple regulatory function of S7-P, including transcription termination, heterochromatin formation, other CTD phosphorylation and stress response.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細胞・生物が外的・内的環境変化に対応する仕組みの理解は生命理解のために重要であり、医学の進歩にも重要である。本研究では、生命の環境適応に重要な遺伝子発現制御について、特に遺伝子読み取り過程である「転写」の速度制御が最終的な遺伝子の発現に大きな影響を及ぼすことを示し、その分子機構の一部を明らかにしたものである。今まで転写速度という観点からの研究は少なく、この分野に新たな視点を導入した。

Report

(5 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Comments on the Screening Results   Annual Research Report
  • Research Products

    (14 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Cornel University(米国)

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      2020 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] Namur Research Collage(ベルギー)

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  • [Int'l Joint Research] ナミュール大学・NARC(ベルギー)

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  • [Int'l Joint Research] コーネル大学・MGB(米国)

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  • [Journal Article] Histone variant H2A.Z plays multiple roles in the maintenance of heterochromatin integrity2022

    • Author(s)
      Kazuki Tsukii, Shinya Takahata, Yota Murakami
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 27 Issue: 2 Pages: 93-112

    • DOI

      10.1111/gtc.12911

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Trimethylguanosine synthase 1 (Tgs1) is involved in Swi6/HP1‐independent siRNA production and establishment of heterochromatin in fission yeast2021

    • Author(s)
      Yu Hiroki、Tsuchida Mai、Ando Motoyoshi、Hashizaki Tomoka、Shimada Atsushi、Takahata Shinya、Murakami Yota
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 26 Issue: 4 Pages: 203-218

    • DOI

      10.1111/gtc.12833

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Two secured FACT recruitment mechanisms are essential for heterochromatin maintenance.2021

    • Author(s)
      Shinya Takahata, Saori Chida, Aoi Ohnuma, Motoyoshi Ando, Takahiro Asanuma, YotaMurakami
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 36 Issue: 7 Pages: 109540-109540

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2021.109540

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      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 転写装置RNA polymerase II CTD-Ser7リン酸化は転写一時停止とヘテロクロマチン形成を促進する。2021

    • Author(s)
      梶谷 卓也、加藤 太陽、Damien Hermand、沖 昌也、John Lis、 村上 洋太
    • Organizer
      第39回染色体ワークショップ・第20回核ダイナミクス研究会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 遺伝子発現と細胞周期の相関関係について2021

    • Author(s)
      梶谷卓也、沖昌也
    • Organizer
      日本遺伝学会 第93回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 細胞周期とクロマチン構造の関係性の検証2021

    • Author(s)
      梶谷卓也、沖昌也
    • Organizer
      第54回酵母遺伝学フォーラム
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA polymerase IIリン酸化による転写一時停止はエピジェネティクス情報不均一さを抑制する2020

    • Author(s)
      梶谷卓也, John Lis, 村上洋太、沖昌也
    • Organizer
      日本生化学会北陸支部第38回大会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA polymerase IIによるエピジェネティクス転写とヒストン修飾の安定性制御2020

    • Author(s)
      梶谷卓也、Damien Hermand, John Lis, 沖昌也、村上洋太
    • Organizer
      日本エピジェネティクス研究会年会
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Phosphorylation of C-terminal repeat domain (CTD) of RNA polymerase II regulates RNAi-dependent heterochromatin formation.2019

    • Author(s)
      村上洋太
    • Organizer
      Seminar in Institute of Genetics and Molecular and Cellular Biology, Strasburg University
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      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] RNA polymerase II CTD Ser7による転写一時停止とヒストン修飾制御2019

    • Author(s)
      梶谷卓也、石井ひとみ、加藤太陽、Abdullah Ozer、近重裕次、木村宏、大川恭行、Damien Hermand、John Lis、村上洋太
    • Organizer
      日本遺伝学会第91回大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-12-25  

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