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Elucidation of commonalities and specificities in genomic imprinting inheritance by novel mechanisms

Research Project

Project/Area Number 19H03134
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 42030:Animal life science-related
Research InstitutionUniversity of Tsukuba

Principal Investigator

Tanimoto Keiji  筑波大学, 生命環境系, 教授 (90261776)

Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥17,030,000 (Direct Cost: ¥13,100,000、Indirect Cost: ¥3,930,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2019: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Keywordsゲノム刷り込み / 遺伝子改変マウス / 制御分子 / DNAメチル化 / エピジェネティクス / 幹細胞 / 種特異性
Outline of Research at the Start

哺乳動物は父親と母親からゲノムを継承し、ほとんどの遺伝子は子供において同等に発現するが、一部遺伝子は、どちらかの親から受け継がれたときにだけ転写される(=ゲノム刷り込み)。アリルが由来する親の性は、生殖細胞でゲノムに付加されるDNAメチル化により区別される。ところが我々は、生殖細胞でのメチル化がなくとも、受精後に、片アリルのみでDNAのメチル化が起こり、ゲノム刷り込みが正常に制御されることを見いだした。本研究では、親から子へと継承される「新規の印」を介した遺伝様式の理解のために、受精後刷り込みメチル化に関わる分子の同定と、その種間や遺伝子座間での制御メカニズムの共通性と特異性の解明を目指す。

Outline of Final Research Achievements

The objective of this study is to understand the molecular mechanism of "genomic imprinting”, an epigenetic phenomenon unique to placental mammals, through elucidation of the “postfertilization imprinted methylation activity”, which we originally discovered. During the project period, we identified several proteins (binding activities) bound to the 118bp sequence of the H19 ICR by gel shift assay, which is essential for the phenomenon, and generated transgenic mice carrying mutations in the cis-binding motifs to verify their functions (3 conference presentations and one manuscript in preparation). In addition, by generating transgenic mice, the conservation of post-fertilization imprinted methylation phenomena in human and rat H19 ICR and other DMRs (IG-DMR) was demonstrated (5 conference presentations, one paper published).

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

学術的意義:DNA塩基配列に依存しない遺伝様式であるエピジェネティクスにおいて、その情報の担い手はDNAメチル化やヒストン修飾であり、これらは細胞分裂や世代を超えて継承される。ゲノム刷り込みでは、生殖細胞でのDNAメチル化が、受精後に両アレルを区別するためのマークと考えられているが、我々の成果は、新規マークの存在を示唆する。
社会的意義:ゲノム刷り込み異常が関わるエピジェネティクス疾患の原因として、生殖細胞での確立、あるいは、着床後の維持過程における刷り込みメチル化の破綻がある。我々の成果は、受精直後の維持過程でも破綻が生じうることを示唆し、関与する分子の同定により、治療や診断が可能となる。

Report

(3 results)
  • 2022 Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2020 2019 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results) Presentation (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Transient establishment of imprinted DNA methylation of transgenic human IC1 sequence in mouse during the preimplantation period2020

    • Author(s)
      Hirakawa, K., Matsuzaki, H., and Tanimoto, K.
    • Journal Title

      Human Molecular Genetics

      Volume: 29 Issue: 22 Pages: 3646-3661

    • DOI

      10.1093/hmg/ddaa253

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recapitulation of gametic DNA methylation and its post-fertilization maintenance with reassembled DNA elements at the mouse Igf2/H19 locus2020

    • Author(s)
      Matsuzaki, H., Kuramochi, D., Okamura, E., Hirakawa, K., Ushiki, A., and Tanimoto, K.
    • Journal Title

      Epigenetics & Chromatin

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 2-2

    • DOI

      10.1186/s13072-019-0326-1

    • NAID

      120007132843

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] マウスH19-ICR配列のin vivo反転によるインプリント遺伝子発現機構の解明2020

    • Author(s)
      松﨑 仁美、宮嶋 優、谷本 啓司
    • Organizer
      第43回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] ヒトH19-ICR YACトランスジェニック・マウスを用いた受精後刷り込みメチル化活性の検証2020

    • Author(s)
      松﨑 仁美、平川勝彦、谷本 啓司
    • Organizer
      第93回日本生化学会大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Test for DNA methylation activity of the human H19-ICR in YAC transgenic mice by adopting a transgene co-placement strategy2019

    • Author(s)
      Hirakawa, K., Hitomi, M., Tanimoto, K.
    • Organizer
      The 15th Transgenic Technology Meeting
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Reconstituted H19 ICR sequence with identified cis elements is capable of maintaining genomic imprinting in knock-in mouse2019

    • Author(s)
      Hitomi Matsuzaki, Daichi Kuramochi, Katsuhiko Hirakawa, and Keiji Tanimoto
    • Organizer
      33rd International Mammalian Genome Conference
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] YACトランスジェニック・マウスを用いたヒトH19-ICR刷り込みメチル化メカニズムの検証2019

    • Author(s)
      平川 勝彦、松崎 仁美、谷本 啓司
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] マウスのゲノム刷り込み制御におけるH19-ICR配列反転の効果2019

    • Author(s)
      宮嶋 優、谷本 啓司、松崎 仁美
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] A genetic test for transvection-like interchromosomal functional interaction at the mouse Rosa26 locus2019

    • Author(s)
      Keiji Tanimoto, Hitomi Matsuzaki and James Douglas Engel
    • Organizer
      第42回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 谷本研究室(ゲノム情報生物学)

    • URL

      https://sites.google.com/view/tanimoto-lab

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Remarks] 筑波大学生命環境科学研究科谷本研究室

    • URL

      http://kt-b1-mac1.tara.tsukuba.ac.jp/~tanimotokeiji/Keijis/Welcome.html

    • Related Report
      2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2024-12-25  

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