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Elucidation of biological functions and synthetic machinery of bacterial glucuronic acid-containing glycolipids

Research Project

Project/Area Number 19H02888
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

OKINO Nozomu  九州大学, 農学研究院, 准教授 (90363324)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 角田 佳充  九州大学, 農学研究院, 教授 (00314360)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2019: ¥8,320,000 (Direct Cost: ¥6,400,000、Indirect Cost: ¥1,920,000)
Keywords細菌スフィンゴ糖脂質 / 糖転移酵素 / 糖脂質 / スフィンゴ糖脂質 / グルクロノシルセラミド / 緑膿菌 / スフィンゴモナス / αーガラクトシルセラミド / グルクロノシルジアシルグリセロール / グルコシルジアシルグリセロール / Sphingobium yanoikuyae / Bacteriodes fragilis / グルクロノシルセラミドグ / Zymomonas mobilis
Outline of Research at the Start

細菌由来の複合糖脂質はバリア機能などの重要な役割を有すると共に、感染時に宿主の免疫系を活性化することから、その構造や生物機能に関する研究がなされている。近年、細菌由来の単純な糖脂質にリンの飢餓応答や細菌感染における免疫細胞の活性化などの重要な役割があることが明らかになり、これら糖脂質の新たな生物機能に注目が集まっている。本研究では、緑膿菌がリン欠乏時に合成するグリセロ糖脂質の構造と生物機能並びに、細菌由来のスフィンゴ糖脂質の生物機能を解明すると共に、それら糖脂質の合成マシナリーを明らかにする。本研究はヒトの健康や産業に重要な細菌が有する糖脂質の新たな生物機能とその重要性の解明に貢献する。

Outline of Final Research Achievements

In this study, we focused on bacterial glucuronic acid-containing glycolipids and their synthases. We successfully identified α-glucuronosylceramide synthase (Cer-GlcAT) of Sphingobium yanoikuyae (SyaCer-GlcAT) and α-galactosylceramide synthase of the intestinal bacterium Bacteroides fragilis, as homologs of Cer-GlcAT of Zymomonas mobilis. Furthermore, SyaCer-GlcAT was overexpressed in Escherichia coli, purified, and crystallized to reveal the synthetic machinery of α-glucuronosylceramide. X-ray crystal structure analysis revealed the first-ever 3D structure of Cer-GlcAT. We also determined the structure of three glycolipids synthesized by Pseudomonas aeruginosa under phosphorus deficiency and identified their synthases.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

細菌由来のスフィンゴ糖脂質にはNKT細胞の活性化能があることから、本研究において、細菌由来のα-グルクロノシルセラミドとα-ガラクトシルセラミドの合成酵素遺伝子が特定できた意義は大きい。また、本研究ではα-グルクロノシルセラミド合成酵素のX線結晶構造解析に取り組み、細菌スフィンゴ糖脂質の合成酵素としては初めて、その高次構造解析に成功した。一方、緑膿菌がリン欠乏時に合成するグリセロ型糖脂質に関しても、その合成酵素遺伝子を全て明らかにすることに成功した。これら糖脂質は緑膿菌の薬剤耐性と関わっていることが推定されるので、その阻害剤の開発は緑膿菌に対する新規抗菌剤の開発に繋がる可能性がある。

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (15 results)

All 2021 2020 2019

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 4 results)

  • [Journal Article] Two bacterial glycosphingolipid synthases responsible for the synthesis of glucuronosylceramide and α-galactosylceramide2020

    • Author(s)
      Okino, N. Li, M. Qu, Q. Nakagawa, T. Hayashi, Y. Matsumoto, M. Ishibashi, Y. Ito, M.
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 295 Issue: 31 Pages: 10709-10725

    • DOI

      10.1074/jbc.ra120.013796

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 緑膿菌PlcP のリン欠乏下における機能解析2021

    • Author(s)
      島 聡明、石橋洋平、沖野 望
    • Organizer
      令和3年度日本生化学会九州支部例会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Sphingomonas paucimobilis 由来のスフィンゴ糖脂質合成酵素の同定2021

    • Author(s)
      伊東佳穂、石橋洋平、沖野 望
    • Organizer
      第14回セラミド研究会 学術集会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 緑膿菌由来グルコシルジアシルグリセロール合成酵素の解析2021

    • Author(s)
      朱 浩賢、石橋洋平、沖野 望
    • Organizer
      第40回日本糖質学会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] Sphingomonas paucimobilis 由来のスフィンゴ糖脂質の解析とその合成酵素の同定2021

    • Author(s)
      伊東佳穂、石橋洋平、沖野 望
    • Organizer
      第40回日本糖質学会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 糖転移酵素から明らかにする細菌スフィンゴ脂質の機能性2021

    • Author(s)
      沖野 望
    • Organizer
      第94回 日本生化学会大会
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      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] バクテロイデス由来α-ガラクトシルセラミド合成酵素の同定と解析2021

    • Author(s)
      沖野 望、曲 清俊、石橋洋平、伊東 信
    • Organizer
      日本農芸化学会2021年度大会 (オンライン開催)
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 宿主免疫を活性化する細菌由来の糖脂質を合成する糖転移酵素2020

    • Author(s)
      沖野 望
    • Organizer
      第62回日本脂質生化学会 (誌上開催)ミニシンポジウム
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      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 細菌由来グルクロノシルセラミドとα-ガラクトシルセラミド合成酵素の同定2020

    • Author(s)
      沖野 望、曲 清俊、李 夢白、石橋洋平、伊東 信
    • Organizer
      第39回 日本糖質学会年会 (誌上開催)
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of glycolipids of Pseudomonas aeruginosa under phosphate stravation conditions2020

    • Author(s)
      Zhu H, Ishibashi Y, Okino N
    • Organizer
      JSBBA WEST 3rd Student Forum (オンライン開催)
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification and characterization of a bacterial α-galactosylceramide synthase2020

    • Author(s)
      Qu Q, Ishibashi Y, Okino N
    • Organizer
      JSBBA WEST 3rd Student Forum (オンライン開催)
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] 細菌由来グルクロン酸含有糖脂質合成酵素の機能解析2020

    • Author(s)
      沖野 望
    • Organizer
      日本農芸化学会2020年度大会
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      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Identification and functional characterization of ceramide UDP-glucronosyltransferase in Zymomonas mobilis2019

    • Author(s)
      Nozomu Okino, Mengbai Li, Yohei Ishibashi, Makoto Ito
    • Organizer
      60th International Converence on the Bioscience of Lipids
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Zymomonas mobilisはグルクロノシルセラミドが欠損するとセラミドホスホグリセロールを合成する2019

    • Author(s)
      沖野 望、李 夢白、石橋 洋平、伊東 信
    • Organizer
      第61回日本脂質生化学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification and functional analysis of the bacterial glucuronosylceramide synthase2019

    • Author(s)
      Nozomu Okino, Makoto Ito
    • Organizer
      11th Asian Community of Glycoscience and Glycotechnology Conference
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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