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Transfer learning from mathematical models and its applications in biomedical engineering

Research Project

Project/Area Number 19H04177
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Review Section Basic Section 61030:Intelligent informatics-related
Research InstitutionNagasaki University

Principal Investigator

Sakai Tomoya  長崎大学, 情報データ科学部, 准教授 (30345003)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 高田 寛之  長崎大学, 情報データ科学部, 助教 (10297616)
東嶋 美佐子  西九州大学, リハビリテーション学部, 教授 (40279005)
尾長谷 靖  長崎大学, 医歯薬学総合研究科(医学系), 准教授 (40399762)
松永 昭一  長崎大学, 情報データ科学部, 客員研究員 (90380815)
宮本 潤哉  長崎大学, 病院(医学系), 助教 (20789565)
Project Period (FY) 2019-04-01 – 2023-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2022)
Budget Amount *help
¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,900,000 (Direct Cost: ¥3,000,000、Indirect Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2020: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2019: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Keywords転移学習 / データ同化 / スパースモデリング / 深層展開 / 知識獲得
Outline of Research at the Start

数理モデルは、科学的方法で培われてきた専門分野の知識や経験則を数学的に記述している。数理モデルに由来する知識と説明能力を備えた人工知能を実現するため、数理モデルでデータを説明するデータ同化の仕組みからディープニューラルネット(DNN)を構築する。更にこのDNNがデータから学習することで、必ずしも大規模でないデータからの深層学習を達成する。また、この医工学応用(ゲノム解析、生体信号解析、医用画像処理)にも実践的に取り組む。

Outline of Final Research Achievements

This research project focused on combining mathematical modeling and deep learning, demonstrating the effectiveness of unsupervised learning with limited data by transferring domain knowledge described as mathematical models. A set of frameworks for incorporating mathematical modeling into deep learning was organized in terms of forward and inverse problems and Bayesian theory.
In the field of biomedical engineering, the potential of deep learning utilizing medical knowledge was shown through unsupervised detection of abnormal sounds in pulmonary auscultation, automation of oral cytology, vascular enhancement in X-ray imaging, and repetitive saliva swallowing test using time-series depth images.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

ディープニューラルネットと数理モデルの統合を可能にして、合理性の高い人工知能の実現を目指す新たなアプローチを示した点に学術的な意義が大きい。スパース解法の深層展開に関する研究では、深層学習の応用範囲を拡大し、知識獲得の可能性を示した。医工学応用では、少数のデータからも医学的に合理性の高い情報を抽出可能にした。非侵襲的な肺聴診と嚥下検査は、疾患や障害の早期発見に貢献する。

Report

(5 results)
  • 2022 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • 2019 Annual Research Report
  • Research Products

    (49 results)

All 2023 2022 2021 2020 2019

All Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 3 results) Presentation (43 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 3 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Unsupervised deep learning for online foreground segmentation exploiting low-rank and sparse priors2023

    • Author(s)
      Keita Takeda, Kohei Fujiwara, Tomoya Sakai
    • Journal Title

      International Conference on Digital Image Computing: Techniques and Applications (DICTA)

      Volume: 1 Pages: 1-7

    • DOI

      10.1109/dicta56598.2022.10034581

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      Takumi Onomichi, Tomoya Sakai, Yasushi Obase
    • Journal Title

      International Journal of Signal Processing Systems

      Volume: 11(1) Issue: 1 Pages: 1-6

    • DOI

      10.18178/ijsps.11.1.1-6

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    • Author(s)
      Yukoo Hirano,Susiana Nugraha,Hiroyasu Siozu,Misako Higashijima,TriBudiW Rahardjo
    • Journal Title

      Human Resources for Health

      Volume: 19 Issue: 1 Pages: 71-71

    • DOI

      10.1186/s12960-021-00614-y

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    • Author(s)
      Fukumitsu T, Obase Y, Ishimatsu Y, Nakashima S, Ishimoto H, Sakamoto N, Nishitsuji K, Shiwa S, Sakai T, Miyahara S, Ashizawa K, Mukae H, Kozu R
    • Journal Title

      BMC Pulm Med

      Volume: 19 Issue: 1 Pages: 153-153

    • DOI

      10.1186/s12890-019-0916-5

    • NAID

      120006988428

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      Morio Kawabe, Yuri Kokura, Takashi Ohnishi, Kazuya Nakano, Hideyuki Kato, Yoshihiko Ooka, Tomoya Sakai, Hideaki Haneishi
    • Journal Title

      Pattern Recognition

      Volume: 1180 Pages: 141-149

    • DOI

      10.1007/978-981-15-3651-9_13

    • ISBN
      9789811536502, 9789811536519
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      Keita Takeda, Kohei Fujiwara, Tomoya Sakai
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      松尾 和季, 見立 英史, 酒井 智弥
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    • Total Pages
      1384
    • Publisher
      文光堂
    • ISBN
      9784830645891
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URL: 

Published: 2019-04-18   Modified: 2024-01-30  

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