| Project/Area Number |
19H03848
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
椎葉 正史 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (20301096)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
笠松 厚志 千葉大学, 医学部附属病院, 講師 (60375730)
中嶋 大 千葉大学, 大学院医学研究院, 助教 (50431747)
丹沢 秀樹 千葉大学, 大学院医学研究院, 教授 (50236775)
小池 一幸 千葉大学, 医学部附属病院, 助教 (10618060)
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| Project Period (FY) |
2019-04-01 – 2022-03-31
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| Project Status |
Discontinued (Fiscal Year 2021)
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| Budget Amount *help |
¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2020: ¥5,720,000 (Direct Cost: ¥4,400,000、Indirect Cost: ¥1,320,000)
Fiscal Year 2019: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
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| Keywords | 口腔扁平上皮癌 / スーパーエンハンサー / ChIP-seq 法 / 組織特異性 / 疾患特異性 / 機能特異性 / H3K27ac / エピジェネティックな修飾 / スーパーエンハンサー(SE) / Chip-seq法 / H3K27 / miRNA / long non coding RNA |
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| Outline of Research at the Start |
スーパーエンハンサー（SE）は強力なエンハンサー領域であり、幹細胞をはじめ各組織の細胞系統を特徴付けるような遺伝子発現を制御する。癌に関して発生、進展・悪性化・治療抵抗性などに大きく関与していると考えられ、世界的にSEの検索・同定とその制御薬の開発競争が開始されたところである。本研究では、全ゲノムワイドな解析により、口腔扁平上皮癌に特異的なSE、癌の発生、進展・悪性化（増殖・浸潤・転移等）に特異的なSE、そのターゲットであるmiRNA、long non coding RNA、遺伝子等を検索・同定し、口腔扁平上皮癌特異的な発生メカニズムを検討すると共に、各SEを制御する薬剤や治療法を検討する。
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| Outline of Annual Research Achievements |
スーパーエンハンサー（SE）は非常に強力なエンハンサー領域であり、幹細胞をはじめ各組織の細胞系統を特徴付けるような遺伝子発現を制御する。従来のエンハンサーとは異なり、SE は格段に強力であるばかりでなく、組織特異性、疾患特異性、機能特異性などに関する複数の遺伝子発現制御を系統的に行う。癌に関しても発生、進展・悪性化・治療抵抗性などに大きく関与していると考えられている。本研究において、全ゲノムワイドな解析により、口腔扁平上皮という組織の扁平上皮癌という疾患に特異的なSE、癌の発生、進展・悪性化（増殖・浸潤・転移等）に特異的なSE、さらにそのターゲットであるnon coding RNA、遺伝子等を検索・同定し、口腔扁平上皮癌特異的な発生メカニズムを検討すると共に、各SE を制御する薬剤や治療法を検討する。
今年度までに、口腔癌に特異的なSE の構造的検索を行うために、正常口腔粘膜上皮(HNOKs)と７種類の口腔扁平上皮癌細胞株(HSC-2、HSC-3、HSC-3-M3、HSC-4、Sa3、SAS、SAS-H1)を分析対象として、クロマチン免疫沈降法(chromatin immunoprecipitation: ChIP) と次世代シークエンサーを組み合わせたChIP-seq法を行った。また、ChIP-seq 法で得た解析結果より口腔癌に共通するSE領域を同定した。本年度は、各SEに含まれる遺伝子群をピックアップし、過去当科で同定した増殖・転移・浸潤に関わる遺伝子・non coding RNAの解析データと照合した。さらに癌患者の検体を用いた遺伝子発現解析（RNA-seq）を組み合わせることにより口腔癌細胞株で同定したSEの中からさらに明確なターゲットを同定することを試みた。2021年10月15日、申請者の異動のため当研究を廃止とした。
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| Research Progress Status |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
令和3年度が最終年度であるため、記入しない。
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