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Construction of gene expression network information related to coral-zooxanthellae symbiosis establishment/ breakdown

Research Project

Project/Area Number 19H03026
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 40030:Aquatic bioproduction science-related
Research InstitutionYamaguchi University (2020-2022)
University of Tsukuba (2019)

Principal Investigator

Yuyama Ikuko  山口大学, 大学研究推進機構, 助教 (80565995)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 神保 充  北里大学, 海洋生命科学部, 教授 (10291650)
橋本 哲男  筑波大学, 生命環境系, 教授 (50208451)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥15,210,000 (Direct Cost: ¥11,700,000、Indirect Cost: ¥3,510,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2019: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Keywordscoral / Symbiodiniaceae / symbiosis / coral breaching / RNAi / stress response / proteomics / transcriptome / サンゴ / 褐虫藻 / 細胞内共生 / プロテオーム解析 / トランスクリプトーム解析 / サンゴー褐虫藻細胞内共生 / 白化現象 / プロテオミクス / トランスクリプトミクス / 遺伝子共発現ネットワーク / 有藻性サンゴ / RNA-seq / プロテオーム / サンゴー褐虫藻共生体 / 共発現ネットワーク解析 / ストレス応答 / 遺伝子発言解析 / サンゴ-褐虫藻細胞内共生 / 遺伝子共発現ネットワーク解析
Outline of Research at the Start

サンゴ礁は地球温暖化の影響を受けやすく、海水温が上昇すると白化現象を起こし死滅する。サンゴの生存の鍵となるのは、共生する褐虫藻であり、高水温ストレスで体内の褐虫藻が減少するとサンゴは衰弱する。本研究の目的は「サンゴー褐虫藻の共生・白化に直結する遺伝子の同定と、それらを取り巻く遺伝子発現ネットワークの構築」とする。そのために、稚サンゴに褐虫藻を共生させ、共生成立・白化時に発現変動するタンパク質の情報を得る。また遺伝子ノックダウンにより共生成立に関わる遺伝子を特定する。最終的にそれらの情報を元に共生・白化に関わる遺伝子発現ネットワークを作成し、その分子プロセスの全容を理解することを目指す。

Outline of Final Research Achievements

We identified the genes and proteins whose expression changes during the symbiotic process of coral and zooxanthellae, and attempted to clarify the main phenomena occurring in the corals as the symbiosis progresses. As a result, proteins related to lipid metabolism, ER membrane proteins, and proteins related to ATP synthesis were identified as proteins whose expression increased with the symbiosis establishment. A part of these genes were used for gene knockdown experiment by RNAi, and clarified that some symbiotically up-regulated genes affect the progress of symbiosis. In addition, we investigated genes related to coral bleaching, and summarize them in a paper.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

サンゴー褐虫藻の共生関連遺伝子や白化関連遺伝子の応答は進んでいるものの、情報量が多く共生や白化に主に関わる分子の同定には至っていなかった。本研究でプロテオーム解析やRNAiにより、共生時の主な変化や共生に影響する遺伝子の特定を行うことができ、今後の研究を進める上でのターゲット遺伝子を明確にできた。共生をコントロールする遺伝子の同定はサンゴー褐虫藻以外にも他の細胞内共生系の解明にも関わる。また解析結果の詳細を調べる過程で、細胞内共生時に起きる主な生理学的応答を調べることができ、共生時の宿主の詳細な応答を明らかにすることができた。

Report

(4 results)
  • 2022 Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 4 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Metatranscriptomic Analysis of Corals Inoculated With Tolerant and Non-Tolerant Symbiont Exposed to High Temperature and Light Stress2022

    • Author(s)
      Yuyama Ikuko、Higuchi Tomihiko、Mezaki Takuma、Tashiro Hisako、Ikeo Kazuho
    • Journal Title

      Frontiers in Physiology

      Volume: 13 Pages: 806171-806171

    • DOI

      10.3389/fphys.2022.806171

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transcriptome Analysis of Durusdinium Associated with the Transition from Free-Living to Symbiotic2021

    • Author(s)
      Yuyama Ikuko、Ugawa Naoto、Hashimoto Tetsuo
    • Journal Title

      Microorganisms

      Volume: 9 Issue: 8 Pages: 1560-1560

    • DOI

      10.3390/microorganisms9081560

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Application of RNA Interference Technology to Acroporid Juvenile Corals2021

    • Author(s)
      Yuyama Ikuko、Higuchi Tomihiko、Hidaka Michio
    • Journal Title

      Frontiers in Marine Science

      Volume: 8 Pages: 688876-688876

    • DOI

      10.3389/fmars.2021.688876

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] サンゴー褐虫藻の共生関係/サンゴの白化現象の解明を目指した研究2020

    • Author(s)
      湯山 育子
    • Journal Title

      生物の科学 遺伝

      Volume: 4 Pages: 426-423

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] Differential gene expression in skeletal organic matrix proteins of scleractinian corals associated with mixed aragonite/calcite skeletons under low mMg/Ca conditions2019

    • Author(s)
      Ikuko Yuyama, Tomihiko HIguchi
    • Journal Title

      PeerJ

      Volume: e7241 Pages: 1-13

    • DOI

      10.7717/peerj.7241

    • NAID

      120007133130

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Acropora tenuis による褐虫藻維持 におけるインテレクチン様 タンパク質の機能の検討2022

    • Author(s)
      下川 花也, 湯山 育子, 山下 洋, 鈴木 豪, 天野 春菜, 安本 剛, 神保 充
    • Organizer
      日本サンゴ礁学会第25回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 褐虫藻に秘められたサンゴ-褐虫藻共生の仕組み2021

    • Author(s)
      湯山育子
    • Organizer
      原生生物・寄生虫・進化セミナー
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 造礁性サンゴにおける遺伝子ノックダウン技術の確立と応用2021

    • Author(s)
      湯山育子, 樋口富彦, 日高道雄
    • Organizer
      日本サンゴ礁学会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] サンゴのレクチンAtTL-2 は,褐虫藻の細胞内への貪食に関与している2021

    • Author(s)
      神保充, 神谷直輝, 湯山育子, 山下洋, 鈴木豪, 波利井佐紀, 天野春菜, 安元剛
    • Organizer
      水産学会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] サンゴに共生する褐虫藻は、サンゴ内でどのように変化するのか2019

    • Author(s)
      湯山育子、宇川 尚登、橋本 哲男
    • Organizer
      日本微生物生態学会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] RNA-seq データが示す共生状態への移行に伴う褐虫藻の変化-光合成・アンモニア 利用効率UP-2019

    • Author(s)
      湯山育子、宇川 尚登、橋本 哲男
    • Organizer
      日本原生生物学会第52会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] RNAi によるAcropora tenuisレクチン遺伝子の発現抑制と褐虫藻獲得2019

    • Author(s)
      神保 充、 湯山 育子、 山下洋、 鈴木豪、 波利井佐紀、 服田昌之、 新里宙也、 天野春菜、 安元剛
    • Organizer
      日本サンゴ礁学会第22回大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] サンゴと褐虫藻の共生関係を褐虫藻の増減からとらえる2019

    • Author(s)
      湯山育子
    • Organizer
      共生起源研究
    • Related Report
      2019 Annual Research Report

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Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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