| Project/Area Number |
19H03696
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 54020:Connective tissue disease and allergy-related
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
Noguchi Emiko 筑波大学, 医学医療系, 教授 (40344882)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
尾崎 遼 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (10743346)
渋谷 彰 筑波大学, 医学医療系, 教授 (80216027)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2022)
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| Budget Amount *help |
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2019: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
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| Keywords | シングルセル / 花粉症 / 免疫療法 / 遺伝子発現 / アレルギー / シングルセルRNA-Seq / アレルギー疾患 / RNA-Seq / TCRシークエンス / bulk RNA-seq / single-cell RNA-seq / アレルゲン免疫療法 / RNA-seq |
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| Outline of Research at the Start |
近年可能となったシングルセルレベルの網羅的遺伝子発現解析(single-cell RNA-seq)により、ターゲットとなる分子について事前に情報がなくとも、どの遺伝子が、どの性質の細胞に発現しているのかについての情報を得られるとともに、今まで知られていない未知の細胞についても検出可能である。本研究ではアレルゲン免疫療法の免疫応答の変化をsingle cell RNA-seqとbulk RNA-seq解析により検出する。さらに、アレルゲン免疫療法前後のT細胞のTCRを決定すること、同じ細胞のRNA-seqを行うことにより、細胞の遺伝子発現プロファイルと特定のTCRとの関連、および治療応答性との関連を検討する。
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| Outline of Final Research Achievements |
Single-cell RNA-seq (scRNAseq) has made it possible to estimate cell types such as CD4-positive T cells, regulatory T cells, NK cells, and B cells, and to measure the comprehensive gene expression of individual cells without prior information on the target molecules. The present study was conducted to investigate the effect of cedar antigens on the gene expression of cedar cells. In this study, scRNAseq of peripheral blood mononuclear cells was performed on patients treated with sublingual immunotherapy against Japanese cedar pollen before and after the start of treatment, and cell types and gene expression related to treatment response were examined. In the comparison of pre- and post-treatment, we detected several genes whose expression levels were statistically significantly changed in response to treatment.
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| Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements |
アレルゲン免疫療法は根治が期待できる治療法として近年特に注目されている。本研究は治療応答にかかわる遺伝子やパスウェイを同定するためにscRNA-seqの手法を用いて解析を行った。本研究成果は、アレルゲン免疫療法がなぜ効果的であるかについての分子学的なメカニズム解明につながる可能性がある。
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