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Elucidation and therapeutic application of ubiquitination mechanisms in the PMQC

Research Project

Project/Area Number 19H03185
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 43030:Functional biochemistry-related
Research InstitutionKwansei Gakuin University

Principal Investigator

Okiyoneda Tsukasa  関西学院大学, 生命環境学部, 教授 (90398248)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 中村 照也  熊本大学, 大学院先導機構, 准教授 (40433015)
高橋 宏隆  愛媛大学, プロテオサイエンスセンター, 准教授 (70432804)
石黒 洋  名古屋大学, 総合保健体育科学センター, 教授 (90303651)
福田 亮介  関西学院大学, 生命環境学部, 助教 (90825308)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2022-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2021)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2019: ¥9,100,000 (Direct Cost: ¥7,000,000、Indirect Cost: ¥2,100,000)
Keywordsタンパク質品質管理 / ユビキチン化 / ユビキチンリガーゼ / DUB / 嚢胞性線維症 / CFTR / ユビキチン / 形質膜
Outline of Research at the Start

本研究では,PMQC E3 リガーゼがどのように異常タンパク質を認識し,異なる分解経路へ導くのかを結晶構造解析及び Ub コード生成解析により解明する.また,siRNA 表現型スクリーニングと無細胞合成系を利用した網羅的相互作用解析により,PMQC 関連 DUB を同定し,DUB が PMQC E3 と協調してどのような基質の Ub コードをどのように制御し,異なる分解経路へ導くのか,その作動原理を解明する.さらに,マウスオルガノイド及び個体レベルの解析から,嚢胞性線維症(CF)の治療標的分子としての PMQC E3 リガーゼの有効性を実証する.

Outline of Final Research Achievements

Conformationally defective membrane proteins at the plasma membrane (PM) are ubiquitinated and degraded by a PM protein quality control mechanism (PMQC). In this study, using a CFTR mutant associated with cystic fibrosis, we have revealed the molecular mechanism of how the PMQC-related ubiquitin (Ub) ligases such as RFFL recognize the misfolded CFTR. The types of ubiquitination signal on the CFTR catalyzed by the PMQC-related Ub ligases were also revealed. Furthermore, we have identified deubiquitination enzymes (DUB) that regulate the PM expression, stability, and ubiquitination of the CFTR mutant or that regulate the expression and function of the PMQC-related Ub ligases.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

形質膜に存在する異常タンパク質は, 形質膜タンパク質品質管理機構(PMQC)により除去される.本研究成果は,あまり理解が進んでいないPMQCにどのような分子が関与するのか,その分子メカニズムの理解に加えて,どのように形質膜の異常膜タンパク質がPMQC関連分子に認識され,どのようにユビキチン化が制御されるのか,PMQCの制御メカニズムの理解に貢献する.さらに, PMQCが関わる嚢胞性線維症などの難治性疾患の新しい治療戦略 (治療標的分子) の提案に貢献する.

Report

(4 results)
  • 2021 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2022 2021 2020 2019 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 6 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The Ubiquitin Ligase RNF34 Participates in the Peripheral Quality Control of CFTR (RNF34 Role in CFTR PeriQC)2022

    • Author(s)
      Taniguchi Shogo、Ito Yukiko、Kiritani Hibiki、Maruo Asuka、Sakai Ryohei、Ono Yuji、Fukuda Ryosuke、Okiyoneda Tsukasa
    • Journal Title

      Frontiers in Molecular Biosciences

      Volume: 9

    • DOI

      10.3389/fmolb.2022.840649

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] CFTR protein quality control mechanism and its modulation for therapeutic approaches2020

    • Author(s)
      福田 亮介、沖米田 司
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 92 Issue: 2 Pages: 179-188

    • DOI

      10.14952/SEIKAGAKU.2020.920179

    • NAID

      40022245229

    • ISSN
      0037-1017
    • Year and Date
      2020-04-25
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Journal Article] Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator (CFTR) Ubiquitylation as a Novel Pharmaceutical Target for Cystic Fibrosis2020

    • Author(s)
      Fukuda Ryosuke、Okiyoneda Tsukasa
    • Journal Title

      Pharmaceuticals

      Volume: 13 Issue: 4 Pages: 75-75

    • DOI

      10.3390/ph13040075

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 嚢胞性線維症のユビキチン創薬2020

    • Author(s)
      沖米田 司
    • Journal Title

      Farumashia

      Volume: 56 Issue: 1 Pages: 31-35

    • DOI

      10.14894/faruawpsj.56.1_31

    • NAID

      130007779034

    • ISSN
      0014-8601, 2189-7026
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Journal Article] ELISA Based Protein Ubiquitylation Measurement2019

    • Author(s)
      Kamada Yuka、Fukuda Ryosuke、Okiyoneda Tsukasa
    • Journal Title

      BIO-PROTOCOL

      Volume: 9 Issue: 22

    • DOI

      10.21769/bioprotoc.3430

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 嚢胞性線維症における上皮細胞の水の輸送障害を理解する2019

    • Author(s)
      福田亮介, 沖米田司
    • Journal Title

      消化器病学サイエンス

      Volume: 3 Pages: 82-86

    • Related Report
      2019 Annual Research Report
  • [Presentation] CFTR 関連ユビキチンリガーゼの阻害剤探索と治療的応用2022

    • Author(s)
      松浦 佑大、谷口 幸穂、小野 裕司、土井 由佳子、近藤 恭光、本田 香織、長田 裕之、 井上 敬太郎、山口 美穂、田代 杏樹、青木 俊介、福田 亮介、沖米田 司
    • Organizer
      日本薬学会第142年会
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] CFTR 形質膜品質管理における RING 型 E3 Ligase CARP1 の機能解析2021

    • Author(s)
      谷口正伍、酒井了平、丸尾明日香、桐谷響暉、福田亮介、沖米田司
    • Organizer
      2021年度生理研研究会『 上皮膜輸送の多様性・調和機構を基盤とする異分野融合研究の創出』
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      2021 Annual Research Report
  • [Presentation] 塩素イオンチャネル CFTR 変異体の小胞体関連分解における HECT 型ユビキチンリガーゼの機能解析2020

    • Author(s)
      鎌田優香、中島千雅子、福田亮介、沖米田司
    • Organizer
      2020年度生理研研究会『 上皮膜輸送の多様性・調和機構を基盤とする異分野融合研究の創出』
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] CFTR ユビキチン化を標的とした嚢胞性線維症の治療薬開発2020

    • Author(s)
      沖米田司
    • Organizer
      第 93 回日本生化学会大会シンポジウム ケモテクノロジーが拓くユビキチン ニューフロンティア
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      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] CFTR ユビキチン化機構を標的とした嚢胞性線維症の治療戦略2020

    • Author(s)
      沖米田司
    • Organizer
      第41回日本臨床薬理学会学術総会
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      2020 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CFTR protein quality control mechanism and its application to CF drug discovery2020

    • Author(s)
      Tsukasa Okiyoneda
    • Organizer
      日本薬学会140年会
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      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] New insights in peripheral quality control of CFTR2019

    • Author(s)
      Tsukasa Okiyoneda
    • Organizer
      42st European Cystic Fibrosis Conference
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 嚢胞性線維症治療薬開発を目指した RFFL ユビキチンリガーゼ PPI 阻害剤の探索2019

    • Author(s)
      沖米田司、酒井了平、宗岡聡、永平亜佐子、冨森嘉晃、東桃子、宇仁田伸、小野裕司、福田亮介
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第14回年会
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      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] ミスフォールディングが誘発する嚢胞性線維症の理解2019

    • Author(s)
      沖米田司
    • Organizer
      第 92 回日本生化学大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CFTR 品質管理機構と嚢胞性線維症創薬への応用2019

    • Author(s)
      沖米田司
    • Organizer
      第14回日本臨床ストレス応答学会大会
    • Related Report
      2019 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 沖米田研究室

    • URL

      https://sci-tech.ksc.kwansei.ac.jp/~okiyoneda/okilab.html

    • Related Report
      2021 Annual Research Report 2020 Annual Research Report 2019 Annual Research Report

URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2023-01-30  

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